Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_GRIN2B_0001700

Sequence Length

1953 nt

GC Content

0.5678

UUCCAGAGACCUAAUGACUUCUCACCCCCUUUCCGCUUUGGGACCGUGCCCAACGGCAGCACAGAGAGAAAUAUUCGCAAUAACUAUGCAGAAAUGCAUGCCUACAUGGGAAAGUUCAACCAGAGGGGUGUAGAUGAUGCAUUGCUCUCCCUGAAAACAGGGAAACUGGAUGCCUUCAUCUAUGAUGCAGCAGUGCUGAACUAUAUGGCAGGCAGAGAUGAAGGCUGCAAGCUGGUGACCAUUGGCAGUGGGAAGGUCUUUGCUUCCACUGGCUAUGGCAUUGCCAUCCAAAAAGAUUCUGGGUGGAAGCGCCAGGUGGACCUUGCUAUCCUGCAGCUCUUUGGAGAUGGGGAGAUGGAAGAACUGGAAGCUCUCUGGCUCACUGGCAUUUGUCACAAUGAGAAGAAUGAGGUCAUGAGCAGCCAGCUGGACAUUGACAACAUGGCAGGGGUCUUCUACAUGUUGGGGGCGGCCAUGGCUCUCAGCCUCAUCACCUUCAUCUGCGAACACCUUUUCUAUUGGCAGUUCCGACAUUGCUUUAUGGGUGUCUGUUCUGGCAAGCCUGGCAUGGUCUUCUCCAUCAGCAGAGGUAUCUACAGCUGCAUCCAUGGGGUGGCGAUCGAGGAGCGCCAGUCUGUAAUGAACUCCCCCACCGCAACCAUGAACAACACACACUCCAACAUCCUGCGCCUGCUGCGCACGGCCAAGAACAUGGCUAACCUGUCUGGUGUGAAUGGCUCACCGCAGAGCGCCCUGGACUUCAUCCGACGGGAGUCAUCCGUCUAUGACAUCUCAGAGCACCGCCGCAGCUUCACGCAUUCUGACUGCAAAUCCUACAACAACCCGCCCUGUGAGGAGAACCUCUUCAGUGACUACAUCAGUGAGGUAGAGAGAACGUUCGGGAACCUGCAGCUGAAGGACAGCAACGUGUACCAAGAUCACUACCACCAUCACCACCGGCCCCAUAGUAUUGGCAGUGCCAGCUCCAUCGAUGGGCUCUACGACUGUGACAACCCACCCUUCACCACCCAGUCCAGGUCCAUCAGCAAGAAGCCCCUGGACAUCGGCCUCCCCUCCUCCAAGCACAGCCAGCUCAGUGACCUGUACGGCAAAUUCUCCUUCAAGAGCGACCGCUACAGUGGCCACGACGACUUGAUCCGCUCCGAUGUCUCUGACAUCUCAACCCACACCGUCACCUAUGGGAACAUCGAGGGCAAUGCCGCCAAGAGGCGUAAGCAGCAAUAUAAGGACAGCCUGAAGAAGCGGCCUGCCUCGGCCAAGUCCCGCAGGGAGUUUGACGAGAUCGAGCUGGCCUACCGUCGCCGACCGCCCCGCUCCCCUGACCACAAGCGCUACUUCAGGGACAAGGAAGGGCUACGGGACUUCUACCUGGACCAGUUCCGAACAAAGGAGAACUCACCCCACUGGGAGCACGUAGACCUGACCGACAUCUACAAGGAGCGGAGUGAUGACUUUAAGCGCGACUCCGUCAGCGGAGGAGGGCCCUGUACCAACAGGUCUCACAUCAAGCACGGGACGGGCGACAAACACGGCGUGGUCAGCGGGGUACCUGCACCUUGGGAGAAGAACCUGACCAACGUGGAGUGGGAGGACCGGUCCGGGGGCAACUUCUGCCGCAGCUGUCCCUCCAAGCUGCACAACUACUCCACGACGGUGACGGGUCAGAACUCGGGCAGGCAGGCGUGCAUCCGGUGUGAGGCUUGCAAGAAAGCAGGCAACCUGUAUGACAUCAGUGAGGACAACUCCCUGCAGGAACUGGACCAGCCGGCUGCCCCAGUGGCGGUGACGUCAAACGCCUCCACCACUAAGUACCCUCAGAGCCCGACUAAUUCCAAGGCCCAGAAGAAGAACCGGAACAAACUGCGCCGGCAGCACUCCUACGACACCUUCGUGGACCUGCAGAAGGAAGAAGCCGCCCUGGCCCCGCGCAGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-678.1 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -711.81

