Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0008300
Sequence Length
1306 nt
GC Content
0.4296
UCGUCCUCUUGAGUUCUGGCGCCUUGACUACUGGGAAGAUGACUUGCGGCGCCGGCGACGAUUUGUGCGUAACCCUCUAGGAUCGACACAUCCUGAAGCGACACUAAAAACAGCCGUGGAACAUGUGUGCAUUUUUAAAUUGAGAGAGAACAGCAAAGCCACAGAUGAAGAUAUCCUUGCUAAAGGAAAACAGUCCAUCAGGAGUCAGGCUUUAGGAAAUCAGAACUCAGAAAACGAGAUCCUCCUGGAAGGCGAUGAUGAUACUCUGUCAUCCGUGGAUGAGAAAGAUUUAGAGAAUCUUGCCGGUCCUGUUAGCCUGAGCACACCAGCUCAGCUUGUGGCCCCCUCUGUUGUAGUAAAGGGCACUCUUUCUGUCACCUCCUCCGAACUCUAUUUUGAGGUGGAUGAAGAGGAUCCUAACUUCAAAAAAAUCGACCCCAAGAUCUUGGCAUAUACAGAAGGGCUGCAUGGAAAAUGGCUGUUCACAGAGAUACGAUCAAUCUUUUCUCGUCGUUAUCUUUUGCAAAAUACAGCCCUGGAGAUCUUUAUGGCAAACAGAGUUGCUGUGAUGUUCAACUUCCCAGACCCUGCAACAGUAAAGAAAGUGGUUAACUAUCUACCUCGUGUUGGCGUUGGAACAAGUUUUGGAUUGCCUCAAACCAGACGUAUUUCAUUAGCUAGUCCACGUCAGCUUUUUAAGGCUUCUAAUAUGACCCAGCGAUGGCAACACAGAGAGAUAUCUAAUUUUGAGUACUUGAUGUUUCUCAACACGAUAGCAGGACGGAGUUAUAAUGACUUAAAUCAGUAUCCAGUGUUUCCUUGGGUCAUCACUAAUUAUGAAUCAGAAGAACUGGAUCUUACCUUGCCCACCAACUUCAGAGAUUUGUCCAAGCCAAUAGGAGCUCUGAACCCAAAAAGAGCAGCAUUCUUCGCUGAGCGUUAUGAAUCAUGGGAAGAUGAUCAAGUUCCAAAGUUUCACUAUGGUACUCAUUACUCAACUGCAAGUUUUGUUCUUGCAUGGCUGCUAAGAAUAGAACCCUUUACAACUUAUUUCCUAAAUUUGCAAGGAGGCAAAUUUGAUCAUGCAGAUCGAACUUUUUCAUCAAUUUCCAGAGCUUGGCGAAACAGUCAGCGUGAUACCUCUGAUAUUAAGGAGUUGAUCCCUGAAUUUUAUUAUCUCCCUGAGAUGUUUGUCAACUUCAAUAAUUAUAAUCUUGGAGUGAUGGAUGAUGGGACAGUAGUGUCUGAUGUCGAACUUCCUCCUUGGGCCAAAACCUCAGAAGAAUUUGUUCACAUAAACAGAUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-348.9 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -376.52
Frequency: 0.0000
Diversity: 271.16
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..(((.(((((((((((((..........(.(((....))).))))))((....))...((((((...((.....))..)).))))((((((((((((.............((((......(((.(.((((((...)))))).).)))......))))...........(((((....)))))......(((....))))))..)))))))))...)))))))))))..))))((((((((((...(((...(((((..(((((......((((.((((.(((((((...)))))))....(((((((((..((((((......))))))(.((((((((..(((((((.(((..((((..(((((.(..(((((((................)))))))..))))))..)))).))).))............((((....)))).....))))).)))))))).)......((((((....(((((((((((............)))).)))))))........))))))((((.((...(((((((((......))))))))).........))))))....(((....))).(((.(((.....))).)))...((((((((((((.(((.(.((((.((((.(((.((......)).))).))))..)))).)))))))))(((((....)))))((......))....((....))......((((((((((...............)))))))))))))))))))))))))).((((((...)))))).....((.(((((((.((((..(((.((((........)))).))))))).)))))))))...)))).))))......)))))..)))))...)))..))))))...............((((((.(((((((..((((.(((.((.....(((((((((((....((.(((.(((...))).))).)))))))............((((((((((((((....))).)))))))))))..............))))))....(.((((((((.((.(((((.(((.(((((...(((.((((((((...((((..((((.(.((....(((((.(......).))))).....(((((((((.............((((((...))))))...)))))))))...........)).).))))..)))))))))))).)))...))))))))))))).)))))))))).).)).)))))))))))))))))))).........)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((..((,,(((((((((((((..,.,..,,,{.,||....}}}.,)))))|{,,..}|...((((((...,{.....)}.,)).)}}}((((((((({{{.,,..........((((....,,(((.,.(((((,...,})))),,.))).,,...)))).|,||......(((((....)))))......|||,,,.)}})))..)))))))))...}))))))))))..))))|{{{{(((((...(((...(((((..(((((......((((.{(((.(((((((...))))))).{(.((((((((({.((((((......))))))|,((((((((..(((((((.(((..((((..(((((({..(((((((....,,..........)))))))..))))))..)))).})}.}}............((({....}))).....))))).)))))))).,......((((((...{(((((((((((.,..........))))},))))))})......))))))((((,((.{.(((((((((......))))))))).}.}}....)}))))...,((,...,)},.{((.(((.....))).)))...((((((((((({{(({,(.((((.((((.(((.((......)).))).))))..)))).)))))))))(((({....})))){{......},.{{,,,..,}),......((((((((((...............))))))))))}))))))}))))))))})(((({...})))),.....{(.(((((((.{(((..(((.((((........)))).))))))}.)))))))}}...)))}.))))......)))))..)))))...)))..)))))|{{{(..........}||||,{.{{(((({.{((((.(({.{(..,,,(((({{({(({...(((.(((.(((...})).))).})),,,,........,...((((((((((((((....))).)))))))))))..............,},}}},,..{.((((((((.{{.(((((.(((.(((((...(((.((((((((...((((..({{(|(|{{....{((((.(.,....}.}}}}}.....((({{{{{|,,..,,,......{(((((...))))))}}}))))}||||,,.........,,,),))))..)))))))))))).)))...))))))))))))).}))))))))).}.}}.))))))))))))}||||||,.....,}}})))).
Back