Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0025700
Sequence Length
2814 nt
GC Content
0.4218
GUCACUUUUGAAAUACACAAAGAAAACCUUGCCAAUAUAUUUAGGGAACAGCAAGGAAAAGUUGAUGAAGAAAUAGGGCUGUGUUCUUCAACUUCAGUUCAAGCAGCCUCUGGCAUUAGAAGGGAUAUUAAUGUUUCAGUAGGAUCCCAGCAACCAGAUACGAAGGAUUCUCCUGUCUGUCCUCAUUUCACCACAAAUGGUAAUGAAAAUUCAAGUAUAGAGAAGACAAGUUCACUAGAAUCUGCAUCUAAUAUUGAACUGCAAACUACUAAUACAUCUUAUGAAGAAAUGAAAGCUGAGCAAGAAAAUCAGGAGUUACCAGAUGAAGGCACUUUGGAAGAAACACUGACAAAUGAGACAAGGAAUGCAGAUGAUUUAGAAGUAUCUUCUGACAUAAUAGAAGCUGUGGCUAUUUCCUCUAAUUCUUUUAUAACAACUGGCAAAGAUUCAAUGACUGUCAGUGAAGUAACUGCUUCUAUAAGUUCUCCUUCAGAAGAGGAUGCCUCAGAGAUGCCAGAAUUCUUGGAUAAAUCUAUAGUAGAGGAAGAGGAAGAUGAUGAUUAUGUGGAACUGAAAGUAGAAGGCAGUCCUACUGAGGAAGCUAAUCUACCCACAGAGCUCCAAGAUAACAGUUUGUCUCCAGCUGCAUCUGAAGCCGGUGAAAAACUGGACAUGUUUGGUAAUGAUGACAAAUUAAUAUUUCAAGAAGGAAAACCUGUUACUGAAAAGCAAACUGAUACUGAAACUCAAGAUUCUAAAGAUUCUGGAAUUCAGACUAUGACAGCAUCAGGGUCUUCAGCUAUGUCACCAGAAACUACUGUUUCCCAAAUAGCUGUAGAAUCAGACCUUGGUCAGAUGCUGGAGGAAGGGAAGAAAGCAACUAACCUCACUAGAGAAACCAAAUUAAUUAAUGAUUGUCAUGGUAGUGUCUCUGAGGCUUCUUCUGAGCAAAAGAUUGCGAAGUUGGAUGUUUCCAAUGUUGCUACAGAUACUGAGAGGCUGGAGUUGAAGGCCAGUCCCAACGUGGAAGCACCUCAACCUCAUCGACAUGUGCUUGAGAUAUCAAGGCAACAUGAGCAGCCAGGGCAAGGAAUAGCACCAGAUGCAGUUAAUGGACAAAGGAGGGAUUCCAGAUCUACUGUGUUUCGUAUUCCUGAGUUCAACUGGUCUCAGAUGCAUCAACGUUUGCUCACUGAUCUAUUAUUUUCAAUAGAAACAGAUAUACAGAUGUGGAGAAGCCAUUCAACAAAGACAGUUAUGGACUUCGUGAAUAGCAGUGAUAAUGUCAUCUUUGUACACAACACAAUUCAUCUCAUCUCUCAAGUGAUGGACAAUAUGGUCAUGGCUUGUGGGGGUAUACUGCCAUUGCUUUCAGCUGCUACAUCGGCUACACAUGAACUGGAAAAUAUUGAACCUACUCAAGGCCUUUCAAUAGAAGCCUCUGUGACAUUUUUGCAGAGGCUAAUUAGCCUUGUGGAUGUGCUUAUAUUUGCAAGUUCUCUUGGCUUUACUGAAAUUGAAGCUGAAAAAAGUAUGUCAUCUGGAGGAAUUUUGCGGCAGUGUCUCCGACUAGUUUGUGCAGUCGCAGUAAGGAAUUGCUUGGAGUGUCAACAGCAUUCACAACUGAAAACUAGGGGAGAUAAAGCCUUGAAACCAAUGCAUAGCCUUAUUCCUUUAGGGAAAUCUGCAGCGAAGAGCCCAGUGGACAUUGUGACUGGCGGUAUAUCUCCAGUAAGAGAUCUUGACAGGCUUCUACAGGACAUGGAUAUUAAUCGGCUUAGGGCAGUUGUUUUCAGAGACAUAGAGGAUAGCAAACAAGCUCAAUUUUUAGCCUUGGCAGUAGUAUACUUUAUCUCUGUUCUUAUGGUCUCCAAGUACAGAGACAUUUUGGAACCCCAAAAUGAAAGGCAUAGCCAGUCAUGUACAGAAACUGGCAGUGAAAAUGAGAAUGUAUCACUCUCUGAAAUCACACCAGCAGCAUUCAGCACUUUAACUACGGCAUCAGUGGAAGAAUCUGAAAGCACAUCAUCUGCUCGAAGGAGGGACUCAGGCAUUGGGGAAGAAACAGCCACUGGUUUAGGAAGCCAUGUGGAAGUAACUCCUCACACAGCACCUCCUGGUGUCAGUGCAGGCCCAGAUGCAAUCAGCGAGGUGCUAUCUACUCUUUCUUUAGAAGUCAAUAAGUCUCCGGAAACCAAAAAUGAUAGAGGAAAUGACUUGGACACUAAGGCUACACCGUCAGUUUCAGUUUCAAAAAACGUCAAUGUGAAAGACAUUCUCCGAAGCUUGGUUAACAUACCAGCAGAUGGAGUCACAGUGGAUCCUGCCCUUCUGCCACCAGCCUGCCUUGGAGCCCUUGGUGAUCUAUCUGUGGAACAACCCGUGCAGUUCAGAUCUUUUGACAGAAGUGUCAUUGUUGCAGCAAAAAAGUCAGCAGUCUCACCUUCCACCUUUAAUACAAGCAUACCUACCAAUGCUGUCAGUGUGGUUUCCUCAGUAGAUUCAGCCCAAGCCUCAGAUAUGGGAGGAGAAUCACCAGGCAGUAGAUCAUCUAAUGCAAAAUUGCCCUCAGUUCCAACAGUUGAUUCAGUUUCACAAGAUCCGGUUUCAAAUAUGAGUAUUACAGAGAGGCUUGAACACGCUUUGGAAAAGGCAGCUCCUCUCCUUCGUGAGAUUUUUGUGGAUUUUGCACCUUUUCUUUCUCGGACACUUUUGGGUAGCCAUGGACAAGAACUGCUUAUAGAAGGAACAAGUCUGGUUUGCAUGAAGUCGAGUAGUUCAGUUGUGGAAUUGGUUAUGCUACUGUGUUCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-774.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -828.56
