Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HECTD1_0032500
Sequence Length
1622 nt
GC Content
0.3921
CCUUUGAAGUAAAUUUUAUGGAUGAUGUAGGUCAGACUCUAUUAAACUGGGCCUCUGCUUUUGGAACUCAGGAAAUGGUAGAAUUUCUUUGUGAGAGAGGUGCAGAUGUUAAUAGAGGUCAAAGGUCAUCAUCAUUACAUUAUGCUGCAUGUUUUGGAAGACCUCAAGUAGCAAAGACUCUGUUACGGCAUGGUGCAAAUCCAGAUCUGAGAGAUGAAGAUGGGAAAACUCCAUUAGAUAAAGCUCGAGAAAGGGGCCAUAGUGAAGUGGUAGCUAUUCUUCAGUCUCCAGGUGAUUGGAUGUGUCCAGUUAAUAAAGGAGAUGAUAAGAAAAAGAAAGAUACAAACAAAGAUGAAGAAGAAUGUAAUGAGCCCAAAGGAGAUCCGGAAAUGGCACCCAUAUACUUGAAAAGGUUAUUGCCAGUGUUUGCACAAACAUUUCAGCAAACUAUGCUGCCUUCAAUAAGGAAAGCAAGUCUUGCUCUAAUUCGAAAAAUGAUUCAUUUUUGCUCUGAAGCACUGUUAAAAGAAGUUUGUGAUUCUGAUGUUGGUCACAAUUUGCCUACAAUACUAGUGGAAAUCACUGCAACUGUCCUGGAUCAAGAGGAUGAUGAUGAUGGCCACUUGCUGGCUUUGCAGAUCAUAAGGGAUUUAGUAGAUAAAGGUGGUGAUAUAUUUUUGGAUCAGCUAGCCAGACUUGGUGUAAUUAGCAAAGUGUCAACGUUGGCAGGUCCUUCCUCUGAUGAUGAGAAUGAAGAGGAAUCAAAACCAGAAAAAGAAGAUGAACCACAGGAAGAUGCUAAAGAAUUGCAACAAGGUAAACCAUAUCAUUGGAGAGACUGGUCAAUCAUUAGGGGAAGGGACUGCUUAUAUAUUUGGAGUGAUGCAGCAGCCUUGGAAUUAUCUAAUGGCAGUAAUGGAUGGUUCAGAUUUAUCUUGGAUGGAAAACUUGCCACCAUGUAUUCAAGUGGUAGUCCGGAAGGUGGAUCUGACAGUUCAGAAAGCCGAAGUGAAUUCUUAGAGAAGUUACAAAGAGCUCGAGGCCAAGUAAAGCCAUCUACUUCAAGUCAACCUAUACUGUCAGCACCAGGACCCACUAAACUUACUGUAGGAAAUUGGUCACUGACAUGUUUGAAAGAAGGAGAAAUUGCUAUUCAUAAUUCAGAUGGUCAGCAAGCUACAAUAUUGAAAGAAGAUUUACCUGGUUUUGUAUUUGAAUCUAAUAGAGGAACCAAACAUUCAUUUACUGCAGAAACUUCCCUGGGUUCAGAAUUUGUGACUGGCUGGACUGGCAAAAGAGGCAGAAAACUGAAAUCUAAGUUAGAAAAAACAAAGCAAAAGGUACGAACUAUGGCUCGAGAUUUAUACGAUGACCAUUUUAAAGCUGUUGAAAGCAUGCCUCGUGGAGUAGUGGUAACACUCAGAAACAUAGCAACUCAGUUAGAGUCAUCUUGGGAACUUCAUACAAAUAGACAAUGUAUUGAGAGUGAGAACACUUGGAGAGAUUUAAUGAAGACAGCUUUAGAAAACCUAAUUGUACUUUUGAAGGAUGAAAACACAAUUUCACCAUAUGAAAUGUGUAGCAGUGGCUUGGUACAAGCACUUCUUACUGUGUUAAACAAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-405.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -439.89
Frequency: 0.0000
Diversity: 469.73
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((....(((.((.((((....))))(((((((((((.(((.((((((.(((.....((..(((((((......))))))).))))))))))).)))...)))))))).)))..(((((.((..((..((((........))))..)))).)))))...((((((.......))))))(((((.(((.((((((...((((((.......((((((.....))))))........))).)))...((((((((((....(.(((.((.(((((((((((((...((((((((....)))))))).....)))))).............................)))))))........((((((((..((((.........(((((...(((..(((...)))..))))))))((((((....))))))...((((((((.((((.((((....))))..))))))).)))))........(((((((...)))))))(((....))).((((((((.((((((((.(.((((..((((((...((((((.((((((.((.((((((..((((((((...(((((((((((......(((((......(((((.....)))))......)))))....)))))))..))))...)))))))).....