Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_DYM_0007900

Sequence Length

697 nt

GC Content

0.4319

CAGGACUCUGGACUGUCUUCACACUAGGUGGUGUGGGCAGCAAAGCGGCUGCCUCUCCAGAGCUUUCUUCCCCUCUGGCCAACCAGAGUCUCCUGCUUCUGCUGGUGUUGGCCAAUCUGACAGAUGCCUCAGAUGCGCCAAACCCCUACAGACAAGCCAUUAUGUCCUUCAAGAACACACAAGAUAGCAGUCCUUUCCCCUCAUCAAUUCCACAUGCCUUCCAGAUCAACUUUAAUAGUUUGUACACAGCUCUUUGUGAACAGCAGACAUCUGAUCAAGCAACUCUCCUCUUGUAUACCUUGCUCCAUCAAAAUAGUAAUAUUAGAACAUACAUGUUGGCUCGCACAGAUAUGGAAAAUCUUGUUUUACCAAUUCUUGAGAUUCUGUAUCAUGUUGAAGAAAGGAAUUCACACCAUGUGUAUAUGGCCCUUAUAAUAUUGUUGAUCCUUACGGAAGAUGAUGGCUUCAACAGAUCCAUUCAUGAAGUGAUACUAAAAAAUAUUACUUGGUAUUCAGAACGAGUUUUAACUGAAAUCUCCUUGGGGAGUCUCCUGAUCCUGGUGGUAAUAAGAACCAUUCAAUACAACAUGACUAGGACACGAGACAAGUACCUUCACACAAAUUGUUUGGCAGCUUUAGCAAAUAUGUCGGCACAGUUUCGUUCUCUCCAUCAGUAUGCUGCCCAGAGGAUCAUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-164.8 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -181.41

Frequency: 0.0000

Diversity: 192.67

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((((((.......((((((....))))))((((((......))))))..)))))))..........((((((....))))))..)))))((((((..((.((((((..((((((........))))))..))).))).))..))))...((.(((.(((.............))).))).)).......(((((.................(((((.(((((((..((...((((((.(((((....)))))....))))))...((((..(((((.................)))))..)))).((((....))))..((((....))))((((.((((((((((((((..((..(...........)..))..))))))))).(((.(((........))))))...)))))....)))).......))..))))))).....)))))(((((((..((....)).))).)))).((((((((........))))))))(((.(((((............)))))))).....)))))(((((.((.(((((((.((......................)).))))))))).)))))..............(((((((((((((.............)))))).))))))).(((((((....(((....)))...)))))))....))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((((((,.......((((((....))))))((((((......))))))..,||||||..........||||||....))))))..}))))((((((..((.(((((({.((((((........))))))}.)))))}).))..)))).,{((((((((,{,{.....|..,,,,,,.{,..{,,,{{{{{{{..............,,,||,,.||,.(({{{{{..,,..,((((((.((((,....,)))).,,,}}}}}}...((((..(((((..........,......)))))..)))).,,,{....}}}}..,,,...,,})}}|}|{,{,{{((((((((((.,((,,{..,....,...,.,))},))))))))).))}}}|,}}}}}},.,,},,,,,.})))}.,}}))}........,,.,}}||||||||..||}},}||||||}}|,....((,{{..}}{|.((((((((........)))))))),)},{{{((,,,{{,......}}}}}.,,{{,.,,||}|(((((.((.(((((((,((.......,,,..,,........}).))))))))).)))))..{,......,.,.,{(((((((((((,,....,,.,,..)))))).))))))),))}}},,,}},|||....)),}}.,))))))),..))