Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_KIAA1244_0001500
Sequence Length
551 nt
GC Content
0.5064
AAGCUUCUGUCGGAAGAGAGGUUUGUAUCCAUGGAAACAGAUUCUGAUGAGAAGCAGCUGCUCAAUCAGAUACUGAAUGCCGUGAAAGUGACGCCUUCGCUCAACGAGGACCUGCAGGUGGAAGUGAUGAAGGUUUUACUAUGCAUCACCUACACGCCAACAUUUGAUCUGAAUGGGAGUGCCGUGCUGAAGAUCGCGGAGGUGUGCAUUGAGACGUACAUAAGCAGCUGUCACCAGCGUAGCAUAAACACUGCUGUGCGGGCAACUCUCAGUCAAAUGCUGAGUGACUUGACUUUACAGUUACGACAGAGGCAGGAGAAUACGAUAAUUGAAAACCCAGAUGUCCCACAGGAUUUCGGGAAUCAAGGGUCAACAGUAGAGUCCCUCUGUGAUGAUGUUGUCUCUGUACUCACCGUCCUGUGUGAGAAGCUGCAAGCCGCCAUAAAUGACAGCCAGCAGCUGCAGCUUCUCUACCUGGAGUGCAUCCUGUCUGUGCUCAGCAGCUCCUCCUCCUCCAUGCACCUGCACAGGCGCUUCACGGACCUGAUCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-176.5 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -186.4
Frequency: 0.0000
Diversity: 132.72
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((((......((((.(((((.(((((...(((..(((((((((.((...)).))).))))))..)))....)))))..(((((.(((((((.(((.(....(((....)))....))))))))))).))))))))))..))))...(((((.((((((((.....((((((((((..((((..(((.((....((((((........)))))).....)).)))..))))...(((((........))))).))).))))))))))))))).)).)))...(((((....)))))))))))))))...(((....((((.(((......))).)))).(((((((...(((((....((((.(((((((((((...)))))).....))))).))))....)).)))))))))).(((((((((((.((.((...............)).)))))))))))))..((((((((((.......((((((...(((...............)))....)))))))))))))).))......))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.(((({{(({.,,{{(({,,,,...(((((...(((..(((((({{(.{(,..,,,))).})))))..)))....)))))..{((((.,,..|}))}....(((((.((((.((((...((((((.{(,,....))...)))))).,.}.}}}|,.((((((((.....((((((((((.{((((..(((.((,...((((((........))))))...,.)).)))..))))},,((({{.....,,,))))).))),,)))))))))))))).}}.(((((,{(......})))))){{{{,((((((((,....,((((.{((......))}.)))).(((((((...(((((....((((.(((((,{((((...})))},.....))))).))))....)).)))))))))).((((((((((,,((.((...............)).)))))))))))))...,,||,}}|,.)))))))).)),)).)))).)))))}}),)),.,{|.,},)})}))).)))){|,||,.....})))
Back