Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FNDC3B_0017600
Sequence Length
2287 nt
GC Content
0.4945
AAAUUAUACCAUUUUAUGGAAUGUCAACCUACAUCACCCGAGAAGACCAGUACAGCAAGCCUCCGCACAAAAAACUGAAAGACCGCCAGAUCGAUCGCCAGAACCGCCUCAACAGCCCUCCUUCUUCUAUCUACAAAAGCAGCUGCACAACAGUAUACAAUGGCUAUGGGAAGGGCCAUAGUGGUGGAAGUGGCGGAGGCGGCAGCGGUAGUGGUCCCGGAAUUAAGAAAACAGAGCGACGAGCAAGAAGCAGCCCAAAGUCGAAUGAUUCAGACUUGCAAGAAUAUGAGUUGGAAGUAAAGAGGGUGCAAGACAUUCUUUCGGGAAUAGAGAAACCACAGGUUUCUAAUAUUCAGGCAAGAGCAGUUGUGUUGUCCUGGGCUCCCCCUGUUGGACUUUCCUGUGGACCCCACAGUGGUCUUUCCUUCCCCUACAGUUACGAGGUGGCCUUAUCAGACAAAGGACGAGAUGGAAAAUACAAGAUAAUUUACAGUGGAGAAGAAUUAGAAUGUAACCUGAAAGAUCUUAGACCAGCAACAGAUUAUCAUGUGAGGGUGUAUGCCAUGUACAAUUCCGUAAAGGGAUCCUGCUCCGAGCCUGUUAGCUUCACCACCCACAGCUGUGCACCCGAGUGUCCUUUCCCCCCUAAGCUGGCACAUAGGAGCAAAAGUUCACUAACCCUGCAGUGGAAGGCACCAAUUGACAACGGUUCAAAAAUCACCAACUACCUUUUAGAGUGGGAUGAGGGAAAAAGAAAUAGUGGUUUCAGACAGUGCUUCUUCGGGAGCCAGAAGCACUGCAAGUUGACAAAGCUUUGUCCGGCAAUGGGGUACACAUUCAGGCUGGCCGCUCGAAACGACAUUGGUACCAGUGGUUAUAGCCAAGAGGUGGUGUGCUACACAUUAGGAAAUAUCCCUCAGAUGCCUUCUGCACCAAGGCUGGUUCGAGCUGGCAUCACAUGGGUCACGUUGCAGUGGAGUAAGCCAGAAGGCUGUUCACCCGAGGAAGUGAUCACCUACACCUUGGAAAUUCAGGAGGAUGAAAAUGAUAACCUUUUCCACCCAAAAUACACUGGAGAGGAUUUAACCUGUACUGUGAAAAAUCUCAAAAGAAGCACACAGUAUAAAUUCAGGCUGACUGCUUCUAAUACGGAAGGAAAAAGCUGUCCAAGCGAAGUUCUUGUUUGUACGACGAGUCCUGACAGGCCUGGACCUCCUACCAGACCGCUUGUCAAAGGCCCAGUUACAUCUCAUGGCUUUAGUGUCAAAUGGGAUCCCCCUAAGGACAAUGGUGGUUCAGAAAUCCUCAAGUACUUGCUAGAGAUUACUGAUGGAAAUUCUGAAGCGAAUCAGUGGGAAGUGGCCUACAGUGGGUCGGCUACCGAAUACACCUUCACCCACUUGAAACCAGGCACUUUGUACAAACUCCGAGCAUGCUGCAUCAGUACCGGCGGACACAGCCAGUGUUCUGAAAGUCUCCCUGUUCGCACACUAAGCAUUGCACCAGGUCAAUGUCGACCACCGAGGGUUUUGGGUAGACCAAAGCACAAAGAAGUCCACUUAGAGUGGGAUGUUCCUGCAUCGGAAAGUGGCUGUGAGGUCUCAGAGUACAGCGUGGAGAUGACGGAGCCCGAAGACGUAGCCUCGGAAGUGUACCAUGGCCCAGAGCUGGAGUGCACCGUCGGCAACCUGCUUCCUGGAACCGUGUAUCGCUUCCGGGUGAGGGCUCUGAAUGAUGGAGGGUAUGGUCCCUAUUCUGAUGUCUCAGAAAUUACCACUGCUGCAGGGCCUCCUGGACAAUGCAAAGCACCUUGUAUUUCUUGUACACCUGAUGGAUGUGUCUUAGUGGGUUGGGAGAGUCCUGAUAGUUCUGGUGCUGACAUCUCAGAGUACAGGUUGGAAUGGGGAGAAGAUGAAGAAUCCUUAGAACUCAUUUAUCAUGGGACAGACACCCGUUUUGAAAUAAGAGACCUGUUGCCUGCUGCACAGUAUUGCUGUAGACUACAGGCCUUCAAUCAAGCAGGGGCAGGGCCGUACAGUGAACUUGUCCUUUGCCAGACGCCAGCGUCUGCCCCUGACCCCGUCUCCACUCUCUGUGUCCUGGAGGAGGAGCCCCUUGAUGCCUACCCUGAUUCACCUUCUGCGUGCCUUGUACUGAACUGGGAAGAGCCGUGCAAUAACGGAUCUGAAAUCCUUGCUUACACCAUUGAUCUAGGAGACACUAGCAUUACCGUGGGCAACACCACCAUGCAUGUUAUGAAAGAUCUCCUUCCAGAAACCACCUACCG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-706.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -750.57
