Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FAM120A_0003300
Sequence Length
434 nt
GC Content
0.4516
UGCCCAUGCCCUAAAACUGAGCCGGAACGGGAAAAGUCUCACCACAAGCCAAUAUCUGAUGCAUGAAGUUGCCAAGCAACUGGACCUGAAUCCAAAUCGUUUUCCUAUUUUUGCUGCUCUCUUAGGAAAUCACAUUCUGCCUGAUGAAGAUCUGGCUUCCUUUCACUGGAGUUUACUUGGUCCAGAACAUCCACUAGCCUCACUAAAGGUCCGGGCCCACCAGCUGGUCUUGCCACCUUGCGACGUAGUGAUCAAAGCCGUUGCUGACUAUGUACGCAACAUUCAGGACACCUCUGACUUGGAUGCCAUAGCUAAAGAUGUUUUCCAGCAUUCACAGUCUAGAACAGAUGACAAAGUUAUUCGAUUUAAGAGAGCAAUUGGAUAUUAUUCAGCGACUAGUAAGCCUAUGUCAUUUCAUCCACCACAUUACUUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-95 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -104.11
Frequency: 0.0000
Diversity: 106.19
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((....)).((((.....(((.((((.(((((((((.(((...............))).))....((((((...))))))(((......)))......))))))).)))).)))(((((((((...((((.......(((.(((....))).))).........(((((.(......).)))))...........((((......))))..((.....)).....((((((.....((((((((((((.(.(((.....))).).))))))).)))))....))))))...((((((((((((((...(((.......))).....))))))).)))).)))...((((((...)))))).)))))))))))))..((((((...)))))).((((((.....))).)))...................))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{({....||.,,,....{{,((.{(,,.((((,,..,,}}.,,.,..||,,.....,|.,|}|||,((((((...)))))|(({...,..|}},.....,,,,,},.,,,,.}}{(((((((((({{{.......,,.(((.(((....))).))).,,,.....(((((.(......|,}}}}}.....,,...,(({{......})))..||||,..,,.,.,}((((((.....((((((((((((.(.(((.....))).).))))))).)))))....))))))...((((((((((((((...(((.......))).....))))))).)))).)))...((((((...)))))).}.,})))))))))}.,|||||...,}}}}}.|{({{{,....,}}.)}}.,..,}}.,,........,})))
Back