Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_HDAC9_0014400

Sequence Length

819 nt

GC Content

0.5055

CAAAUGGUUUCACAGCAACGCAUUCUAAUUCAUGAAGAUUCCAUGAACCUGCUAAGUCUUUAUACCUCUCCUUCUUUGCCCAACAUUACCUUGGGGCUUCCCGCAGUGCCAUCCCAGCUCAAUGCUUCGAAUUCACUCAAAGAAAAGCAGAAGUGUGAGACGCAGACGCUUAGGCAAGGUGUUCCUCUGCCUGGGCAGUAUGGAGGCAGCAUCCCGGCAUCUUCCAGCCACCCUCAUGUUACUUUAGAGGGAAAGCCACCCAACAGCAGCCACCAGGCUCUCCUGCAGCAUUUAUUAUUGAAAGAACAAAUGCGACAGCAAAAGCUUCUUGUAGCUGGUGGAGUUCCCUUACAUCCUCAGUCUCCCUUGGCAACAAAAGAGAGAAUUUCACCUGGCAUUAGAGGUACCCACAAAUUGCCCCGUCACAGACCCCUGAACCGAACCCAGUCUGCACCUUUGCCUCAGAGCACGUUGGCUCAGCUGGUCAUUCAACAGCAACACCAGCAAUUCUUGGAGAAGCAGAAGCAAUACCAGCAGCAGAUCCACAUGAACAAACUGCUUUCGAAAUCUAUUGAACAACUGAAGCAACCAGGCAGUCACCUUGAGGAAGCAGAGGAAGAGCUUCAGGGGGACCAGGCGAUGCAGGAAGACAGAGCGCCCUCUAGUGGCAACAGCACUAGGAGCGACAGCAGUGCUUGUGUGGAUGACACACUGGGACAAGUUGGGGCUGUGAAGGUCAAGGAGGAACCAGUGGACAGUGAUGAAGAUGCUCAGAUCCAGGAAAUGGAAUCUGGGGAGCAGGCUGCUUUUAUGCAACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-248.8 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -264.24

Frequency: 0.0000

Diversity: 139.57

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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