(((((.........)))))((((((((...((((((.((....)).)))((((..(((((((((((((((.........((....))...(((((........((((((((.......(((........))).......)))........))))).......)))))..)))))))))))))))..))))......((((((((((((((.((.(((((((((((..((..((((.....(((((.((.((((((((((((...((((....(((((((..((....)).))))))))))).)))))))))))))).)))))....)))).))..))))).......((((......))))))))))...))...).)))).))))))))).........)))...))))))))..))))))....)).))))))))))))....(((((..(((((((..(.(((..........))).)..))))))).)))))((((.(((((........................)))))))))...))))))..)))))))))).))).))))..))))...))))..))))))))...(((((..((((((((((((.(......).)))..........))).)))))).....))))).....)).))).)))))))))))).))))).))).))).)).(((((((((((((..........(((.(.((((((((....))))..............((((((((..(((...(((...........)))...)))..)).)))))).((....)))))).).)))..........)))))))))))))..)))))...))).))))))))((...((((((((((((.....))))))(((.((.((((.((((...)))))))).))))))))))).....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((....{{{.((.((((....))))(((((((((((.(((.((((((.(((.....{(..(((((((......))))))).})))))))))).)))...))))))))},))...(((((((.{(({{{((((.{{(({(,{{,,{{({...,||.,,.||||||....,,,|}}}}},{{.{||}||,.,{{||||{({{.{{{||{{,((((({....,|}||||..,{,,.,(((,......}|||{{||||..,}|,,{..||,{||||},{|||||,,,|{{|||||,.,,)))))))}.....))))}}....,,,......................}}..,...}})}}}}|||{(({...||,(,{{{{{{,,(((((...({{.,(((....))}}}}}})))|((((({.,..}}}}}}|..((((((((.((((.((((....})))..))))))).)))))........{((((((...))))))|(((....))),{{,,....,|{{||{{(|{,({{{..{{{{||||||||{{{{(({{{,....,{((((..(((({{,(,..{(((((,,,,,...}}}|||,|,.}}}},{|||},..,|}}}|.,{{,{|||,,....)))))|)||)},,...})))))),..,}))}||)))).||{||||||.{{((((((...,,{||,,({{|..},{||(((((..(((((((((((((((,........,,....))...{((((........{{(({.{{...,,..,.(((.........))}.,..{|,...||...})})).......)))))}.)))))))))))))))..))))}.....{(((((((((((((.((.((((((({,,,.,{{..{(((.....(((((.{,{((((((((((((...((((....(((((((..((....)).))))))))))).)))))))))))))).)))))....)))}.,|{{|,|||{...}}}|,||}}...,}}})))))))...))...)}}))).))))))))},,},..,,,}}},.,})))))||{{({(,......,.{{||{|,,|||||{{..(((((.,(((((((.,{,{{(,......,,.))).,..)))))))}))))),,,},||,,...,,,........,,,...{{{{{||,|{{{,,...,,)))).,))))))),,,.}}},))}.))))))....,,,..)))))))|....,,,|,.}}}}}}}}.{||,{.....,).)))....,|,...}}}.,)))}}.....,,..|||...,}.},}..))),))))))}}),})),,..))))))).(((((((((((((.....,,,..(((.(.((((.((,....||||{.....{,,.,..,(((.,,.,}}||,.,,|||.....,{{{{{{{.........)))))})))}))}...}))))).).)))......},..)))))))))))))..)))))...))))))})))))((...{(((((((((((.....)))))){{(,((.((({{((((...)))))))).))))))))))}...,.))
Back