Frequency: 0.0000

Diversity: 466.98

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((..(((...(((((...((((((((((((((.((((((((......)))))....)))...))))).(((.(((.((.....((((((....))))))......)).))).)))........)))))).))).....))))))))((((((....))))))...((.(.((((((((((.((.(((...(((.....))).....)))..)).))))))))))).)).(((((((((((((((..(((((((((.....(((((((((((..(((((...)))))))............)))))))))(((.(((((..(((.(((((((.((.(((....))).)).)).))))))))..(((((..(((((((.((((((((.....(((((..(((((((.(((((((..((((.(((((..(((.(.((..(((((((..(((.....))).)))))))..)).).)))))))))))))))))))...))))..((((.((...........)).))))....(((..((((....(((((((......)))..))))))))..)))((((((....((((..((....))..))))...((((((((((......((((....((((((((..((........))..)))............................((((...(((((((..(((((......))))).(((.....))).......((((......))))((.(((((..((((..((((((.....)))))).))))..)).))).))...).))))))....))))....)))))....))))........)))))))))).)))))).....))))))))....)))))))).)))))))....))))).........((((.....))))...(((.........)))...........))))))))(((((.....(((.(((....))))))...)))))..........(((......)))))))).)))))))))...))).))))))).....((((((((((..(((((((((((((..........((((((((.(((.((((((((((...((((......)))).).))).))))).)..)))...((((((.((.(((((((((((...)))))).................((.(((((...((((((.((..(((((....((((.....................))))......))))).)))))))).....))))).)))))))..)))))).)))))))))).....((((((....((((..((((.(((((.....(((((.((((..(((...((..((((((((.(.((((((..(((...((((((........).)))))....))).))))))).))))).)))..))....)))....)))).(((((....))))).)))))......))))).))))..)))).((((....))))(((((...........))))).)))))).......((((((((((((((...))))).....((........))))))).)))))))).)))))).)))))))))))))..(((((((.((((((.........))))))........(((((((.((((..(((((.(((.((((((.(((((.((.((.((((((.....((((((......))))))..((((........(((.(((.....))).))))))).))))))...)))).)))))..(((((.((.(.(((...))).).)).))))).............))))))....)))...)))))............(((.....((((....))))...))).....)))).)))))))...)))))))...)))((.(((........).)).))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((,,....,,,{.{,(((({(((((((((({(((((((....,.}}}}).))},,,..,|||.{,....|||.{{.....{(((((....)))))),,,...|}|)}}.},,,..,,,||})})}|{|}}.,.,}))))}}}}((((((....))))))...||,|.((((((((((.{(.(((...(((.....))).....)))..)).))))))))))}.}}}{((((((.((((.(.((((((((((.......))))))))).).))))|,|,.(((((((.........))))))).,{,{{{{(((((.,{{{.||,,|||||{||||..||)}}|,||||.|,|||}}}..|||||}{(((((((.((((((((.....(((((...((((((.(((((((..((((.(((((,,(({.{.,,..(((((((..(((....,))).)))))))..},,),)}}))))))))))))))))...)))).,|,{{{{{,..,.......,|{||||,.,.{{(,,({{{....{{|{{{{.|...,}|}}.||||}}}}.||}},{{{||,...((((..({....))..))))...{(((((((((.,....((((..,.{(((({({..((........}}..}}}....,,......................((((,..{{{||||,.(((((......})))}..,|}}|,}}}}|}|....{{{|....,,))}}((.(((((..((((..((((({.....}))))).))))..)).))).))...},})))))....}})}....)))))}...))))........)))))))))),||||},.,}},}},)))))....)))))))).))))))}...{|}|{({....{({{((((,.{{{||||..,{{{,........,,}.....,,.,,.,,..,|||||||......|||{.,.))),}}},,...(((((((,{{..((((({(............,,......))))).})))))))).{{,{({{((((((((((..(((((((((((((..........((((((((.(((.(((((((((,...((((......)))).,.))).))))).),.)))...{,{{{(.{{,{{{{,((((((...))))))...........,{{{,{((.(((((...(((({{{((..(((((....((((,....................))))......))))).)))))))).....))))).)))}}}}.,))))}).}})))))))).....((((((..,{((((,,((((,(((({.......{({.{{|,,||{,...((..((((((((.(.((((((..{((...((((((........).)))))...,)}}.))))))).))))).)))..))....})}...,)})))|((((,.,{,|,...,||}|.,||||})}}}.))))..)})){((((....))))){{{{...........)))}).)))))).......((((((((((((((,,.}}}}},,,,,|{........}))))))},))))))).)))))).)))))))))))))..,))}))),|{,|||}}}}.,,..)))))),.......(((((((.((((.,(((((.(((.((((((.(((((.((.((.((((((.....((((((......))))))..(((({.......{{(.(((.....))).))))))).))))))...)))).)))))..{((((.((.(.{{{...})),).)),))}}}..,..........))))))....)))...)))))..........,{((,.,...{{|{.,,,)}}}...}}}...,.)))).))))))),||,,,,.))},,,..{|||,..})))}})),})}))