Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_HDAC9_0017900

Sequence Length

279 nt

GC Content

0.5161

CGAAUUCAAGGUCGAAAAGCCAGCCUGGAGGAAAUACAGCUUGUUCAUUCUGAACAUCACUCACUGUUGUAUGGCACCAACCCCCUGGACGGACAGAAGCUGGACCCCAGGAUACUCCUAGGUGAUGACUCUCAAAAGUUUUUUUCCUCAUUACCUUGUGGUGGACUUGGGGUGGACAGUGACACCAUUUGGAAUGAGCUACACUCGUCCGGUGCUGCACGCAUGGCUGUUGGCUGUGUCAUCGAGCUGGCUUCCAAAGUGGCCUCAGGAGAGCUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-83.3 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -90.1

Frequency: 0.0000

Diversity: 66.57

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(...(((.((((((..((((((((.(.((....((((((((.((((((((((((......((((((((........(((.....(((......)))....)))((((((((.((((.(.(((((((((...................))))))))).).))))..)))))))).)))))))).....)))))))))))).(((.((((.((........)).)))).))).))))))))..)).)))))))))......))))))..)))..)(....)

Thermodynamic Ensemble Prediction

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