Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0006100
Sequence Length
1032 nt
GC Content
0.4099
AUCUUGGCAUAUACAGAAGGGCUGCAUGGAAAAUGGCUGUUCACAGAGAUACGAUCAAUCUUUUCUCGUCGUUAUCUUUUGCAAAAUACAGCCCUGGAGAUCUUUAUGGCAAACAGAGUUGCUGUGAUGUUCAACUUCCCAGACCCUGCAACAGUAAAGAAAGUGGUUAACUAUCUACCUCGUGUUGGCGUUGGAACAAGUUUUGGAUUGCCUCAAACCAGACGUAUUUCAUUAGCUAGUCCACGUCAGCUUUUUAAGGCUUCUAAUAUGACCCAGCGAUGGCAACACAGAGAGAUAUCUAAUUUUGAGUACUUGAUGUUUCUCAACACGAUAGCAGGACGGAGUUAUAAUGACUUAAAUCAGUAUCCAGUGUUUCCUUGGGUCAUCACUAAUUAUGAAUCAGAAGAACUGGAUCUUACCUUGCCCACCAACUUCAGAGAUUUGUCCAAGCCAAUAGGAGCUCUGAACCCAAAAAGAGCAGCAUUCUUCGCUGAGCGUUAUGAAUCAUGGGAAGAUGAUCAAGUUCCAAAGUUUCACUAUGGUACUCAUUACUCAACUGCAAGUUUUGUUCUUGCAUGGCUGCUAAGAAUAGAACCCUUUACAACUUAUUUCCUAAAUUUGCAAGGAGGCAAAUUUGAUCAUGCAGAUCGAACUUUUUCAUCAAUUUCCAGAGCUUGGCGAAACAGUCAGCGUGAUACCUCUGAUAUUAAGGAGUUGAUCCCUGAAUUUUAUUAUCUCCCUGAGAUGUUUGUCAACUUCAAUAAUUAUAAUCUUGGAGUGAUGGAUGAUGGGACAGUAGUGUCUGAUGUCGAACUUCCUCCUUGGGCCAAAACCUCAGAAGAAUUUGUUCACAUAAACAGAUUGGCCCUGGAGAGUGAAUUUGUUUCCUGCCAGCUUCACCAAUGGAUUGAUCUCAUUUUUGGCUAUAAACAGCAAGGACCAGAAGCUGUCCGAGCCCUCAAUGUGUUCUAUUACUUGACCUAUGAAGGAGCUGUCAAUCUGAAUUCAAUAACUGAUCCUGUGUUGAGAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-263.7 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -283.88
Frequency: 0.0000
Diversity: 318.33
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((..(((.(((((((...((((...((((((....(((((((((((............)))).)))))))........)))))).((((.(((...(((((((......)))))))))).))))..))))))).))))..........(((.(((.....))).))).......((((((((.(((.(.((((.((((.(((.((......)).))).))))..)))).)))))))))))).......(((((((.(((.(..(.((.(((((.((((((((((((((((...............)))))))))).....((..((.(((((((((((...)))))......((.(((((((.((((..(((.((((........)))).))))))).)))))))))..((((((...((((.....((((((.(((((..((....)).(((((..........))))).......((((((((((........((.(((((((((((..((((((...((((.....(((.....))).....))))....((((((((((((((....))).)))))))))))...................((((((((......))))))))((((.....))))))))))..)))))..))))))))))))))))))...(((((.(......).))))).....(((((((((.............((((((...))))))...)))))))))...............(((((....(((.((.(((((....))))).)))))..)))))((((..((((((.............(((((((......))))))))))))).)))).(((((.(((........))).)))))...))))).))))))....)))).........))))))........))))))..))..))..))))))))))).)).)..))))..)))))))...................)))....))))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((({{..{{{.(((((((...((({...((((((...{(((((((((((.,..........))))},))))))})......)))))).{(((,({{.{{(((((((......)))))))))},}))}..})))))).}}}|{{..,,{{.,(((,,(({{...,,}.})},},((,((((((({((((,,({((((,((((.{((,(,,,,.,.||{||}.},|,..,,,,.)},,)))))|||{,,...}))),|||,,.{{{{{({((.,,,{|,{{{{|.((((((((((...............)))))))))),{{|,{{{,{{.{{,..((((({...})))))...,,,|}|||{,||}||{|.,|||}||||........}}}}.||}||||.,}|||,}},..,,,,{,...,|,,,,}}.||||||}||||||}|},,}},)}(((((..........)))))....,,,||{||||{||,....,..{|.((((({(((((..((((((.,.(((...,,,.|||.|,,.....,....{{{{,.((((((((((((((....))).)))))))))))..................,((((((((......))))))))|,,{.}}}})}},))))))..)))))..})))))||||}|||||||,,,{((((.(.{{{..|{||,,,.....|||}.,,|})}})}}.......{(((((...)))))|{{{(((||((((({...........}))))))))))|||.((.(((((....))))).))}}}.,,,{||((((,.((((((............,{((((((......))))))))))))).))})}},|||.|}}}})),,),}})})},.....}||||,|||}}|....,}||{{.....,|||,,||,..,,..,))))}}.||||{{{,{|||{,||...,.,,,)}|,},},.))),))))})}}}}}}..,|||.,..}}}....))))))))))...
Back