Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_FOXO1_0001600

Sequence Length

1352 nt

GC Content

0.5044

AAUUCAAUUCGUCAUAAUCUGUCCCUACACAGCAAGUUCAUUCGUGUGCAGAAUGAAGGAACUGGAAAAAGUUCUUGGUGGAUGCUCAAUCCAGAGGGUGGCAAGAGCGGGAAAUCUCCUAGGAGAAGAGCUGCAUCCAUGGACAACAACAGUAAAUUUGCUAAGAGCCGAAGCCGAGCUGCCAAGAAGAAAGCAUCUCUCCAGUCUGGCCAGGAGGGUGCUGGGGACAGCCCUGGAUCACAGUUUUCCAAAUGGCCUGCAAGCCCUGGCUCUCACAGCAAUGAUGACUUUGAUAACUGGAGUACAUUUCGCCCUCGAACUAGCUCAAAUGCUAGUACUAUUAGUGGGAGACUCUCACCCAUUAUGACCGAACAGGAUGAUCUUGGAGAAGGGGAUGUGCAUUCUAUGGUGUACCCGCCAUCUGCCGCAAAGAUGGCCUCUACUUUACCCAGUCUGUCUGAGAUAAGCAAUCCCGAAAACAUGGAAAAUCUUUUGGAUAAUCUCAACCUUCUCUCAUCACCAACAUCAUUAACUGUUUCGACCCAGUCCUCACCUGGCACCAUGAUGCAGCAGACGCCGUGCUACUCGUUUGCGCCACCAAACACCAGUUUGAAUUCACCCAGCCCAAACUACCAAAAAUAUACAUAUGGCCAAUCCAGCAUGAGCCCUUUGCCCCAGAUGCCUAUACAAACACUUCAGGACAAUAAGUCGAGUUAUGGAGGUAUGAGUCAGUAUAACUGUGCGCCUGGACUCUUGAAGGAGUUGCUGACUUCUGACUCUCCUCCCCAUAAUGACAUUAUGACACCAGUUGAUCCUGGGGUAGCCCAGCCCAACAGCCGGGUUCUGGGCCAGAACGUCAUGAUGGGCCCUAAUUCGGUCAUGUCAACCUAUGGCAGCCAGGCAUCUCAUAACAAAAUGAUGAAUCCCAGCUCCCAUACCCACCCUGGACAUGCUCAGCAGACAUCUGCAGUUAACGGGCGUCCCCUGCCCCACACGGUAAGCACCAUGCCCCACACCUCGGGUAUGAACCGCCUGACCCAAGUGAAGACACCUGUACAAGUGCCUCUGCCCCACCCCAUGCAGAUGAGUGCCCUGGGGGGCUACUCCUCCGUGAGCAGCUGCAAUGGCUAUGGCAGAAUGGGCCUUCUCCACCAGGAGAAGCUCCCAAGUGACUUGGAUGGCAUGUUCAUUGAGCGCUUAGACUGUGACAUGGAAUCCAUCAUUCGGAAUGACCUCAUGGAUGGAGAUACAUUGGAUUUUAACUUUGACAAUGUGUUGCCCAACCAAAGCUUCCCACACAGUGUCAAGACAACGACACAUAGCUGGGUGUCAGGCUGAGGGUUAGUGAGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-419.1 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -443.91

Frequency: 0.0000

Diversity: 276.14

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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