Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRBA_0029300

Sequence Length

2539 nt

GC Content

0.4218

GUCACUUUUGAAAUACACAAAGAAAACCUUGCCAAUAUAUUUAGGGAACAGCAAGGAAAAGUUGAUGAAGAAAUAGGGCUGUGUUCUUCAACUUCAGUUCAAGCAGCCUCUGGCAUUAGAAGGGAUAUUAAUGUUUCAGUAGGAUCCCAGCAACCAGAUACGAAGGAUUCUCCUGUCUGUCCUCAUUUCACCACAAAUGGUAAUGAAAAUUCAAGUAUAGAGAAGACAAGUUCACUAGAAUCUGCAUCUAAUAUUGAACUGCAAACUACUAAUACAUCUUAUGAAGAAAUGAAAGCUGAGCAAGAAAAUCAGGAGUUACCAGAUGAAGGCACUUUGGAAGAAACACUGACAAAUGAGACAAGGAAUGCAGAUGAUUUAGAAGUAUCUUCUGACAUAAUAGAAGCUGUGGCUAUUUCCUCUAAUUCUUUUAUAACAACUGGCAAAGAUUCAAUGACUGUCAGUGAAGUAACUGCUUCUAUAAGUUCUCCUUCAGAAGAGGAUGCCUCAGAGAUGCCAGAAUUCUUGGAUAAAUCUAUAGUAGAGGAAGAGGAAGAUGAUGAUUAUGUGGAACUGAAAGUAGAAGGCAGUCCUACUGAGGAAGCUAAUCUACCCACAGAGCUCCAAGAUAACAGUUUGUCUCCAGCUGCAUCUGAAGCCGGUGAAAAACUGGACAUGUUUGGUAAUGAUGACAAAUUAAUAUUUCAAGAAGGAAAACCUGUUACUGAAAAGCAAACUGAUACUGAAACUCAAGAUUCUAAAGAUUCUGGAAUUCAGACUAUGACAGCAUCAGGGUCUUCAGCUAUGUCACCAGAAACUACUGUUUCCCAAAUAGCUGUAGAAUCAGACCUUGGUCAGAUGCUGGAGGAAGGGAAGAAAGCAACUAACCUCACUAGAGAAACCAAAUUAAUUAAUGAUUGUCAUGGUAGUGUCUCUGAGGCUUCUUCUGAGCAAAAGAUUGCGAAGUUGGAUGUUUCCAAUGUUGCUACAGAUACUGAGAGGCUGGAGUUGAAGGCCAGUCCCAACGUGGAAGCACCUCAACCUCAUCGACAUGUGCUUGAGAUAUCAAGGCAACAUGAGCAGCCAGGGCAAGGAAUAGCACCAGAUGCAGUUAAUGGACAAAGGAGGGAUUCCAGAUCUACUGUGUUUCGUAUUCCUGAGUUCAACUGGUCUCAGAUGCAUCAACGUUUGCUCACUGAUCUAUUAUUUUCAAUAGAAACAGAUAUACAGAUGUGGAGAAGCCAUUCAACAAAGACAGUUAUGGACUUCGUGAAUAGCAGUGAUAAUGUCAUCUUUGUACACAACACAAUUCAUCUCAUCUCUCAAGUGAUGGACAAUAUGGUCAUGGCUUGUGGGGGUAUACUGCCAUUGCUUUCAGCUGCUACAUCGGCUACACAUGAACUGGAAAAUAUUGAACCUACUCAAGGCCUUUCAAUAGAAGCCUCUGUGACAUUUUUGCAGAGGCUAAUUAGCCUUGUGGAUGUGCUUAUAUUUGCAAGUUCUCUUGGCUUUACUGAAAUUGAAGCUGAAAAAAGUAUGUCAUCUGGAGGAAUUUUGCGGCAGUGUCUCCGACUAGUUUGUGCAGUCGCAGUAAGGAAUUGCUUGGAGUGUCAACAGCAUUCACAACUGAAAACUAGGGGAGAUAAAGCCUUGAAACCAAUGCAUAGCCUUAUUCCUUUAGGGAAAUCUGCAGCGAAGAGCCCAGUGGACAUUGUGACUGGCGGUAUAUCUCCAGUAAGAGAUCUUGACAGGCUUCUACAGGACAUGGAUAUUAAUCGGCUUAGGGCAGUUGUUUUCAGAGACAUAGAGGAUAGCAAACAAGCUCAAUUUUUAGCCUUGGCAGUAGUAUACUUUAUCUCUGUUCUUAUGGUCUCCAAGUACAGAGACAUUUUGGAACCCCAAAAUGAAAGGCAUAGCCAGUCAUGUACAGAAACUGGCAGUGAAAAUGAGAAUGUAUCACUCUCUGAAAUCACACCAGCAGCAUUCAGCACUUUAACUACGGCAUCAGUGGAAGAAUCUGAAAGCACAUCAUCUGCUCGAAGGAGGGACUCAGGCAUUGGGGAAGAAACAGCCACUGGUUUAGGAAGCCAUGUGGAAGUAACUCCUCACACAGCACCUCCUGGUGUCAGUGCAGGCCCAGAUGCAAUCAGCGAGGUGCUAUCUACUCUUUCUUUAGAAGUCAAUAAGUCUCCGGAAACCAAAAAUGAUAGAGGAAAUGACUUGGACACUAAGGCUACACCGUCAGUUUCAGUUUCAAAAAACGUCAAUGUGAAAGACAUUCUCCGAAGCUUGGUUAACAUACCAGCAGAUGGAGUCACAGUGGAUCCUGCCCUUCUGCCACCAGCCUGCCUUGGAGCCCUUGGUGAUCUAUCUGUGGAACAACCCGUGCAGUUCAGAUCUUUUGACAGAAGUGUCAUUGUUGCAGCAAAAAAGUCAGCAGUCUCACCUUCCACCUUUAAUACAAGCAUACCUACCAAUGCUGUCAGUGUGGUUUCCUCAGUAGAUUCAGCCCAAGCCUCAGAUAUGGGAGGAGAAUCACCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-699 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -748.71

