Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0025500
Sequence Length
1422 nt
GC Content
0.4409
CAUGAACUGGAAAAUAUUGAACCUACUCAAGGCCUUUCAAUAGAAGCCUCUGUGACAUUUUUGCAGAGGCUAAUUAGCCUUGUGGAUGUGCUUAUAUUUGCAAGUUCUCUUGGCUUUACUGAAAUUGAAGCUGAAAAAAGUAUGUCAUCUGGAGGAAUUUUGCGGCAGUGUCUCCGACUAGUUUGUGCAGUCGCAGUAAGGAAUUGCUUGGAGUGUCAACAGCAUUCACAACUGAAAACUAGGGGAGAUAAAGCCUUGAAACCAAUGCAUAGCCUUAUUCCUUUAGGGAAAUCUGCAGCGAAGAGCCCAGUGGACAUUGUGACUGGCGGUAUAUCUCCAGUAAGAGAUCUUGACAGGCUUCUACAGGACAUGGAUAUUAAUCGGCUUAGGGCAGUUGUUUUCAGAGACAUAGAGGAUAGCAAACAAGCUCAAUUUUUAGCCUUGGCAGUAGUAUACUUUAUCUCUGUUCUUAUGGUCUCCAAGUACAGAGACAUUUUGGAACCCCAAAAUGAAAGGCAUAGCCAGUCAUGUACAGAAACUGGCAGUGAAAAUGAGAAUGUAUCACUCUCUGAAAUCACACCAGCAGCAUUCAGCACUUUAACUACGGCAUCAGUGGAAGAAUCUGAAAGCACAUCAUCUGCUCGAAGGAGGGACUCAGGCAUUGGGGAAGAAACAGCCACUGGUUUAGGAAGCCAUGUGGAAGUAACUCCUCACACAGCACCUCCUGGUGUCAGUGCAGGCCCAGAUGCAAUCAGCGAGGUGCUAUCUACUCUUUCUUUAGAAGUCAAUAAGUCUCCGGAAACCAAAAAUGAUAGAGGAAAUGACUUGGACACUAAGGCUACACCGUCAGUUUCAGUUUCAAAAAACGUCAAUGUGAAAGACAUUCUCCGAAGCUUGGUUAACAUACCAGCAGAUGGAGUCACAGUGGAUCCUGCCCUUCUGCCACCAGCCUGCCUUGGAGCCCUUGGUGAUCUAUCUGUGGAACAACCCGUGCAGUUCAGAUCUUUUGACAGAAGUGUCAUUGUUGCAGCAAAAAAGUCAGCAGUCUCACCUUCCACCUUUAAUACAAGCAUACCUACCAAUGCUGUCAGUGUGGUUUCCUCAGUAGAUUCAGCCCAAGCCUCAGAUAUGGGAGGAGAAUCACCAGGCAGUAGAUCAUCUAAUGCAAAAUUGCCCUCAGUUCCAACAGUUGAUUCAGUUUCACAAGAUCCGGUUUCAAAUAUGAGUAUUACAGAGAGGCUUGAACACGCUUUGGAAAAGGCAGCUCCUCUCCUUCGUGAGAUUUUUGUGGAUUUUGCACCUUUUCUUUCUCGGACACUUUUGGGUAGCCAUGGACAAGAACUGCUUAUAGAAGGAACAAGUCUGGUUUGCAUGAAGUCGAGUAGUUCAGUUGUGGAAUUGGUUAUGCUACUGUGUUCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-401.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -427.52
Frequency: 0.0000
Diversity: 435.44
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((((((.....((((((((((.....)))...)))))))..(((((((((((.....)))))))))))....((((((.((...(((((((((((((.((.(..(((((.............(((((((((.........((((.(((..((((((..(.((((((((((((..(((((((...((((.(((((.....))))).((((((((.....)))))).)))))).))))))).))))))...((.(((....))).))....(((((......)))))....(((.((....(((((..((.((.(((...(((((.(......).)))))....))).)).)).))))))).)))......(((....)))(((((.((((.(((((((((.........)))))))))..(((..((((.(((((((((((...((((...))))...(((((((.((..(((...))))).)))))))((((((((....)))))))).)))))...((((((...........))))))..))))))))))..)))((((((....((((((((((..((((((((..((............))....(((((((.(((((((.((((((((((.((((.((((.(((.((..((((..((((.((..((..((((((((((...)))))).))))..))............(((((((((((((.....((((........))))))))).))))))))(((((((.((((((((............((....))............)))))))).(((((((((.(((.(((((........))))).)))))))).....))))((((.....)))).(((((..(((.(((......))))))...)))))....))))))).)).))))..))))...))))).)))).))))....))))))........((......))))))..))))))).....((((....))))(((((((..((......))))))))).....)))))))......................))))))))..))))))))))...))).)))...))))))))).......(((((......)).))).(((.((((...)))).)))...)))))))..))))))..))).))))))))))))))))))...).)).)))))))))))))..))..)))))).......(((((....))))).....(((..((((((((((((.....((((((.(..(((((((.((((.(..((....(((....)))))..).))))..).....))))))..)))))))))))).)))))))..)))))))))))(((.(((((.(((......)))..))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{.(((((((,....((((((((((.....)))...)))))))..(((((((((((.....)))))))))))....(((({{.,(,..(((((((((((((,{{,|,.{{{{(,,,....,,,,..(((((((((.........((((.(((..((((((..(.((((((((((((..(((((((...((((.(((((.....))))),((((((((.....)))))).)})))).))))))).)))))),..{{.(((....))},||,...(((((......)))))....,|}},{{.....}},,,(({({....{{{(((((.({....,),))))}{{((({(((,{{{.||||{{{{(({,..,{{((({{{{{..((((({(((({({((,(((({{{{.....|||||||||..,{{.,|{{,,||||{{(((((...{(({...}})}...(((((((.((..(((...))))).)))))))((((((((....)))))))).)))))...((((((...........)))))).,|||}}}}}}}..)}},}}}}}}}}}||||,||{,,..(({((,(({{(,.,{{,..{{,,.,.....|||||||.|{|||||.||,,.,,,,{|{||,.,((({(((...{{(({,.{((((,,(..((..((((((((({...}))))).))))..))..,}}}}},...(((((((((((((.....((((........))))))))).)))))))){{{{(({.{{{{{{{{,.,,,......,((,,..}}.........,..},}}))),.,|||||{({.(((.{((((.....,,.))))).}))}}}},.....}}}|,(((,,...}}}},(((({..(({{(((......))))))...)))))},,,))))))}}))}))))}})}},..,})}))})))).))))}.,})))}})}}}}}}}))))}....,.}})).,)),))))})}}}((({....})))(((((((..{(......)})))))))..))},})))))...........{{{{........,||||||{.|,||||||{{{{{.|{{,,,...||,,,,)),.....}}},,}}}}}}},))})).}|||}||,,...,,,,,)))...}))))))..))))))..))).)))))))))))))}}))}...},)},)))))))))))))..},,,)))))).......(((((,...|||}|{{{{.{{{{{({(({(((({{{,.,,,|||,,,,||.|{{,|||,,,{,.{{,{{,....||||,||||.,.|||}}}|.,,|||,,.}})))}.|,}},)))}))).,,})))),.)))))))))}}|||,,,{{|}|||,,,.}.}}}},))))})))
Back