Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0029300
Sequence Length
2539 nt
GC Content
0.4218
GUCACUUUUGAAAUACACAAAGAAAACCUUGCCAAUAUAUUUAGGGAACAGCAAGGAAAAGUUGAUGAAGAAAUAGGGCUGUGUUCUUCAACUUCAGUUCAAGCAGCCUCUGGCAUUAGAAGGGAUAUUAAUGUUUCAGUAGGAUCCCAGCAACCAGAUACGAAGGAUUCUCCUGUCUGUCCUCAUUUCACCACAAAUGGUAAUGAAAAUUCAAGUAUAGAGAAGACAAGUUCACUAGAAUCUGCAUCUAAUAUUGAACUGCAAACUACUAAUACAUCUUAUGAAGAAAUGAAAGCUGAGCAAGAAAAUCAGGAGUUACCAGAUGAAGGCACUUUGGAAGAAACACUGACAAAUGAGACAAGGAAUGCAGAUGAUUUAGAAGUAUCUUCUGACAUAAUAGAAGCUGUGGCUAUUUCCUCUAAUUCUUUUAUAACAACUGGCAAAGAUUCAAUGACUGUCAGUGAAGUAACUGCUUCUAUAAGUUCUCCUUCAGAAGAGGAUGCCUCAGAGAUGCCAGAAUUCUUGGAUAAAUCUAUAGUAGAGGAAGAGGAAGAUGAUGAUUAUGUGGAACUGAAAGUAGAAGGCAGUCCUACUGAGGAAGCUAAUCUACCCACAGAGCUCCAAGAUAACAGUUUGUCUCCAGCUGCAUCUGAAGCCGGUGAAAAACUGGACAUGUUUGGUAAUGAUGACAAAUUAAUAUUUCAAGAAGGAAAACCUGUUACUGAAAAGCAAACUGAUACUGAAACUCAAGAUUCUAAAGAUUCUGGAAUUCAGACUAUGACAGCAUCAGGGUCUUCAGCUAUGUCACCAGAAACUACUGUUUCCCAAAUAGCUGUAGAAUCAGACCUUGGUCAGAUGCUGGAGGAAGGGAAGAAAGCAACUAACCUCACUAGAGAAACCAAAUUAAUUAAUGAUUGUCAUGGUAGUGUCUCUGAGGCUUCUUCUGAGCAAAAGAUUGCGAAGUUGGAUGUUUCCAAUGUUGCUACAGAUACUGAGAGGCUGGAGUUGAAGGCCAGUCCCAACGUGGAAGCACCUCAACCUCAUCGACAUGUGCUUGAGAUAUCAAGGCAACAUGAGCAGCCAGGGCAAGGAAUAGCACCAGAUGCAGUUAAUGGACAAAGGAGGGAUUCCAGAUCUACUGUGUUUCGUAUUCCUGAGUUCAACUGGUCUCAGAUGCAUCAACGUUUGCUCACUGAUCUAUUAUUUUCAAUAGAAACAGAUAUACAGAUGUGGAGAAGCCAUUCAACAAAGACAGUUAUGGACUUCGUGAAUAGCAGUGAUAAUGUCAUCUUUGUACACAACACAAUUCAUCUCAUCUCUCAAGUGAUGGACAAUAUGGUCAUGGCUUGUGGGGGUAUACUGCCAUUGCUUUCAGCUGCUACAUCGGCUACACAUGAACUGGAAAAUAUUGAACCUACUCAAGGCCUUUCAAUAGAAGCCUCUGUGACAUUUUUGCAGAGGCUAAUUAGCCUUGUGGAUGUGCUUAUAUUUGCAAGUUCUCUUGGCUUUACUGAAAUUGAAGCUGAAAAAAGUAUGUCAUCUGGAGGAAUUUUGCGGCAGUGUCUCCGACUAGUUUGUGCAGUCGCAGUAAGGAAUUGCUUGGAGUGUCAACAGCAUUCACAACUGAAAACUAGGGGAGAUAAAGCCUUGAAACCAAUGCAUAGCCUUAUUCCUUUAGGGAAAUCUGCAGCGAAGAGCCCAGUGGACAUUGUGACUGGCGGUAUAUCUCCAGUAAGAGAUCUUGACAGGCUUCUACAGGACAUGGAUAUUAAUCGGCUUAGGGCAGUUGUUUUCAGAGACAUAGAGGAUAGCAAACAAGCUCAAUUUUUAGCCUUGGCAGUAGUAUACUUUAUCUCUGUUCUUAUGGUCUCCAAGUACAGAGACAUUUUGGAACCCCAAAAUGAAAGGCAUAGCCAGUCAUGUACAGAAACUGGCAGUGAAAAUGAGAAUGUAUCACUCUCUGAAAUCACACCAGCAGCAUUCAGCACUUUAACUACGGCAUCAGUGGAAGAAUCUGAAAGCACAUCAUCUGCUCGAAGGAGGGACUCAGGCAUUGGGGAAGAAACAGCCACUGGUUUAGGAAGCCAUGUGGAAGUAACUCCUCACACAGCACCUCCUGGUGUCAGUGCAGGCCCAGAUGCAAUCAGCGAGGUGCUAUCUACUCUUUCUUUAGAAGUCAAUAAGUCUCCGGAAACCAAAAAUGAUAGAGGAAAUGACUUGGACACUAAGGCUACACCGUCAGUUUCAGUUUCAAAAAACGUCAAUGUGAAAGACAUUCUCCGAAGCUUGGUUAACAUACCAGCAGAUGGAGUCACAGUGGAUCCUGCCCUUCUGCCACCAGCCUGCCUUGGAGCCCUUGGUGAUCUAUCUGUGGAACAACCCGUGCAGUUCAGAUCUUUUGACAGAAGUGUCAUUGUUGCAGCAAAAAAGUCAGCAGUCUCACCUUCCACCUUUAAUACAAGCAUACCUACCAAUGCUGUCAGUGUGGUUUCCUCAGUAGAUUCAGCCCAAGCCUCAGAUAUGGGAGGAGAAUCACCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-699 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -748.71
