Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HECTD1_0014300
Sequence Length
2639 nt
GC Content
0.4487
AUACUUACAAGGAGAUUACGAUUUCGGUUGGAACGUGCACCUGGUGAAACUGCAUUGAUUGACAGGACUGGCAGAAUGUUGAAGAUGGAACCUUUGGCUACAGUUGAAUCUCUGGAACAGUACCUUUUGAAAAUGGUAGCAAAACAGUGGUAUGAUUUUGACCGAUCUUCAUUUGUUUUUGUUCGAAAAUUAAGAGAAGGACAAAAUUUUAUAUUUCGGCACCAGCAUGAUUUUGAUGAAAAUGGAAUCAUUUACUGGAUUGGAACAAAUGCAAAAACUGCUUAUGAAUGGGUAAAUCCAGCUGCCUAUGGACUUGUAGUAGUAACGUCAUCAGAAGGAAGAAAUCUACCUUAUGGCCGCUUAGAAGACAUACUAAGUCGUGAUAAUUCAGCUUUAAAUUGUCAUAGCAAUGAUGAUAAGAAUGCCUGGUUUGCCAUAGAUCUGGGUCUCUGGGUGAUACCAUCAGCAUAUACACUUCGUCAUGCUCGUGGUUAUGGAAGGUCUGCACUGAGAAAUUGGGUUUUCCAGGUAUCCAAAGAUGGACAGAACUGGACUUCUUUGUAUACCCAUGUUGAUGACUGCAGUCUCAAUGAACCAGGGUCAACUGCAACUUGGCCUCUUGAUCCACCAAAGGAUGAGAAACAAGGGUGGAGACAUGUGAGAAUUAAACAGAUGGGGAAAAAUGCCAGUGGACAAACACACUACCUCUCAUUAUCUGGAUUCGAACUUUAUGGCACUGUAAAUGGAGUAUGUGAAGAUCAGCUAGGGAAAGCAGCUAAAGAAGCAGAAGCUAAUCUUAGACGGCAGAGACGUCUAGUACGUUCCCAGGUUCUGAAAUACAUGGUUCCAGGAGCUCGUGUUAUCAGAGGCCUGGAUUGGAAAUGGCGAGAUCAGGAUGGCAGCCCACAGGGAGAAGGCACUGUCACAGGAGAACUACACAAUGGCUGGAUUGAUGUCACCUGGGAUGCUGGUGGCUCAAACUCUUACCGUAUGGGCGCAGAAGGAAAAUUUGACCUCAAGCUUGCACCAGGGUACGACCCUGAUACAGUGGCAUCACCCAAACCUGUUUCAUCCACUGUUUCAGGCACAACGCAAUCAUGGAGCAGCUUGGUGAAAAACAACUGUCCAGACAAGACAUCUGCUGCUGCAGGCUCCUCAAGUAGAAAAGGAAGCAGCAGUUCUGUGUGUAGCGUGGCCAGUAGCAGCGACAUCAGCUUGGGUUCGACCAAAACGGAACGGAGAUCAGAAAUUGUAAUGGAACACAGUAUAGUUUCAGGAGCUGAUGUCCAUGAACCAAUUGUUGUUCUUUCAUCUGCUGAAAACGUCCCUCAAACAGAAGUAGGGUCAUCUUCCAGUGCAAGCACCAGCACCUUAACAGCGGAAACGGGAAGUGAAAAUGCUGAAAGGAAGUUAGGCCCUGAUAGUUCUGUUCGUACUCCUGGGGAGUCUAGUGCAAUAUCCAUGGGAAUUGUCAGUGUUAGUUCUCCUGAUGUUAGUUCAGUAUCUGAAUUAACUAAUAAAGAAGCAGCUUCACAACGACCUCUUAGCUCUUCAGCAAGUAACAGACUGUCAGUGAGUUCUUUGUUGGCUGCUGGGGCCCCUAUGAGCUCUAGUGCAAGUGUACCUAACCUGUCCUCAAGAGAAACAUCUAGCUUGGAGAGUUUUGUAAGGAGAGUGGCAAACAUAGCACGGACUAAUGCCACGAACAACAUGAAUCUAAGCCGAAGCAGCAGUGAUAACAACACUAAUACUUUGGGGAGGAAUGUGAUGAGCACAGCAACUUCUCCUCUUAUGGGUGCUCAGAGUUUCCCUAAUUUGACCACACCUGGUACUACAUCAACAGUGACUAUGUCAACAUCCAGUGUUACUAGCAGCAGCAAUGUAGCUACAGCAACAACAGUUUUAUCAGUUGGUCAAUCUUUAAGUAACACUUUAACCACCAGCCUCACAUCAACUUCCAGUGAGAGUGACACAGGUCAGGAAGCAGAAUAUUCCUUAUAUGAUUUCCUUGAUAGCUGCCGUGCCAGUACUCUAUUGGCUGAGCUCGAUGAUGAUGAGGACUUACCUGAGCCAGAUGAAGAAGAUGAUGAGAAUGAAGAUGACAAUCAGGAGGACCAAGAAUACGAGGAGGUUAUGAUUCUGAGACGCCCAUCCCUGCAACGUCGAGCUGGCUCCCGCUCUGAUGUAACGCAUCAUGCUGUUACCUCGCAGCUACCACAGGUACCUGCUGGAGCAGGGAGCCGACCUAUUGGGGAGCAGGAAGAAGAAGAGUACGAAACUAAAGGAGGACGCCGGAGAACAUGGGAUGAUGAUUAUGUGCUAAAGAGACAGUUUUCUGCAUUGGUUCCUGCUUUUGAUCCUAGACCUGGUCGUACUAAUGUCCAGCAGACAACUGAUCUAGAAAUACCACCCCCAGGGACCCCUCAUUCAGAGCUCUUGGAAGAAGUCGAAUGUACUCCGUCACCUCGAUUAGCUCUCACUUUGAAAGUAACAGGUCUUGGAACGACUCGUGAAGUUGAAUUACCACUCACCAAUUUCAGAUCAACCAUCUUUUACUAUGUACAAAAAUUGCUUCAAUUGUCCUGUAAUGGCAAUGUGAAAUCAGAUAAACUUAGGCGUAUUUGGGAGCCCACAUACAC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-757.8 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -806.47
