Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_KIAA1244_0002900
Sequence Length
1463 nt
GC Content
0.5632
UGACAGCCAGCAGCUGCAGCUUCUCUACCUGGAGUGCAUCCUGUCUGUGCUCAGCAGCUCCUCCUCCUCCAUGCACCUGCACAGGCGCUUCACGGACCUGAUCUGGAAAAACCUCUGCCCUGCUCUCAUCGUGAUCUUGGGGAAUCCAAUUCAUGACAAAACCAUCACCUCUGCUCACACCAGCAGCACCAGUACCAGCCUGGAGUCGGACUCUGCGUCUCCGGGAGUGUCUGACCACGGCCGAGGAUCAGGCUGCUCCUGCACUGCGCCGGCCCUGAGCGGACCUGUGGCUCGGACUAUCUAUUACAUCGCAGCCGAGCUGGUCCGGCUGGUGGGGUCUGUGGACUCCAUGAAGCCCGUGCUCCAGUCCCUCUACCACCGAGUGCUGCUCUACCCCCCACCCCAGCACCGGGUGGAAGCCAUCAAAAUAAUGAAAGAGAUACUUGGGAGCCCACAGCGUCUCUGUGACUUGGCAGGACCCAGCUCCACUGAAUCAGAGUCCAGAAAAAGAUCAAUUUCAAAAAGAAAGUCUCAUCUGGAUCUCCUCAAACUCAUCAUGGAUGGCAUGACCGAAGCAUGCAUCAAGGGUGGCAUCGAAGCUUGCUAUGCAGCCGUGUCCUGUGUCUGCACCUUGCUGGGUGCCCUGGAUGAGCUCAGCCAGGGGAAGGGCUUGAGCGAAGGUCAGGUGCAACUGCUGCUUCUGCGCCUUGAGGAGCUGAAGGAUGGGGCUGAGUGGAGCCGAGAUUCCAUGGAGAUCAAUGAGGCUGACUUCCGCUGGCAGCGGCGAGUGCUGUCCUCAGAACACACGCCGUGGGAGUCAGGGAACGAGAGGAGCCUUGACAUCAGCAUCAGUGUCACCACAGACACAGGCCAGACCACUCUCGAGGGAGAGUUGGGUCAGACUACACCCGAGGACCAUUCGGGAAACCACAAGAACAGUCUCAAGUCGCCAGCCAUCCCAGAGGGUAAGGAGACGCUGAGCAAAGUAUUGGAAACAGAGGCGGUAGACCAGCCAGAUGUCGUGCAGAGAAGCCACACGGUCCCUUACCCUGACAUAACUAACUUCCUGUCAGUAGACUGCAGGACAAGGUCCUAUGGAUCUAGGUAUAGUGAGAGCAAUUUUAGCGUUGAUGACCAAGACCUUUCUAGGACAGAGUUUGAUUCCUGUGAUCAGUACUCUAUGGCAGCAGAAAAGGACUCGGGCAGGUCCGACGUGUCAGACAUUGGGUCGGACAACUGUUCACUAGCCGAUGAAGAGCAGACACCCCGGGACUGCCUAGGCCACCGGUCCCUGCGAACUGCCGCCCUGUCUCUAAAACUGCUGAAGAACCAGGAGGCGGAUCAGCACAGCGCCAGGCUGUUCAUACAGUCCCUGGAAGGCCUCCUCCCUCGGCUCCUGUCUCUCUCCAAUGUAGAGGAGGUGGACACCGCUCUGCAGAACUUUGCCUCUACUUUCUGCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-548 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -569.1
Frequency: 0.0000
Diversity: 216.77
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((...(((.((.(((.........))).)))))...)))))..((((((((..(((((..(((((..((.....((...(((((((...((((.((.(((((.....((((((((((((((((.((((((..((((.....)))).))))))..............(((((......)))))........(((((..((((((((.(((...((((((((((((((((((((........)).)))))).))))))((...))(((((((......(((((...(((((((.((..............)))))))))))))))))))))(((((((.(((.((((((..(((((((.((.((((.((((..(((((..((((((...............))))))..)))))(((((.(((......))).((((((.(((((....))).)).))))))..(((...(((((((.(.(((...........(((((((((...((((...((((.....))))))))..)))))).)))........((((...))))(((((.......))))).....(.((((((........)))))).)))).).))))))))))..(((((....)))))((((((.((....)).))))))....))))).....(((((((((.(((.....))).)))).))))))))).)))).)).)).)))))..))))))))))))))))..))))))....))).)))))))).)))))..((((((.((((((....)))..))).))))))))))).)))))..).))))).(((((((........)))(((((......)))))))))..((((((((((....))))))..))))........((((((.....))))))...))...))).)))))).))).)))).)).....)))))))..)))))..)))))))).(((.(((((.((((.((((((((....((((.((((((.(..(((..(((....)))..)))..).))))))........(((((.(((....))))))))....((((((.((.(((.(((...((.((.((.......)).)).)).))).))).))...))))))(((((((((((.....)))))).))))).)))).((((....(((((.((((((..(((..(((((...((((((.(.((((....))))...).)))))).......)))))..)))..))))))........)))))))))...)))))))))))).))))).))))((((((((...(((((((((((.(((.(((((((((((((....))))..)))))..((((.........))))..(((((.(((((........))))).))))).)))).))).))..)))))))))...))))..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({((((...(({{{(,(((,{,,.....}}),))))),..))))),,{(((((((..(((((..(((((..((,....||...(((((((...((({{((.(((({.....(((((,((((((((((.((((((..((((,...,)))).))))))..............(((((......)))))........(((((..((((((((.(((...((((((((((((((((((((........)).)))))).)))))){{...}}(((((((......(((((...(((((((.((..............)))))))))))))))))))))(((((((.(((.((((((..(((((((.((.((((.((((..(((((..((((((...............))))))..))))),,{((,((,......}}}.((((((.(((((....))).)).))))))..{{{...(((((((.{.(({,,..{{,....(((((((((...((((...((((.....))))))))..)))))).))).,,....,||{,...||||{((((.{....|)))))|,|..(,((((((........)))))),)))).).)))))))))).{(((((....)))))){{{{|.|{.,,,||,||}}},....)))}}}}}}.(((((((((.(((.....))).}))).))))))))).)))).)).))))))))..))))))))))))))))..))))))....))).)))))))).)))))..((((((.((((((....)))..))).))))))))))).)))))..,.))))).(((((({........,,,(((((......)))))))))..((((((((((....))))))..))))........((((((.....))))))...,}...})).)))))).))).)))).}}.....,.)))))..)))))..)))))))}.(((.(((((.((((.((((((((....((((.{(((({,(,,(((..(((....)))..))}..,,|||||}........{{{||,|||....)))))})),,..((((((.((.(((.(((...((.((.((.......)).)).)).))).))),),...))))))(((((((((((.....)))))).))))).)))).((((....(({({|((((((.,(((..(((((.,.((((((.(.((((....))))...}.)))))).....,.)))))..))),.)))))).||...,,)))))))))...)))))))))))).))))).))))((((((((...(((((((((((.(((.(((((((((((((....))))..)))))..((((.........))))..(((((.(((((........))))).))))).)))).))).))..)))))))))...))))..))))
Back