Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HBA1_0000500
Sequence Length
444 nt
GC Content
0.6486
GAUGUUCCUGUCCUUCCCCACCACCAAGACCUACUUCCCGCACUUCGACCUGAGCCACGGCUCUGCCCAGGUUAAGGGCCACGGCAAGAAGGUGGCCGACGCGCUGACCAACGCCGUGGCGCACGUGGACGACAUGCCCAACGCGCUGUCCGCCCUGAGCGACCUGCACGCGCACAAGCUUCGGGUGGACCCGGUCAACUUCAAGCUCCUAAGCCACUGCCUGCUGGUGACCCUGGCCGCCCACCUCCCCGCCGAGUUCACCCCUGCGGUGCACGCCUCCCUGGACAAGUUCCUGGCUUCUGUGAGCACCGUGCUGACCUCCAAAUACCGUUAAGCUGGAGCCUCGGUGGCCAUGCUUCUUGCCCCUUGGGCCUCCCCCCAGCCCCUCCUCCCCUUCCUGCACCCGUACCCCCGUGGUCUUUGAAUAAAGUCUGAGUGGGCGGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-143.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -151.92
Frequency: 0.0000
Diversity: 113.89
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((....(((...............)))..)).))((((((((.((((.(((((((((...(((.((((..(((((....(((((((((((((((.......(((((...(((((((.(((.((.....)).))))).))).)).((((((((.((((....(((....)))...)))).))))))))..))))).......(((((.((((((.(((((((.(((((.(.((((.............)))).).)))))...)))).))).........(((.....)))))))))..).)))).....(((((.(((((.............)))))..))))))))))).)))))))))....((((.........))))......))))))))).....)))...)))))).))).)......))).))))..)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,{.....|}},.,,(({.({{{..{(((.....,,..,...,,.{{{{,({(({{,{|,..,||.||||,,(((((,,,,(((((((((((((((,.{(.(,(({((..,(({((((.(((.((.....)).)))))},)),)).((((((((.((((....(((....)))...)))).))))))))..|||}}.,.....(((((.{(((({.{((((((.(((((.{.((((.,...........)))).).)))))...)))).))}.{{......(({.....}))})))}}..),)})),}}},|{{{{,|{{{,......,....,,))))),.,))}))))))).)))))))))....((({.....,,,,)}}}......,,,,,},}|.....))}...}})))))))),)},....)))),.))))}.)).
Back