Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_HDAC9_0016900

Sequence Length

591 nt

GC Content

0.5381

CCUUUCCUGGAACCCACGCACACACGUGCGCUCUCUGUGCGCCAAGCUCCGCUGGCUGCGGUUGGCAUGGAUGGAUUAGAGAAACACCGUCUCGUCUCCAGGACUCACUCUUCCCCUGCUGCCUCUGUUUUACCUCACCCAGCAAUGGACCGCCCCCUCCAGCCUGGCUCUGCAACUGGAAUUGCCUAUGACCCCUUGAUGCUGAAACACCAGUGCGUUUGUGGCAAUUCCACCACCCACCCUGAGCAUGCUGGACGAAUACAGAGUAUCUGGUCACGACUGCAAGAAACUGGGCUGCUAAAUAAAUGUGAGCGAAUUCAAGGUCGAAAAGCCAGCCUGGAGGAAAUACAGCUUGUUCAUUCUGAACAUCACUCACUGUUGUAUGGCACCAACCCCCUGGACGGACAGAAGCUGGACCCCAGGAUACUCCUAGGUGAUGACUCUCAAAAGUUUUUUUCCUCAUUACCUUGUGGUGGACUUGGGGUGGACAGUGACACCAUUUGGAAUGAGCUACACUCGUCCGGUGCUGCACGCAUGGCUGUUGGCUGUGUCAUCGAGCUGGCUUCCAAAGUGGCCUCAGGAGAGCUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-183.9 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -195.88

Frequency: 0.0000

Diversity: 149.65

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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