Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ELP3_0002400

Sequence Length

513 nt

GC Content

0.4366

CCAACCUCCAUGAGAGCUAUCCGUGCCAGAUAUGACCCUUUCCUACAGACAAGACACCGAAUAGAACAGUUAAAACAACUUGGUCAUAGUGUGGAUAAAGUGGAGUUUAUUGUGAUGGGUGGAACGUUUAUGGCCCUUCCAGAAGAAUACAGAGAUUAUUUUAUUCGAAAUUUACAUGAUGCCUUAUCAGGACAUACUUCCAACAAUAUUUACGAGGCAGUCAAGUAUUCUGAGAGAAGCCUCACAAAGUGUAUUGGAAUUACUAUUGAAACCAGACCAGAUUACUGCAUGAAGCGACAUUUAAGUGACAUGUUGACCUAUGGCUGCACAAGGCUGGAGAUUGGGGUGCAGAGUGUUUAUGAAGAUGUGGCUAGAGACACCAACAGGGGCCACACUGUGAAGGCAGUGUGUGAGUCAUUUCACCUGGCCAAAGAUUCCGGUUUUAAAGUGGUGGCCCAUAUGAUGCCUGACCUGCCAAACGUGGGACUAGAAAGAGACAUUGAACAGUUCACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-114.1 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -125.32

Frequency: 0.0000

Diversity: 120.58

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((...((((((......(((((((((....(((((((..........(((..................)))..........))))))))))))))))..))))))............))(((((((((((..(((.(((.((..(((((.(((.....))))))))............((((((....))).)))...(((((..((((((..(((((..((.((....))..))...)))))...)))))).)))))((((((.((((((((.((.(((....))).....(((.((((((..(((((((.(((((((....((.((......)).))....)))).))).))).))))..)))))).))).......((....))(((((((((((....)))))))(((((....)))))..))))......)).))))))))))))))(((.........)))...(((((.....))))).)).))).).).)..))))).)))).))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((...{{((((,,,..,((({{{,{({{.,(((((((,,,,,.....||,..,..........,...,|||.....,,,,.)))))))}),)))}}}..))))}}}}}.,.}.}...))(((((((((((,{{{,{(({.{{..(((((.{{{.....})})))))..........,{((({{{..,,)||.}}}...{||{,..,{{{((,,({(((,,(({.(,,,,,||,|,...}})))...,}}}||,|}||}{(((((.((((((((.({.(((....}}}.....(((.((((((..(((((((.{((((((....((.((......)).))....)))).)),.)))))}))..)))))).))).......((....))(((((((((((....)))))))(((((....)))))..))))......}).))))))))))))))|||||||,,,,})},}}},,|)}}...,))))).}}.),}}).).),.))))).)))).))