Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ERBB2IP_0016700
Sequence Length
1415 nt
GC Content
0.3654
UUUAUUGGUAGUUUGAAACAGCUCACAUAUUUGGAUGUUUCUAAAAAUAAUAUUGAAAUGGUUGAAGAAGGAAUUUCAACAUGUGAAAACCUUCAAGACCUCCUAUUAUCAAGCAAUUCACUUCAGCAGCUUCCUGAGACUAUUGGUUCGUUGAAGAAUAUAACAACGCUUAAAAUAGAUGAAAACCAGUUAAUGUAUCUGCCAGACUCUAUAGGAGGGUUAAUAUCAGUAGAAGAACUGGAUUGUAGUUUCAAUGAAGUUGAAGCUUUGCCUUCAUCUAUUGGGCAGCUUACUAACUUAAGAACUUUUGCUGCUGAUCAUAAUUACUUACAGCAGUUGCCCCCAGAGAUUGGAAGCUGGAAAAAUAUAACUGUGCUGUUUCUCCAUUCCAAUAAACUUGAGACACUUCCAGAGGAAAUGGGUGAUAUGCAAAAAUUAAAAGUCAUUAAUUUAAGUGAUAAUAGAUUAAAGAAUUUACCCUUUAGCUUUACAAAGCUACAGCAAUUGACAGCUAUGUGGCUCUCAGAUAAUCAGUCCAAACCCCUGAUACCUCUUCAAAAAGAAACUGAUUCAGAGACCCAGAAAAUGGUGCUUACCAACUACAUGUUCCCUCAACAGCCAAGGACUGAGGAUGUUAUGUUUAUAUCAGAUAAUGAAAGUUUUAACCCUUCAUUGUGGGAGGAACAGAGGAAACAGCGGGCUCAAGUUGCAUUUGAAUGUGAUGAAGACAAAGAUGAAAGGGAGGCACCUCCCAGGGAGGGAAAUUUAAAAAGAUAUCCAACACCAUACCCAGAUGAGCUUAAGAAUAUGGUCAAAACUGUUCAAACCAUUGUACAUAGAUUAAAAGAUGAAGAGACCAAUGAAGACUCAGGAAGAGAUUUGAAACCACAUGAAGAUCAACAAGAUAUAAAUAAAGAUGUGGGUGUGAAGACCUCAGAAAGUACUACUACAGUAAAAAGCAAAGUUGAUGAAAGAGAAAAAUAUAUGAUAGGAAACUCUGUACAGAAGAUCAGUGAACCUGAAGCUGAGAUUAGUCCUGGGAGUUUACCAGUGACUGCAAAUAUGAAAGCCUCUGAGAACUUGAAGCAUAUUGUUAACCAUGAUGAUGUUUUUGAGGAAUCUGAAGAACUUUCUUCUGAUGAAGAGAUGAAAAUGGCGGAGAUGCGACCACCAUUAAUUGAAACCUCUAUUAACCAGCCAAAAGUCGUAGCACUUAGUAAUAACAAAAAAGAUGAUACAAAGGAAACAGAUUCUUUAUCAGAUGAAGUUACACACAAUAGCAAUCAGAAUAACAGCAAUUGUUCUUCUCCAUCUCGGAUGUCUGAUUCAGUUUCUCUUAAUACUGAUAGUAGUCAAGACACCUCACUCUGCUCUCCAGUGAAACAAACUCAUAUUGAUAUUAAUUCCAAAAUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-303.7 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -333.78
Frequency: 0.0000
Diversity: 366.95
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((..((((..((((.......((((.((((((.........)))))).))))((((...(((((..(((((.....))))).)))))..))))(((((((((.......(((.(((((.((((((((((((.((((((((((((((..........))))).....((((((((((..((((((..(.((.(((...((((((.....)))))).....))))).)..)))))).....(((((((((...))))))))).....)))))))))).((((((....................))))))(((((((.((.((((.(((...(((((((....(((((((..((((.(((((.........))))).))))))))))).((((((((....((((...))))..((((((........((((....((((((......))))))....)))).......))))))..((((((....)))))).......(((.((((....)))).)))(((.....)))....((((((...(((((.......(((.....))).(((..(((.....)))..)))...........(((((((((.(((..((((..(((((...((((..((......))..))))...)))))..))))..))))))).))))))))))...))).))))))))))).(((((...(((.......))).)))))...))).)))).((((...))))(((.((((....)))).))).....(((......))).)))))))))))))))).....(((.(((....))).)))..................)))))))..)).))))))).(((.(((....((((((.........................))))))......))).)))......((((.....))))........))))).)).))).)))......)))))))))....)))).))))..)))))))))(.(((...((.((.(((((((((.......)))).)))))..(((((((.....(((((((....((((.((((((((....((..((((((((((.((....)).)))))).(((.(((((((((((......(((((.((........)).)))))............................(((((..(.(((.(((.((.(......).)).))).))))..)).)))))))))))))).)))((((.......)))).))))..))...))))).))).))))....)))))))(((((((((((((..........))))).....))).)))))..(((((.........))))).......))))))).........))))...))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((({,,((((..{{{({{..,{{(((({{{,{({||.......,,,,,},}}}}((((...(((((..(((((.....))))).)))))..))))(((((((((.......(((.(((((.((((((((((((.((((((((((((((..........))))},,...,{{{{{{{{{..((((((..(.((.(((...((((((.....)))))).....))))).)..))))))...,.(((((((((...)))))))))..,.,|||||||}}|((((((({{.,,....|,,,.......{((((((,..........,,,)))))))|||||{{.,.,,||||||,}||{,.,,,{,......,,.|||||,|||||||}|||.((((((((....{(((...)))}..((((((..,.....((((....((((((......))))))....)))).......))))))..((((({....}))))).,,....{((.{(({....)))).))}{{,.....|},....((((((.,.(((({,,.....||,.{{{..||.{{|,.{||.....|||,.,,,,,,,......{((((((((,,(((..((((..(((((...((((,,((.....,)),.})))...)))))..))))..))))))).)))))))))).,.))).))))))))))).{|||,},,||{},.,.,.})}.,,,,,...(((((....))))).{{|..(((.((((....)))).)))..,.}}....,|,,,|},,|||||,,,|||||}||....{{{.{,.....}})..}},,..,,,..,}}}}}},.))))))),.,}.))))))).{{(.(((....((((((....{{,.....,,,..........)))))).,.,.,}},.)))......(({{.....}}}}........})))).))}},).))}......)))))))))...,||}}.}}}}..}|||||,,,..{{{.}}||},..(((((((((.......)))).))))}},||||||..,}}.(((((((....((((.({((((((....,{,,({{{((({((,{{....}},}}}|||{(((.(((((((((((,.,,..,{(((.((........)).)))}|.,,.{,....}}.,}}.....,,,....{{{{{..{.(((.(((.,,.{......}.}}.))).})),...}.,,)))))))))))).)))}||.....,,,,}}}.})))..,,...}))})}})).))))....))))))){((((((((((((.,........))))).....))),,)))}..{{{{{,,,,....,)))))......,}}},}||{{,.........,..,))))
Back