Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRBA_0012500

Sequence Length

892 nt

GC Content

0.4462

UCGUCCUCUUGAGUUCUGGCGCCUUGACUACUGGGAAGAUGACUUGCGGCGCCGGCGACGAUUUGUGCGUAACCCUCUAGGAUCGACACAUCCUGAAGCGACACUAAAAACAGCCGUGGAACAUGUGUGCAUUUUUAAAUUGAGAGAGAACAGCAAAGCCACAGAUGAAGAUAUCCUUGCUAAAGGAAAACAGUCCAUCAGGAGUCAGGCUUUAGGAAAUCAGAACUCAGAAAACGAGAUCCUCCUGGAAGGCGAUGAUGAUACUCUGUCAUCCGUGGAUGAGAAAGAUUUAGAGAAUCUUGCCGGUCCUGUUAGCCUGAGCACACCAGCUCAGCUUGUGGCCCCCUCUGUUGUAGUAAAGGGCACUCUUUCUGUCACCUCCUCCGAACUCUAUUUUGAGGUGGAUGAAGAGGAUCCUAACUUCAAAAAAAUCGACCCCAAGAUCUUGGCAUAUACAGAAGGGCUGCAUGGAAAAUGGCUGUUCACAGAGAUACGAUCAAUCUUUUCUCGUCGUUAUCUUUUGCAAAAUACAGCCCUGGAGAUCUUUAUGGCAAACAGAGUUGCUGUGAUGUUCAACUUCCCAGACCCUGCAACAGUAAAGAAAGUGGUUAACUAUCUACCUCGUGUUGGCGUUGGAACAAGUUUUGGAUUGCCUCAAACCAGACGUAUUUCAUUAGCUAGUCCACGUCAGCUUUUUAAGGCUUCUAAUAUGACCCAGCGAUGGCAACACAGAGAGAUAUCUAAUUUUGAGUACUUGAUGUUUCUCAACACGAUAGCAGGACGGAGUUAUAAUGACUUAAAUCAGUAUCCAGUGUUUCCUUGGGUCAUCACUAAUUAUGAAUCAGAAGAACUGGAUCUUACCUUGCCCACCAACUUCAGAGAUUUGUCCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-235.5 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -256.63

Frequency: 0.0000

Diversity: 154.85

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((((((((((((((((((..........(.(((....))).))))))((....))...((((((...((.....))..)).))))((((((((((((.............((((......(((.(.((((((...)))))).).)))......))))...........(((((....)))))......(((....))))))..)))))))))...)))))))))).....))).(((....))).)))))((((((..(((((......((((.((((.(((((((...)))))))....(((((((((..((((((......))))))(.((((((((..(((((((.(((..((((..(((((.(..(((((((................)))))))..))))))..)))).))).))............((((....)))).....))))).)))))))).)......((((((....(((((((((((............)))).)))))))........))))))((((.((...(((((((((......))))))))).........))))))....(((....))).(((.(((.....))).)))...((((((((((((.(((.(.((((.((((.(((.((......)).))).))))..)))).)))))))))(((((....)))))((......))....((....))......((((((((((...............)))))))))))))))))))))))))).((((((...)))))).....((.(((((((.((((..(((.((((........)))).))))))).)))))))))...)))).))))......)))))..)))))...)

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((({(((((((((((((((((..,....,,.{.,||....}}},}))))){(....}}...((((((...{(,....))..)).)))}((((((((((((.,,......,...((((....,,(((.,.(((((,...,})))),,.))).,,...)))).|,||......(((((....)))))......|{|,,,.))})))..)))))))))...)))))))))).....}}}.(((....))).)))))({{{((,,(((((......((((.{(((.(((((((...))))))).{(.{(((((((({.((((((......))))))|,((((((((..(((((((.(((..((((..(((((({..(((((((....,,..........)))))))..))))))..)))).})}.}}............((({....}))).....))))).)))))))).,......((((((...{(((((((((((.,..........))))},))))))})......))))))((((,((.{.(((((((((......))))))))).}.}}....)}))))...,((,....),,.{((.(((.....))).)))...((((((((((({{(({,(.((((.((((.(((.((......)).))).))))..)))).))))))))){((({....})))},{......},.{{,,,..,}),......((((((((((...............))))))))))}))))))})))))))),|(((({...})))),.....{(.(((((((.{(((..(((.((((........)))).))))))}.))))))))}...)))}.))))......)))))..}))))...)