Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_KIAA1244_0001900

Sequence Length

314 nt

GC Content

0.4841

GUUUUACUAUGCAUCACCUACACGCCAACAUUUGAUCUGAAUGGGAGUGCCGUGCUGAAGAUCGCGGAGGUGUGCAUUGAGACGUACAUAAGCAGCUGUCACCAGCGUAGCAUAAACACUGCUGUGCGGGCAACUCUCAGUCAAAUGCUGAGUGACUUGACUUUACAGUUACGACAGAGGCAGGAGAAUACGAUAAUUGAAAACCCAGAUGUCCCACAGGAUUUCGGGAAUCAAGGGUCAACAGUAGAGUCCCUCUGUGAUGAUGUUGUCUCUGUACUCACCGUCCUGUGUGAGAAGCUGCAAGCCGCCAUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-86.7 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -91.83

Frequency: 0.0002

Diversity: 68.93

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((..(((((.(((((.(.(((........(((((..((((.....)))).....)))))))))))))))))))))))))........(((((((((((((((((.(((((........))))).(((........)))..)))))).))))).(((((....)))))..((((((((((.(..((..(((..((((...(((.((.((((....)))).)))))..))))..))).((((.((.....)))))).))..).)))))))))).(((((........))))).)))))).............

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((..(((((.(((((.(,({(,..,,,,,{{{{{,,||||,.,,,||||,....}})}))))))))))))))))))))).,......((((((((,,((,((((((((.......}))))))).||,..,.,{(({{.....))))}|||||.{({{,...,))))),.((((((((((.(..{{.,({{..((((...(((.((.((((....)))).)))))..))))..))}.,(({.{(,,...)))))),})..).)))))))))).((((({.....}.))))).)))))).............