Frequency: 0.0000
Diversity: 562.02
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((.(((....((((.((((....))))))))..))).))))....((((((....(((((((..(((....((.((((((((....(((((.(.((((((..((((((((..(((((....(.(((((.(((.((......)).))).))))).)((((...........((((((((..............)))))))).........))))..((((.((((((((.((....))))))))))...))))...(((((.((((((((((((((((....(((((((........))))))).......((((((((((((((((..((((.((....)).))))((((((((......(((.......)))(((((((((........)))))))))((((.((((((.....((((.(((((((((.((((........))))))))).))))...)))).......)))))))))).))))))))..((..(((......)))..))..(((((((.(((.(((...(((((.((((((..(((((((((((((...(((....)))..(((((((((.........)))...)))))).(((((((((((((((((((...(.........)...)))))...(((.((.........)).)))((........))((((........))))...(((((((((((((((........(((((((((((..(((.((((((((..(.((((.(((((((((((.((((((((((....)))....(((((((.......))))))).......(((((((((((...(((((((((...)))).)))))..))))).))))))............(((..((((..(((((((.((((((((....(((((.((((((((((((((((.((((..(((((((.((((((.((....))))))))))))..)))..)))).((((..((((.......))))..)))).((((.(.(((((((((((.(((((.(((((((....((........)).....))))))).)))))............(((...((((..(((((((((((((((((.......))))...((((((((.(((((((((..(((((..(.......)..)))))..)).)).).)))).))))))))(((((((((((..((((..........))))........(((((((((.((.....)).)))))))))..)))))))))))............)))))).))))))).))))....))).......((((((.(((((((..(((((.((((........)))).....(((((...((.....)).....)))))...)))))...))))))...).)))))))))))).)))))))))).....(((((.(((...))))))))..))).)))))))))))..((((((((((...)))))))))).......((((.((((...............))))))))..............)).)))))..)))))))).)))))))(((((........))))).((((....))))....))))..))).(((......))).(((((((..((.((((.......((((((....(((......))).))))))..)))).))...))))))).((((.(..((((.......))))..).))))(((((((..((((.....))))....))))))))))).))).))))......)))))))..)))))..)))...))))).)))..)))))).))))).....)))).((((((((.((.(.(((......))).).))................((((((........((((...)))).....))))))(((((...........))))))))))))).((((((((((........(((((((......((.((((..(((.....(((((((...)))))))..))))))).))..)))))))))).))))).)).........)))))))))))............))))))))).))))).)))))))))))))..).)))))......)))))(((((..(.((((..(((((((((((((((.((((((((...))).))))).))((((.((((...)))).)))).))))).)))))))).....)))).).))))).........(((.....)))......))).))))))))))....))))))).)))).)))))..))).))))))).)))))).))))).......((((........)))))))))....))))).)))))))))).)))))..........(((((.(((...(.(((((((....(((.((.((((((.((........))..))))))..)).)))))))))).).....))))))))...((.((.((((((((.............))))))))))))..)))))))).))..))).....(((((...)))))))))))).....))))))..................(.((((.(((....))).)))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
