Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HECTD1_0040400
Sequence Length
466 nt
GC Content
0.3970
CCUUUGAAGUAAAUUUUAUGGAUGAUGUAGGUCAGACUCUAUUAAACUGGGCCUCUGCUUUUGGAACUCAGGAAAUGGUAGAAUUUCUUUGUGAGAGAGGUGCAGAUGUUAAUAGAGGUCAAAGGUCAUCAUCAUUACAUUAUGCUGCAUGUUUUGGAAGACCUCAAGUAGCAAAGACUCUGUUACGGCAUGGUGCAAAUCCAGAUCUGAGAGAUGAAGAUGGGAAAACUCCAUUAGAUAAAGCUCGAGAAAGGGGCCAUAGUGAAGUGGUAGCUAUUCUUCAGUCUCCAGGUGAUUGGAUGUGUCCAGUUAAUAAAGGAGAUGAUAAGAAAAAGAAAGAUACAAACAAAGAUGAAGAAGAAUGUAAUGAGCCCAAAGGAGAUCCGGAAAUGGCACCCAUAUACUUGAAAAGGUUAUUGCCAGUGUUUGCACAAACAUUUCAGCAAACUAUGCUGCCUUCAAUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-116.8 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -125.53
Frequency: 0.0000
Diversity: 81.85
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.(((((.....(((((.(((((.........(((((((((.(((.((((((.(((.....((..(((((((......))))))).))))))))))).)))...))))))))).........)))))((((((((((.((((((.((....((....)).)).))))))....((((.(((.(((.(((.(((.(((((((((((.(((((((((((((....(((.(((((......((((.......))))..))))).))).....))).)))))).)))))))))..)))))).)))))))))..))).)))).......................................))))))))))(((....((....))......)))..))))))))))..)))))((((((.((((((((((............))))))...))))....)))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
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