Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_IARS_0005700
Sequence Length
771 nt
GC Content
0.4514
GGUGAAAAUGGGAUGGAGGAUUGUGUCAUGGCCCUAGAAACCUUGUUUAGUGUUCUGCUUUCUCUUUGCAGACUUAUGGCUCCCUACACACCUUUUCUCACUGAAUUGAUGUACCAGAAUCUAAAGGUGCUGAUUGACCCUGUUUCUGUUCAGGACAAGGACACACUCAGCAUUCACUACCUCAUGCUGCCCCGUGUUCGAGAAGAAUUGAUUGACAAGAAAACAGAGAGUGCAGUAUCUCAGAUGCAGUCUGUGAUUGAACUUGGAAGAGUGAUCAGAGACCGAAAAACUAUUCCCAUAAAGUAUCCUUUGAAAGAAAUUGUGGUUAUCCAUCAAGAUCCAGAAGCUCUUAAAGAUAUCAAGUCUUUGGAGAAGUAUAUCAUUGAGGAACUCAAUGUUCGAAAAGUUACACUGUCUACAGAUAAAAACAAGUAUGGCAUUCGGCUAAGGGCAGAACCAGAUCACAUGGUCCUGGGGAAGCGUCUGAAGGGAGCCUUUAAGGCAGUGAUGACGUCCAUCAAGCAGUUGAGCAGUGAGGAGCUGGAGCAGUUCCAGAAGACUGGGACCAUUGUUGUGGAAGGCCAUGAAUUGCACGAUGAAGACAUCCGCCUCAUGUACACCUUUGAUCAGGCCACAGGUGGGACUGCGCAAUUUGAAGCACACUCAGAUGCUCAGGCUUUGGUCCUCUUAGAUGUCACUCCUGACCAGUCAAUGGUAGAUGAAGGAAUGGCUCGGGAAGUCAUCAAUCGCAUACAGAAACUUCGCAAAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-208.3 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -223.77
Frequency: 0.0000
Diversity: 155.44
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((...(((((.((((..(((((((((((((((((((.......)))))((((((((((.(((.((((...((((.((((((((.(((((((((.....(((...........))).....))))))).))(((((((((((((((..((((..(((((((((...((((((..........))))))....))))))........))).))))..)).)))))).).)).))))...((((((((.((((.(((((..((((....))))))))).))))..........(((((.........((((((...((..((((((....))).)))..))......((((.((((((.....))))))))))........(((((((...))))))).(((((..((((.(((.................))).)))).))))).))))))(((.((((.......)))).))))))))))))))))))))))))..))))((..(((((.....))))).))......)))).))))))).))))))(((((((....)))))))(((....)))...)))))))....))))))).......)))).)))))...))))(((....((((((.((((....(((.(((.(((((.......)))))))).)))))))))).)))....((.((((.((((.((((.....))))......)))).))))))(.(((((..((...........)).))))).)...)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((...(((((.((((..((((((((((((((((({(.......}}}}}((((((((((((((.((((.,,(({{.((((((((.{{(((((((.....(((.......,...))).....})))))),||((({{({(((((((({,((((..{,,((((((...((((((..........))))))....))))))........))).}}))}.))))))))).).)).))))...((((((((.((((.(((((..((((....))))))))).))))..........(((((.....,...,{{{{{...((..((((((....))).}))..)).....,((({{((((((.....))))))))))..,,....(((((((...))))))).|{{{{..((({.{((((,,..........,,.,)).}))).})))}}},,}}}(((.((((.......)))).)))))))}))))))))))))))))..}}}}((..(((((.....))))).)),,,}..)))).))))))).)))))){((((((....))))))|(({....}))}..))))))),...})))))).......)))).)))))...))))((({{,,{(((({.(({{....{((.((,,(((({.,....,)))))))).}})))))))))).,....(({(,{{.(((({((((.{(..|.,......,.,)).))),))|}||,||}}}}...........},..,,,,,}...)))
Back