....{{,{.{((,{,.,{{{.{{((,,,,|||||||||.}||{}|,,..,{((((({.,,,({((((({({((,,..((,{(({{(({..,.,||||,,,{{{||...,.,}}|...}}}|,}}},||||.,|{|||}}.....}}|,|||}}|{|||||}|||}|||||,{(((({((({{{({{{{..{{{|{...,,.,,,,.}}}}}..}})}}},.((((.((((((((.{(....})})))))))...))))..,|}}}}}}},|||,..{{|({.,,,,.{((((({..,,,,..}|||||}....,|||||||||,..(((((...((((.((....)).))))))))).((((((........)))))).(((.(((((((((((({.{(((((((....})))))))......,..,{({{..(({.(((((((((((((((((,{..{{{{{.(((((..{{.....)}.))))).})))}..{{{,.,((((((.,((.((.(((((..,..((((((.{((,..,,|||,((((({..(((((((((((((,,,(.,(({{{|{{{,,..|||}|,,},,....)))}..,},,,..(((((((((((((((((((...,.........)...)))))}..(((.((.........)).)))((........))((((........))))...((((((((((({{{(,,{.....(((((((((((..(((.{(((((((..(.((((.(((((((((((.((((((((((....)))....{((((((.......))))))|..,,{{{(((((((((((...(((((((((...)))).)))))..)))))}})))))...}},,...,,(((..((((..{((((((.((((((((....(((((.(,((((((((((((((.{(((..(((((((.((((((.({....),))))))))))..)))..)))}.((((.{((((.......}))}.})))}.{{({.{.(((((((((({.(((((.(((((((.,,.,..,,....,)....,,))))))).)))))......,,.....,{{,{((((..(((({({{{({(((({(,......}|||...((((((((.{((({((({..{{{{{..|...,,,,),,)}}})},)}.}).,,))}),)))))))}(((((((((((,{,(((,.||.....,),.),,...,|.(((((((((.((.....)).)))))))))..)))))))))))......,.....)))))),))))))).))))....,,,......,((((((.(((((((,.(((((.((((........)))).....(((((...((.....)).....)))))...))))).,.))))))...}.)))))))))))).)))))}}))}},.,,(((((.(((...)))))))),.)))}}))))))))))..((((((((((...)))))))))).......((((.((((...............))))))))....,,,.....,,)).)))))..)))))))).))))))|(((((......,.))))),((((....))))....))))..))).(((......))).(((((((..,{.,(((.......((((((....(((......))).))))))..,),)}),...))))))),((((.{..((((.......))))..}.))))|((((((..((((.....))))....))))))))))).))).))))......)))))))..))))}..)))...))))}.)))..)))))).))))),,...}}}}.((((((((.((.(,({{..,,,.))).,.}}.,{....},,......((((((........((({...)))).....))))))(((((...........))))))))))))).((((((((((........(((((((.,..,,{{.((({.,(((.....(((((((...))))))).,))))))).)),.)))))))))).))))).))....,,,..)))))))))))............,)))))))).))))).)))))))))))))..}.)))))......}},}}(((((..(.((((,.(((((((((((((((.((((((({...})).))))).))((((.((((...)))).)))).))))).)))))))).,...})))},.)))))..{{..(((((((.(,{{((({.(((((({,|{..{{.{(((((........)))))).))...,.}.}.))))))).,.})))))).)))))))..))....))))))..,..))))).))))))))))..}}..}})}.......,,,,)))))))))),..{,,{,(((({(..,.{,,|.,({(({.,{.....,}.}}..))})}}}}})}},|,,,})},,},..})))))))))..,}}},,,))))))))))))).)))...,,,.,,,}}|||...}}))))}),)),,),},}},.,,{{{.,,||||||}}}}}}...,,))))})},...,,......,.,,,|,|{{{.|||..,,))).)))}.,
Back