Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0025600
Sequence Length
1576 nt
GC Content
0.4391
CCAUUCAACAAAGACAGUUAUGGACUUCGUGAAUAGCAGUGAUAAUGUCAUCUUUGUACACAACACAAUUCAUCUCAUCUCUCAAGUGAUGGACAAUAUGGUCAUGGCUUGUGGGGGUAUACUGCCAUUGCUUUCAGCUGCUACAUCGGCUACACAUGAACUGGAAAAUAUUGAACCUACUCAAGGCCUUUCAAUAGAAGCCUCUGUGACAUUUUUGCAGAGGCUAAUUAGCCUUGUGGAUGUGCUUAUAUUUGCAAGUUCUCUUGGCUUUACUGAAAUUGAAGCUGAAAAAAGUAUGUCAUCUGGAGGAAUUUUGCGGCAGUGUCUCCGACUAGUUUGUGCAGUCGCAGUAAGGAAUUGCUUGGAGUGUCAACAGCAUUCACAACUGAAAACUAGGGGAGAUAAAGCCUUGAAACCAAUGCAUAGCCUUAUUCCUUUAGGGAAAUCUGCAGCGAAGAGCCCAGUGGACAUUGUGACUGGCGGUAUAUCUCCAGUAAGAGAUCUUGACAGGCUUCUACAGGACAUGGAUAUUAAUCGGCUUAGGGCAGUUGUUUUCAGAGACAUAGAGGAUAGCAAACAAGCUCAAUUUUUAGCCUUGGCAGUAGUAUACUUUAUCUCUGUUCUUAUGGUCUCCAAGUACAGAGACAUUUUGGAACCCCAAAAUGAAAGGCAUAGCCAGUCAUGUACAGAAACUGGCAGUGAAAAUGAGAAUGUAUCACUCUCUGAAAUCACACCAGCAGCAUUCAGCACUUUAACUACGGCAUCAGUGGAAGAAUCUGAAAGCACAUCAUCUGCUCGAAGGAGGGACUCAGGCAUUGGGGAAGAAACAGCCACUGGUUUAGGAAGCCAUGUGGAAGUAACUCCUCACACAGCACCUCCUGGUGUCAGUGCAGGCCCAGAUGCAAUCAGCGAGGUGCUAUCUACUCUUUCUUUAGAAGUCAAUAAGUCUCCGGAAACCAAAAAUGAUAGAGGAAAUGACUUGGACACUAAGGCUACACCGUCAGUUUCAGUUUCAAAAAACGUCAAUGUGAAAGACAUUCUCCGAAGCUUGGUUAACAUACCAGCAGAUGGAGUCACAGUGGAUCCUGCCCUUCUGCCACCAGCCUGCCUUGGAGCCCUUGGUGAUCUAUCUGUGGAACAACCCGUGCAGUUCAGAUCUUUUGACAGAAGUGUCAUUGUUGCAGCAAAAAAGUCAGCAGUCUCACCUUCCACCUUUAAUACAAGCAUACCUACCAAUGCUGUCAGUGUGGUUUCCUCAGUAGAUUCAGCCCAAGCCUCAGAUAUGGGAGGAGAAUCACCAGGCAGUAGAUCAUCUAAUGCAAAAUUGCCCUCAGUUCCAACAGUUGAUUCAGUUUCACAAGAUCCGGUUUCAAAUAUGAGUAUUACAGAGAGGCUUGAACACGCUUUGGAAAAGGCAGCUCCUCUCCUUCGUGAGAUUUUUGUGGAUUUUGCACCUUUUCUUUCUCGGACACUUUUGGGUAGCCAUGGACAAGAACUGCUUAUAGAAGGAACAAGUCUGGUUUGCAUGAAGUCGAGUAGUUCAGUUGUGGAAUUGGUUAUGCUACUGUGUUCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-443.9 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -473.43
Frequency: 0.0000
Diversity: 366.03
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.((((.........(.(((((((((...(.(((((((((........)))).)))..............((((........))))(((......)))..((((((((((((((((((((((((((((((((((......((((...................((((((((((.....)))...)))))))..(((((((((((.....)))))))))))....((((..(.((((.(((........))).)))).)..))))...))))......)))))))).....(((((..((((.(...((((((.(((((((((((..(((((((...((((.(((((.....))))).((((((((.....)))))).)))))).))))))).)))))))..((.(((....))).))....(((((......)))))....)))).))))))..)))))..))))).)))).))))))))))))))).(((((((.(((((.((((((((((.(((.....(((....)))(((((.((((.(((((((((.........)))))))))..(((..((((.(((((((((((...((((...))))...(((((((.((..(((...))))).)))))))((((((((....)))))))).)))))