Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HIPK2_0005500
Sequence Length
679 nt
GC Content
0.4742
GGCCCCUGAGAUCAUCCUUGGUUUACCAUUUUGUGAGGCAAUUGACAUGUGGUCCCUGGGCUGUGUUAUUGCAGAAUUGUUCCUGGGUUGGCCGUUAUAUCCAGGAGCUUCGGAGUAUGAUCAGAUUCGGUAUAUUUCACAAACACAGGGUUUGCCUGCUGAAUAUUUAUUAAGCGCCGGGACAAAGACAACUAGGUUUUUCAACCGUGACACGGACUCACCAUAUCCUUUGUGGAGACUGAAGACACCAGAUGACCAUGAAGCAGAGACAGGGAUUAAGUCAAAAGAAGCAAGAAAGUACAUUUUCAACUGUUUAGAUGAUAUGGCCCAGGUGAACAUGACGACAGAUUUGGAAGGGAGCGACAUGUUGGUAGAAAAGGCUGACCGGCGGGAGUUCAUUGACCUGUUGAAGAAGAUGCUGACCAUUGAUGCUGACAAGAGAAUCACUCCAAUCGAAACCCUGAACCAUCCCUUUGUCACCAUGACACACUUACUCGAUUUUCCCCACAGCACACACGUCAAAUCAUGUUUCCAGAACAUGGAGAUCUGCAAGCGUCGGGUGAAUAUGUAUGACACGGUGAACCAGAGCAAAACCCCUUUCAUCACGCACGUGGCCCCCAGCACGUCCACCAACCUGACCAUGACCUUUAACAACCAGCUGACCACUGUCCACAACCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-162.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -175.89
Frequency: 0.0000
Diversity: 190.56
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.............))(((((.........((((.((((.(((.(((((..((((((((((((((((((((((....((((((((((..........))))))))))(((((.((.((((...((((((((.......(((((.....)))))..))))))))....)))).)).)))))..((((((......))))))...((((...))))............((((((((..((((.......))).)..))))))))....(((.........)))...........((((......))))..))))...)))))))))))))))).))))))).)))(((..((((((((..(.(.((.((((((.((....((((..(((((((..........))))))).....(((((((((...((.(((((....(((((((.......(((......)))..........(((((...))))).........)))))))....)))))))...)))....((.(((((((.....))))))).))..))))))((((.(...(((((((...(((.............)))....)))).)))....).)))).))))...)).)))))).))..).)..)))))..)))....))).....)))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((....,{..,,{{.|}{((|{{,,{.....{{{|,|,||.,{({({,{({{((((((((((((((((((((((....((((((((((..........)))))))))){{(((,((,({((,..{{{{||||,,,,,,.{{{{{...,,}}}}},,))}}}}}}....}))}.)).}}||,..{(((((......)))))}...|||{|,,,}}|.,{,.{{...{{((((((((..{(((.......))).)..))))))))..},..,.))),,,..))),....||||..((((,....,))))..}))),..)))))))))))))))).,,,,,||.,{{(((..,{((,{(({{({,.(,,((((((,(,....{||{.,||||||,.}}}}.....}}|||||,,,..(((,,((((...((.(((((....(((((((.......{{{......,)}..........(((({...})))).........)))))))....)))))))...)))}.,}|,.(((((((.....))))))).,},..|}|||((((.....,({,,{,...((({,....{.,....,,,.,,}))))},}|.||||{,},,.,,}),}})}.}}}})),)),}}.}..})))),,}}.,,..}}),}}}}))))}}}))})})
Back