Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_IRF4_0000100
Sequence Length
271 nt
GC Content
0.6937
UGCAGAGCAGAGCGGGCGGAGGACCCCGGGCGCGGGCGCGGACGGCACGCGGGGCAUGAACCUGGAGGGCGGCGGCCGAGGCGGAGAGUUCGGCAUGAGCGCGGUGAGCUGCGGCAACGGGAAGCUCCGCCAGUGGCUGAUCGACCAGAUCGACAGCGGCAAGUACCCCGGGCUGGUGUGGGAGAACGAGGAGAAGAGCAUCUUCCGCAUCCCCUGGAAGCACGCGGGCAAGCAGGACUACAACCGCGAGGAGGACGCCGCGCUCUUCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-108.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -112.15
Frequency: 0.0017
Diversity: 41.99
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((..((...((((.((...(..((((....))))..)...)).).)))...)).)).)(.(((((((((.((((...(((((((..(((.(..((..(((((....))))).)).).)))..))))))).((.((((.((((.....)))))))).)).......(((((..(((((((((((...............))))))))))).))))).....(((((................)))))........))))))))))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((..((...((((.((...(.,((((....))))..)...)).).)))...)).)).)(.(((((((({((({(,..(((((((..(((.(..((..(((((....))))).)}.).)))..))))))).((.((((.((((.....)))))))).))..,,..,(((((..(((((((((((...............))))))))))),))}))..,|.(((((....,.....,,....)))))....,,.}))))))))))))).)
Back