...((((((...........))))))..))))))))))..)))((((((....((((((((((..((((((((..((............))....(((((((.(((((((.((((((((((.((((.((((.(((.((..((((..((((.((..((..((((((((((...)))))).))))..))............(((((((((((((.....((((........))))))))).))))))))(((((((.((((((((............((....))............)))))))).(((((((((.(((.(((((........))))).)))))))).....))))((((.....)))).(((((..(((.(((......))))))...)))))....))))))).)).))))..))))...))))).)))).))))....))))))........((......))))))..))))))).....((((....))))(((((((..((......))))))))).....)))))))......................))))))))..))))))))))...))).)))...)))))))))........((((((((.........(((.((((...)))).)))....(((((.....((((((.(((((.(((((((((............((((....)))).........))))).)))))).)))))))))..))))))))))))).((((.((((.....(((.......)))......)))).))))..))).)))).)))).))..))))).)).))))).......))))))))).)...))))))))).).........)))).))).)))((((((....))))....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((.((((.,..,.{..(.(((((((((...{,({(((((,,.|,,,...}|||.}},..{|{{,...{{{,{{({,{.(((((.((({,(.....,,}))).)))))((((((((((((((((((((((((((((.,....((((,,......,,,,|,,....(((((((({{...,,}}}...}))}}}}..(((((((((((.....)))))))))))....{(((,,|.({{{.{((..,,,,,.})}.)))).}..)))}...))))....,.)))))))}.....(((((..((((.(...(((((({((,,(((((((..(((((((...((((.(((((.....))))),((((((((.....)))))).)})))).))))))).)))))))..||}{((....))},||{...(((((......)))))....,))),)))))}..)))))..))))).)))).)))))))))))))))),,,||||,{{{{{.{{{{{||||||{||,..,,{({....}}}(((((.((((.(((((((((.........)))))))))..(((..((({,(((((((((((...{(({...}})}...(((((((.((..(((...))))).)))))))((((((((....)))))))).)))))...((((((...........))))))..))))))))))..))),{{,{({{,,((((((((((..((((((((..({.,..........)}....(((((((.(((((((.(((({((({{.((((.((((.(((.{,..((((..((((.{(..{(..((((((((({...}))))).))))..}}...|||||....(((((((((((((.....((((........))))))))).)))))))),{{{{{{.{{{{{{{||,,,,......,((,,..}}.........,..,,}}))),.,|||||{({.(((.{((((.....,,.))))).}))}}},,.....}}}|,(((,,...}},},(((({..(({{(((......))))))...))))),,,})))))}}.}}.))))..))))...}}))).)))).))))....))))}},,.....,||......)}))))..)))))))....,{{{{...,||}}(((((((..{(......)})))))))..,,,)))))))..........,,..........))))))))..)))))))))}.,,)),,)),...)))))))))...,,,.,((((((((.........(((.((((...)))).)))....{((((.....((((((.((({(.(((((((((......,....,{(({....}))).......,.)))))},))))}.)))))))))..))))}))))))}),,|||||||||,,}}}})||.,,}|},{{,,,{{{{{{{.{{,,{,,,.|||},,})},}}.,)})))},},}}},,,}}})},,,}}}}))),),..))))))))).).,},},...)))).))),}))(({{((....}}))....))
Back