Frequency: 0.0000
Diversity: 643.33
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......((((((......((((((............(((.(..(((((.(((.((..((((((((((......(((...((.((......)).))..)))..(((((......((((((((....((((...........((((.....)))).....))))....))).)))))......)))))..)).))))))))....)).))).))))))))).............(((((.(.(((..(((..((((((.((((....))))...((((.(((.........))).))))......((.((((.((((((((.(..(((((.(((((((...)))))))..)))))..).)))))....))).)))))))))))).((((((((((((..((((((((...)))))).))..((((((((.(((((..(((.(((((((((((........)))).............((((.((((((((....(((..((((.((((........))))....))))...))).....)))))))).)))).((((((((((...(((..(((((.....)))))..)))...((((......))))...........)).))))))))..(((.((((((........((((.((..(((((((....)))).)))....)))))))))))))))...........(((.........)))..))))))).))).)))))..))))))))..(((((....)))))...((((((((((..((...)))))))))))).(((((.....))))).))))))))..))))......)))..))).).))))).....))))))......))))))..........((((((((((...)))....(((....)))((((((((((..(((.((((....)))).).))..))))))...))))........((((((.(((((((((((((.((.....((((((..(((......))).))))))....((((((((.............(((((((((........((((.((((((.....((((((((((.(((...........(((((((..((((..........))))..)))))))....(((((((((...(((.....)))....)))))((((((((((..(((((((((((((((((........))))...))))))))((((((.((......))...))))))..((((....(((....)))....)))).(((((.(((((((.((((((.((((((....)))..)))))).)))..))))))).)...((((((((..((((((.((.....)).)))))).(((......))).))))).))).)))))).))))))))))))))))).(((...))).((((((((((.((((((.....))))))....(.((((((....(.(.(((((((((((.((.(((((...(.(((.....))).)(((((((.....))))))).......((.((((((.((((((((...)))))).))...))))))))..(((((((.......((((((((.(((..((((((((.........(((.((((((((...(((((.(((((((.((..(((.......))).)).)))..))))..)))))...)))))))))))..))))))))........((((......)))).((((((....))))))))).)))).))))..)))))))..(((.(((((((......)))))))))).....))))).)).).))).)))))))))..)))))).)..........))))))))))....))).))))))))))(((((((((....((((((((.((....))..)).))))))(((((.......)))))(((((...(((.(.(((((.(.((((.(((......))).)))).).)))))))))...)))))(((((((((((((((...(((((.......)))))...)))...)).)))))))))).)))))).))).))))))))))..)))))))))............)))..)))))..))))))))).((((...))))......(((((((.((((......)))).)))....)))).)))))).)))))).(((((((((((.((((((...(((((.........))))).)))))))).....))))))...))).)))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
