Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HECW2_0006300
Sequence Length
521 nt
GC Content
0.5106
AGUGCCUACCGCAUGUUUACAAACAACACGUGUUUGAAGCACAUGAUCACCAAAGUCCGGAGGGACACCCACCACUUUGAACGCUACCAGCAUAACCGCGACCUUGUGGGAUUCCUCAACAUGUUCGCGAACAAACAGCUAGAGCUGCCGCGGGGAUGGGAAAUGAAACAUGAUCACCAGGGCAAGGCAUUCUUUGUGGACCACAACUCCCGCACCACCACUUUCAUUGAUCCCCGGCUCCCACUUCAGAGCAGUAGACCCACAAGUGCGCUGGUUCAUCGGCAACACCUGACAAGGCAACGCAGCCACAGUGCGGGUGAGGUAGGAGAAGAUUCUCGACAUGCAGGACCACCAGUUCUUCCCAGGCCAUCCAGUACAUUCAAUACAGUCAGUAGGCCACAGUACCAGGACAUGGUUCCAGUGGCUUACAAUGACAAGAUUGUUGCAUUUCUACGUCAACCCAAUAUCUUUGAAAUUCUACAGGAGCGUCAACCUGAUCUUACCAGGAAUCACUCACUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-137 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -147.18
Frequency: 0.0000
Diversity: 128.28
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.......(((((((.((((((.....)))))).)).))))).....((((((..((.(((...))).)))))))).(((((.((........(((((.(.((((((....))).))).).)))))......((((....))))...(((((((.(...((((((..((.......(((........(((....)))........))).......)).))))))).)))))))((((........)))).(((((....((((.((((((.....((((......))))...(((......))).))))))((((((.((((((((....))))...((((((((...((...........))...)))........((((...(((((((((((((...((((.....))))....)))))))))..))))...)))).)))))..)))).)).))))......))))....))))).)))))))...((((.......))))...))))(.....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.,,,,,.(((((({.((((((.....)))))).}}.))})).....((((((..((.(((...))).)))))))).,,(((.({,||..,{{((((..((((((((....,||.,|.{{{{|,,,,,,...((((....))))...(((((((.(...((((((..,{.......(((...{{...,|,,{{{||,.,.,....})),......,,.))))))).)))))))((((........)))).},.}})))))))).|))),)))}..,,|||..{,{(({|,..(((......)))...))})|||||,}||||((((....})))...,{{{{((({.....}}}}}.....||{..|||.{{{..,,(({,...(((((((((((((.,.((((.....))))....)))))))))..)))).,,||}|{|||,,..,,,,.,}}}},},,.,,,,}}}},..,.}}}.)))},))}..((((.......))))...))))(.....)
Back