Frequency: 0.0000
Diversity: 883.41
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..(((((.......)))))....((((((..................))))))....((((((((.......((((((.((.((((((((((((((....(((..((((.........(((((.(((.((...)).))).)))))((((((..........((...((((((((.((..(((((((((((....))))..(((....))).((((((((......((((((.((((.......))))....)))))).....)).)).)))).((....)).)))))))..)).))..........))))))...))...((((((.((((((((((...((((((((........(((((((..(((.((..(((..(((.((((((......)))))).)))..)))..)).))).)))))))........((.....))..........)))))))).........)))))).))))...))))))..((((((.(((((((((((((((...(((((.......((((...)))).....)))))..)).......(((((........(((((.(((..((((....)))).)))..)))))))))).....(((((....((((((.((.((.(((........))).)).)).))))))......)))))..((.(((((((((((((.(((((...(((....))).....)))))............(((((..((.(((.((....)).))).)).))))).......((((((((((((((.(((((((.......(((((....)))))....))))))).......))))))).....))))))).((..(((..((.......))..)))..))...............))))))..))))))).)).))))))))))))).))))))..((((....))))...((((((....)))))))))))).))))..)))...))))))))))))))))))))))....(((....))).......)))))))).....(((((....)))))(((.(.((((..((((((((.(((((((.....(((((((((...((((............)))).....)))))))))..)))))))..)))...)))))))))).)))....(((((((....(((.((((((......))))))..))).....)))))))..(((((((..((((((((((..(((((..(((.(.......).))).)))))....)))))))...................(((((((((((.(((..((...))..))).)))))((((((((((((((((((((((((((((......((((...................((((((((((.....)))...)))))))..(((((((((((.....)))))))))))....((((..(.((((.(((........))).)))).)..))))...))))......)))))))).....(((((..((((.(...((((((.(((((((((((..(((((((...((((.(((((.....))))).((((((((.....)))))).)))))).))))))).)))))))..((.(((....))).))....(((((......)))))....)))).))))))..)))))..))))).)))).))))))))))))))))...))))))..)))..))))))).((.....))(((....)))(((((.((((.(((((((((.........)))))))))..(((..((((.(((((((((((...((((...))))...(((((((.((..(((...))))).)))))))((((((((....)))))))).)))))...((((((...........))))))..))))))))))..)))((((((....((((((((((..((((((((..((............))....(((((((.(((((((.((((((((((.((((.((((.(((.((..((((..((((.((..((..((((((((((...)))))).))))..))............(((((((((((((.....((((........))))))))).))))))))(((((((.((((((((............((....))............)))))))).(((((((((.(((.(((((........))))).)))))))).....))))((((.....)))).(((((..(((.(((......))))))...)))))....))))))).)).))))..))))...))))).)))).))))....))))))........((......))))))..))))))).....((((....))))(((((((..((......))))))))).....)))))))......................))))))))