Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_DYM_0010700

Sequence Length

488 nt

GC Content

0.4426

CAGGACUCUGGACUGUCUUCACACUAGGUGGUGUGGGCAGCAAAGCGGCUGCCUCUCCAGAGCUUUCUUCCCCUCUGGCCAACCAGAGUCUCCUGCUUCUGCUGGUGUUGGCCAAUCUGACAGAUGCCUCAGAUGCGCCAAACCCCUACAGACAAGCCAUUAUGUCCUUCAAGAACACACAAGAUAGCAGUCCUUUCCCCUCAUCAAUUCCACAUGCCUUCCAGAUCAACUUUAAUAGUUUGUACACAGCUCUUUGUGAACAGCAGACAUCUGAUCAAGCAACUCUCCUCUUGUAUACCUUGCUCCAUCAAAAUAGUAAUAUUAGAACAUACAUGUUGGCUCGCACAGAUAUGGAAAAUCUUGUUUUACCAAUUCUUGAGAUUCUGUAUCAUGUUGAAGAAAGGAAUUCACACCAUGUGUAUAUGGCCCUUAUAAUAUUGUUGAUCCUUACGGAAGAUGAUGGCUUCAACAGAUCCAUUCAUGAAGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-114 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -125.7

Frequency: 0.0000

Diversity: 115.22

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((((((.......((((((....))))))((((((......))))))..)))))))..........((((((....))))))..)))))(.((((..((.((((((..((((((........))))))..))).))).))..)))).((((((((((.(((...............((..(((.........................)))..))..(((((((..((...((((((.(((((....)))))....))))))...((((..(((((.................)))))..)))).((((....))))..((((....))))((((.((((((((((((((..((..(...........)..))..))))))))).(((.(((........))))))...)))))....)))).......))..))))))).....)))..)))))))))).....((.....)).......)

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((((((,.......((((((....))))))((((((......))))))..,||||||..........||||||....))))))..}))))(.((((..((.(((((({.((((((........))))))}.)))))}).))..)))).{(((((((((.({(....,{..,......{{..{,{,{,,,,,,..............,,.||},,||,.(((((((..,,..,((((((.((((,....,)))).,,,}}}}}}...((((..(((((..........,......)))))..)))).,,,{....}}}}..,,,,...,}))}|||{,{,({((((((((((..((,,{..,........,.,))},))))))))).}}}|||,,,,,,,..}}}},,,,,|)))}.}},)),.....,..}}.,))))))),,...)))},)))))))))|,....((.....)).}}....)