Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ERBB2IP_0006600

Sequence Length

590 nt

GC Content

0.3729

AAUGUUGGCUCAAUUAAGAAACAUCAGGGAGAUAAAUUCAACCCAGUGUGUCUAAAAAUGACUACAAAACGAAGUUUGUUUGUGCGGUUGGUACCAUGUCGCUGUCUACGAGGGGAAGAGGAGACUGUCACUACUCUUGAUUAUUCUCAUUGCAGCUUAGAACAAGUUCCGAAAGAGAUUUUUACUUUUGAAAAAACCUUGGAGGAACUCUAUUUAGAUGCUAAUCAGAUUGAAGAGCUUCCAAAGCAACUUUUUAACUGUCAGUCUUUACACAAACUGAGUUUGCCAGACAAUGAUUUAACAACGUUACCAGCAUCCAUUGCAAACCUUAUUAAUCUCAGGGAACUGGAUGUCAGCAAGAAUGGAAUACAGGAGUUUCCAGAAAAUAUAAAAAAUUGUAAAGUUUUGACAAUUGUGGAGGCCAGUGUAAACCCUAUUUCCAAGCUCCCUGAUGGAUUUUCUCAGCUGUUAAACCUAACCCAGUUGUAUCUGAAUGAUGCUUUUCUUGAGUUCUUGCCAGCAAAUUUUGGCAGAUUAACUAAACUCCAAAUAUUAGAGCUUAGAGAAAACCAGUUAAAAAUGUUGCCUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-122.4 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -137.4

Frequency: 0.0000

Diversity: 189.29

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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