Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_GRIN2B_0001400

Sequence Length

690 nt

GC Content

0.4594

UAAUUGUGUCCAUCCCCCCCAGAAAACCAGUCUUCUUACUGGUUUGUGAGAAAUGUUCAUGCACUUUGGCCAGGGUUUUACAUAGGGUUCAAUUUGGCUCUAAGCAAACCCCAGGUCUGACUCCUAUCUUCUAGGUAGACCCUAGGUUACCACAUUCCACACAAAGACAGGCUGGUGGCACCAUAUUUCCUCUGUCAGUACCUAGGGUAGGAAAGAUUCCCAAAAGGGCUUAAACAGAAUUAAGGUCAAAUUAACUUCCCAUUCUUGGCGUGACUGAAAGGUUUCAGGAAGCUCAAUCCUGAGAAAUCUCCCAGCGGCCUCCUCUGAUGCUGAAACAAUCGUCUCAGUCAUCUGAGUCUUUUCUUCUUUAGGACCUGGGCGCUGACUCACUCCCUGCCCCAUCUCCACCCUCAGAAGUCAGCCUGGCAAACACACGUGGAAAAAUCUCCACUAACUCUACUUUUUGAAGCAUGUGAUAUCUGGUCACAGAGAGGUAGUGCUGGAUAUGUGUCUUACAAAUUUGCAUGCUUUUCUAGAAAAGAUGAUGGGAUCCACUAGAAACUCAGUGGUGAGAUGAUUCCCUUAGCAAGAUUGCUGAAGUUAGGUUUAGACGUGGGAGGGUGGGUAUGUGAGCAAUGGUGCCAAUAGCGGCUCUUUAUUUGCCUUGUCCUCAUUACUGCCAUCAGGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-204.2 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -217.14

Frequency: 0.0000

Diversity: 130.39

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((((..............((((((((......))))))))(((((.....)))))......((((((((((((..(((((((.(((((((((.............)))))).))).))))))......)..))))))).))))).........)))))..(((((((((.(((((((((.........((((((.((((((..((((((((..(((....))).......(((((.(((..........)))...))))).(((.((.(((..(((((((((((.......))))))..)))))..))))))))..(((.((((((((.((....)).)))).)))).))))))))))).........)))))).))))))........(((.((((.(((((((((....(((((((((((........(((((......)))))....((..((((((((((((((((((((((((.(((.........))))))))))..............)))))))))))....))))))..)).(((((((((((.........))))).))....))))((((((....)))))).))))))))..)))....))))))))).))).).)))))))))))).))))(((.........))))))))...))))((.((....)).))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((({((({..........,,..{(((((((......))))))))(((.{,,.,{|,,..}},.,,,((((.((((((..{.(((((((,....,})))))).,.}}}}}),.))}|||,..||||,....||||}}}}}),,.))}},.,,,,...,))}}},.(((({((((.(((((((((.........((((((.((((((..((((((((,.(((....))).,,....{{{{{.||{{,........,,,...}}}}}.(((.((.(((..(((((((((((.......))))))},,))))..))))))))..{((.((((((((.((....)).)))).)))).))))))))))).........)))))).))))))........(((,{(((.(((((((((....((({(((((((........(((((......)))))....{{..((((((((((((((((((((((((.(((,......,.}})))}}})}|{{{....}},...}))))))))))....))))))..},.(((((((((({.........))))).},....))))((((((....)))))).)))))))}..)))....))))))))).))).).)))))))))))).))))(((.........)))}))))...))))((.((....)).))