Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HECTD1_0025100
Sequence Length
2766 nt
GC Content
0.4006
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Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-717.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -773.43
Frequency: 0.0000
Diversity: 764.33
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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