Frequency: 0.0000
Diversity: 909.82
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.....)((((.......((((((((((((((..................))))))(((((((.((((((....((((((((.((.(((((.....((((((((...((((((((((((........)))))))..(((.(((((((.................))))))).)))(((.(((((.((((((((....)))).........((.(.((((((........(((((..(((((((((((((.........(((..((((...........((((......))))...((((.........)))).))))..))).((((((.((((((((((...((((((((........(((((((..(((.((..(((..(((.((((((......)))))).)))..)))..)).))).)))))))........((.....))..........)))))))).........)))))).))))...))))))...((((...))))..))))).))).))))))))))...)))))).).))))))))))))))....((((.((((((((((((.......(((((((.((((((((((((((..((((...((((((..(.((((((....))))))...)..)).)))).....(((((...(((((((...((((((((((((((((........((((......))))..(((((((((((..(((...(((.(((((((((...(((((((((((((((((...(((.....))).....))))))))))(((((((.......(((((....)))))....))))))))))))))((.(((((((......((((((((((((.(((...........(((....)))..((((...(((((...)))))...)))).((((..(((((.(((((((.(((((...((((((....((((((.((((((.((.((((..((......((((((((((((((..(((((((((....((((((((...((((.(((.....(((((((((((....)))).)).)))))...(((((((((........)).))(((((.((((..((((((((((.((.(((....(((.(((((..(((((((..(((((.((....)).))))))))).((.(((((((....(((.((((((......))))))..))).....))))))).))((((((((..(((.......))))))).))))..)))..))))))))))).)).))))))).).))....)))))))))((((........))))(((......))).)))))..((((((((((((((((((((((((((((......((((...................((((((((((.....)))...)))))))..(((((((((((.....)))))))))))....((((..(.((((.(((........))).)))).)..))))...))))......)))))))).....(((((..((((.(...((((((.(((((((((((..(((((((...((((.(((((.....))))).((((((((.....)))))).)))))).))))))).)))))))..((.(((....))).))....(((((......)))))....)))).))))))..)))))..))))).)))).))))))))))))))))....)))...))))...)))))))).)))).))).........(((((.(....(((((((((.........)))))))))...)))))).........(((((...((((...))))...(((((((.((..(((...))))).)))))))((((((((....)))))))).)))))...((((((...........)))))).((((....((((.((...)).)))).....)))).))..)))).)))))).))))..))..)))).)).)))))).))))))..))).)))...))))))))))))...)))))))))((((((.(..((..((((((((((...)))))).))))..))..)))))))...(((((((((((((.....((((........))))))))).)))))))).))).))))))))))))..(((..(((((((((...................)))...))))))))))))))))))........))))))))).))).........(((((.....)))))(((((..(((.(((......))))))...)))))((((((((((((..(((.....((..((((......)))).))....))))))))).)))))).........)))..)))))......))))))...))))))))))))..))))...)))..)))).)))))................(((((........))))))).))..))))))))))))))))))..)))......((((...(((((.(((.........(((.((((...)))).))).........)))..)))))....)))))))))))))))).))))....((((....)))).....)))))..)))))))).....))))).)).))))).)))...))))))..)))))))(((.......))).))))))))...((((((....(.(((((((...(((((((((((((.......