Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_DYM_0013400

Sequence Length

753 nt

GC Content

0.4343

UUGAAAACAAUCCUCGAACAGGAAAUCUUGGUGCACUAAUUAAGGUCUUCCUUUCUAGAACCAAAGAACUAAAACUUUCAGCAGAAUGUCAGAACCACAUCUUCAUUUGGCAGACACACAAUGCUUUGUUUAUUAUUUGCUGUUUGCUGAAAGUGUUCAUCUGUCAGAUGUCAGAGGAGGAAUUACAACUUCAUUUUACUUAUGAAGAAAAAUCUCCUGGCAAUUACAGUUCUGACUCAGAAGAUCUUUUGGAAGAAUUGCUGUGCUGUUUGAUGCAGUUGAUCACUGAUAUUCCACUCUUAGAUAUUACAUAUGAAAUAUCAGUAGAAGCUAUAUCAACAAUGGUUGUUUUCCUUUCCUGCCAACUCUUCCACAAAGAAGUUUUGCGACAGAGCAUCAGCCACAAGUAUUUGAUGCGAGGUCCAUGUCUUCCAUACACCAGCAAACUUGUGAAGACCUUAUUAUAUAACUUUAUCAGACAAGAAAAGCCACCUCCUCCAGGGGCCCAUGUUUUCCCUCAGCAGUCGGAUGGGGGAGGACUGCUUUAUGGACUUGCAUCAGGAGUAGCAACAGGACUCUGGACUGUCUUCACACUAGGUGGUGUGGGCAGCAAAGCGGCUGCCUCUCCAGAGCUUUCUUCCCCUCUGGCCAACCAGAGUCUCCUGCUUCUGCUGGUGUUGGCCAAUCUGACAGAUGCCUCAGAUGCGCCAAACCCCUACAGACAAGCCAUUAUGUCCUUCAAGAACACACAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-211 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -225.4

Frequency: 0.0000

Diversity: 189.13

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((((((((.(((.(((((((((((((......)))))))).)))))))).)).......((((....(((((((((((((((..(((......))).)))))((((((...((((....))))......))))))...))))))))))))))..(((.(....).)))((((((........((((((.......)))))).....))))))((((....(((((((...((((((....)))))).)))))))...))))..((((((.((((..(.(((((((((.((.................)).))))))))))..)))).))))))....)))))))))).....(((((((..((((......))))..))).).))).(((((((..........))))))).((((((((((((((((..............)).))))))...........................(((((..(((((((((..(((...((........))...)))...)))))))))...)))))))))))))(((((((.((.((((...(((((((((........((((((....))))))((((((......))))))...((((((..........))))))....)))))))))..)))).)).)))))))((((..((((((........))))))..))))..........((((........)))).......))(......)

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((({.....((((.....||||.,,,((((({{{,,.,,,|||||.|,))}}||,}}.......||{,....(((((((((((({{(..(((......}}}.}}},|((((({...{{({....})))......)))))}.})))))))))))}}}|((((((((({{,.|||{(({(({,......((((((.......)))))).....,|||||(((.......((((((.(.(((((..((((((((((((.{{({...||(({{(((((.((((..(,(((((((((.{{....,,...........}).))))))))).,,)))).))))))}}.,{||.,............)}))}.))))))).)))))..))))).).))))))....|}},...,...{{((((({((((((((((((((((..............)),)))))),,,.,...,......,,}..,..,,).{{(((..(((((((((,,{{{...{(,,..,,,,|}...}}}...)))))))))...))))})))))))))))))}|,{{{{{,..,,(({((((((,.......((((((....))))))((((((......))))))..,||||||......,,,,))))||,,,,||||||}},.,})}},))})}||}}}||||}.}||||}}}}}},..,,)),))}))))).........((((........)))).})))}..........,