........{{{{,,.,|||.{(((......}}}}...|{|.|..|{,{{.{{,.((..((((((((,{......{{(...((.({......)}.)),.||}..(((((.{....((((((((....((((...........((((.....)))).....})))....)))}}))))....}.)))))..,)))))))))).}}.,|{|||{||||,,|||{....,,,...,{{.{,,..(((((((......((((((((({{,...,)}.)))))(({{(((..((((((((..{{,..{((((,({{{.{|||||||,{..(((((.(((((((...)))))))..))))),{|,||}||,,..}}),))}}}},(((((((.(((.(.((((....(({,(((((.((((((.(.((((((.....(({.(((((.(((((((((((.........|((((,,{.{{,......,,,(({..((({{{(((((((((.,(((,.......{{({{,...,,,,...,,.(((((.{{{,.|((((((({(({(({(,,...|||,.{((((.....))))},,|||(((,{{{{(({{(((..((((((({.,.{{{(((.((({{(((((,.,,,{{(({{...(((((.{{,(((((((....)))).))).{(,{{({{(((..,,..}}..}||.,,..}}||,....,{{.{{,.((.|,,..,,},))))),},,}})},...(((((....))))).,.((((((((((..({...)}))))))))))}{{(((.....}))})))))})))...}))),.,)))}}}.{((((((((((.{..,(.....,,)}.,}))))))},))))}..}.))))))).)))),),,...|||.,,,}))))}.{{{(((.,{{{.{{{|..,.}))),)})),.))))))}))))))))..))))).(((({...((((....)))).}})}}((((((..(((......))).))))))...}}}}}}.,.,},....,},,...|}}})}||,{{,........)))|}|||......})),||||}||},..}}}}....(((((((..((((..........))))..)))))))..,,{{{{{((({...(((.....)))....)))))|}}}}||||,,..|||||(((((((((((........))))...))))))),||})||..,....}}))).})))).)}}((((....(((....)))....)))).,(((({(((((((.(((((,{((((((....)))..)))))).)))..)))))),{|{{{,{(({((({((({{(({.{((((((({((...)}},..........})))))),}.....))))))))),}}}..,,{{,({(({{((((..{{|({,,.,|},||..|}}}..)))))),}}...,,,}}}})))))}.......(((((({,,...||)))))}.})))))),.,,(((((((.....))))))).,........(((((...)))))(((((....)))))))))))).)))))).))))}))},,.((((.(((((((((.((((((((.........(((.((((((((,,.(((((.(((((((.((..(((.,....,))).)).)))..))))..))))),,.)))))))))))..))))))))........,((({..,{(((((((((((({{({(({({..,(({((,.(((((((((((((({{{{{{{((({(,{{,,.,|||||,....}}|||((....))..))).)}}.}}),}}}))))).)))))).))))..))))),}}}..),)},))).)}}.})))))))))))}...((((({{..||....,,.,)),)))}))(((((.......))))).((((...,{(,(.(((((.(.((((.(((......))).)))).).)))))))))...)))}{((((((((((,,((,...,||..}}})}}}))))){{{|||....))))))}}))}}}))})))))))))...)))))))).).))).)))))))}}}..})},}.,,)}))))))..))))))((((...)))).....}))).(((.((((......)))).)))......)))))))....,.})).}}}(((((((,,((((((.,.,((((......}}}),,)).))))))})...,.))))))))).}..}}}},,}})))
Back