((((.......))))..........)))))))))..)))).....))))))).)....))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.....}((((....,,,{{{{{,,,((((((..................)))))),{{{{((.((((((....{(((((((.({.(((((.....((((((((..,(((((,,,,,,{..(((((.{{|.{{...}}.}}|.)))))..,...{{(((,.,.{({{..,))))}}}}}{{,((((({,((({....}))),}}}}...,{{{{,((({(({..{.,,.((((,..,||}},}||.))),...})))},|{,,,.||.||,,,,,.(({{,{,|||,.,,|,...(({{.........||}|..,||.{|||{{{,.,,||,|||||,{{...,,|||{|,..{{{{{{.,{{{(({{(((.(({.,,,..,.}}),)))).}}}....{{{(({{,.,|||,{((((({..,((({({{{....(((((({.............)))))))(((({....}))))....,||,,{,|||,},,,|{||..,}}}}{{(|,{|(({{...,,}))).,...))),,,}}))))}}))))))}},,,..{{({.(((((((((((,.,,.{,.((({((,((((((((((((((,.,{{.....,||.{{{{{{((,,..((((((,((.((.(((.,......}}|,||,}}.,})))),.,,.,||||}{,.{|,,,.,..}}},...{((({...(((....))).,,..))}},,}}...}||...(((((..({.{((.((....)).)))|},.})))),{..{(((((((({{((((((,(((((((.......(((((....)))))....))))))).,.....})))))||{{..{{{{((((,((((((..(((..{{..,,..{(((,..,{{|{.((((...(((({...)))))...))))..,,)))})))))|,,(((({(,,(({{{(((((({{.{(((((....})))}|,}|||({{(({{{{{(((.(((({({((((,.((,,,,(((....,,|||,{{.}}|||}}|}|.....(((((((((((....)))))})},)))).....(((((((.{((,,,.{({...,,|||,{{...(((,...{(((({(...,|{{{{{{{|||{|,||{{|||,|||{{{||{..||}},}}|||,}||,.,.,{{{{||,...(((.((((((......))))))..))).....}}))))}|}|(((((({{,,{((...,,..||||}}}.}}}}{{{,{{,|.,((({{,,.}}},},,)))).}}}........,,,,...{(({{{(((((.(((,,(....,},}))).)))))((((((((((((((((((((((((((((.,....((((,,......,,,,|,.....(((((((({{...,,|||,..}))}}}}..(((((((((((.....)))))))))))....{(((..|.((({.{((........))}.)))).}..)))}...))))....,.)))))))}.....(((((..((((.(...(((((({((,,(((((((..(((((((...((((.(((((.....))))),((((((((.....)))))).)})))).))))))).)))))))..||}{((....))},||{...(((((......)))))....,))),)))))}..)))))..))))).)))).))))))))))))))))...}))))}.})))..}))))))}},}}}}.}}|{{.,,.,,,,{({,.{|{|,{|{({(((({{{{,...,|||||||||...,,.}}|,.,|||||,(((({.,.{{{{...}}}}...(((((((.((..(((...))))).)))))))((((((((....)))))))).}))))...((((((...........)))))).((((..,||||,.||..})}}))))}}}},,))}.}}.,}.{{.{{{{|,.|{{{..{{,,......}))))}}).},))))}.)),.,,||||}||||,,|||}||||}}}||||,,((((({,{..((..((((((((({...}))))).))))..))..})))))}...(((((((((((((.....((((........))))))))).)))))))).,,,.,|||||||,|}},,|||..,{{{(({{{.,,.........,,.,.,,)))...||||||||,{||.|{{{{.....,},))))),)))})),......|}}|{(((.....))})}|||||..((|{(((......)))))).,,))))).)))))))))),,}}))))))),,..}}}.)))))))))))))))))))}|,,,|}}|||||(,,{...,,..}},)}}},))))}}}}|,|}}}}|||,,{{{(({{,.||......)}}}))}}))),,)))))}.}}.........|||||....,,,.)))))))))}.}))))))))))))))),||{.,||,,..,,,{.....}||}|,|||.........(((.((({...}))).)))...}})))}.)),,}}}}|,,,.}}},}))))))))}}}.}}))},})}}}|....,}}},.,..))))).,)))))))).....))))).)).))))),))).,.)))))),})})}))}|||,..,}},)}}.}}}))}}}...((((((....(.(((((((...((({(((((((((.......{{{(.......})))........,.)))))))))..)))).....))))))).)....))))))}}))
Back