..))))))))))...))).)))...)))))))))...))).(((((......)).))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,,{(((((.......,}},,....((((((,........,........))))))..,,||||||,,......,(((((({.||((||,{{{{{{((((..{({{,{{((({|.,,.{..(((((.{{{.{{...}}.}}}.)))))..|..,{{{{{,...,(({..,|}|}}|||}{{,((((({{((({....}))).,|||....|||,{(((((({..,.,,,(((({.,{||,|.|,,.))),...,))))}},....||.}}..,,}.{{,,..,,,}},}}}}..,|||{,........}}))|}}},.||,|.{({{{{,{{({{({{((..,{{{|{{{,..,{{{,,,{{{{((,{(((.((,.{{{..{,|,|{||||.,,...}}|}||,|||.,|||..||,|||.}}|||||.......{((({{,.............}))))))|{{{{....})))),,..}}|,,,||||||,,{((({,.{||||{{{||||{|||,.{{|{{||,....{{|,,,,|}}}|,.,,}}}},,{{,....||,|}|{||,|||,..|||||,{||,,|||(,,,,||||,|||..}}}}}...}}}.,,||||{{}|,,{{{{({,{{,{(.{{{.,.,,,,.,}|{||{,,.,,))))}.,..{{{|||{,.{,,,..,,.}},,...{((({...(((....))).,,..))}},,,},.,}||...(((({..{{.{((.((....)).)))}),.}}}}}{{,,{{{((({((((((((((,(((((((.......(((((....)))))....))))))).,.....)))))))|||.,|||||||{,({{(((..((,...,..}}..||||.,,,|||,.{{{{...{{{{,...))))),,,)))).,}})))))))))},}|||||||{(({,,{{{|(({{.{(((((....})))}|{}|||{,{{{,,{|||{{,{((({({(((({,{{{||{(((....{{|||,{|.},||||},}|.,,..(((((((((((....)))))})},)))).,..,(((((((.{(({{{.{{,..,{{|||{{{...((({,..{{({{{{..,}||{,{{{||||||}||,|||}}}||{{|}||..}})}}}}}||,}||,.,.,{{{{||,...(((.((((((......))))))..))).....}}))))}|}|(((((({{,,{((...,,..||||}}}.)))}{{{,{{,|.,{{({{,,,}}},},,)))).)}}........,,,,...{(({{{(((((.(((,,(....,},}))).)))))((((((((((((((((((((((((((((.,....((((.,......,,,,|,.....(((((((({{...,,|||,..}))}}}}..(((((((((((.....)))))))))))....{(((..|.((({.{((........))}.)))).}..)))}...))))....,.)))))))}.....(((((..((((.(...(((((({((,,(((((((..(((((((...((((.(((((.....))))),((((((((.....)))))).)})))).))))))).)))))))..||}{((....))},||{...(((((......)))))....,))),)))))}..)))))..))))).)))).))))))))))))))))...}))))}.})))..}))))))}},}}}}.}}|,{.,,.,,,|{({,.{|{|,||{({(((({{{|,..,,|||||||||..,|,.}||,.,|||||,(((((...{{{{...}}}}...(((((((.((..(((...))))).)))))))((((((((....)))))))).)))))...((((((...........)))))).{{||,,,||||,.||,.,)}}))))}}}},}})}.},.||,((.{{||{,.|{{{..{{,,.,,...,})})||}.||))))|.))|,||||||}||||,||||,|||,|}||||{,.{(((({,(..((..((((((((({...}))))).))))..))..,}}}}},...(((((((((((((.....((((........))))))))).)))))))).,,,,,{,{||||,||},,|||..,,{|((|{{.},..........,.,,}})))..,||||||{|.{||.|{({{.....,,,))))),}))})},......}}}|{(((.....))}}}{{{{|..(({{(((......))))))..,))))).}})))))))),,}}))))}})}},.,}},)))}))))}))))}}}}))}|||{{,,|||||(,,,...},,,}},}}}}})))},}}||{||||||||,,{{(((((,.{{......)})})))))}}},}})))}.},.........|||||........)))))))}))})))))))))}}))),|||{|.,||||..||.,.,,,.|}}},,}.}}})).,,}}
Back