Frequency: 0.0000

Diversity: 883.41

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((..(((((.......)))))....((((((..................))))))....((((((((.......((((((.((.((((((((((((((....(((..((((.........(((((.(((.((...)).))).)))))((((((..........((...((((((((.((..(((((((((((....))))..(((....))).((((((((......((((((.((((.......))))....)))))).....)).)).)))).((....)).)))))))..)).))..........))))))...))...((((((.((((((((((...((((((((........(((((((..(((.((..(((..(((.((((((......)))))).)))..)))..)).))).)))))))........((.....))..........)))))))).........)))))).))))...))))))..((((((.(((((((((((((((...(((((.......((((...)))).....)))))..)).......(((((........(((((.(((..((((....)))).)))..)))))))))).....(((((....((((((.((.((.(((........))).)).)).))))))......)))))..((.(((((((((((((.(((((...(((....))).....)))))............(((((..((.(((.((....)).))).)).))))).......((((((((((((((.(((((((.......(((((....)))))....))))))).......))))))).....))))))).((..(((..((.......))..)))..))...............))))))..))))))).)).))))))))))))).))))))..((((....))))...((((((....)))))))))))).))))..)))...))))))))))))))))))))))....(((....))).......)))))))).....(((((....)))))(((.(.((((..((((((((.(((((((.....(((((((((...((((............)))).....)))))))))..)))))))..)))...)))))))))).)))....(((((((....(((.((((((......))))))..))).....)))))))..(((((((..((((((((((..(((((..(((.(.......).))).)))))....)))))))...................(((((((((((.(((..((...))..))).)))))((((((((((((((((((((((((((((......((((...................((((((((((.....)))...)))))))..(((((((((((.....)))))))))))....((((..(.((((.(((........))).)))).)..))))...))))......)))))))).....(((((..((((.(...((((((.(((((((((((..(((((((...((((.(((((.....))))).((((((((.....)))))).)))))).))))))).)))))))..((.(((....))).))....(((((......)))))....)))).))))))..)))))..))))).)))).))))))))))))))))...))))))..)))..))))))).((.....))(((....)))(((((.((((.(((((((((.........)))))))))..(((..((((.(((((((((((...((((...))))...(((((((.((..(((...))))).)))))))((((((((....)))))))).)))))...((((((...........))))))..))))))))))..)))((((((....((((((((((..((((((((..((............))....(((((((.(((((((.((((((((((.((((.((((.(((.((..((((..((((.((..((..((((((((((...)))))).))))..))............(((((((((((((.....((((........))))))))).))))))))(((((((.((((((((............((....))............)))))))).(((((((((.(((.(((((........))))).)))))))).....))))((((.....)))).(((((..(((.(((......))))))...)))))....))))))).)).))))..))))...))))).)))).))))....))))))........((......))))))..))))))).....((((....))))(((((((..((......))))))))).....)))))))......................))))))))..))))))))))...))).)))...)))))))))...))).(((((......)).))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

((,,{(((((.......,}},,....((((((,........,........))))))..,,||||||,,......,(((((({.||((||,{{{{{{((((..{({{,{{((({|.,,.{..(((((.{{{.{{...}}.}}}.)))))..|..,{{{{{,...,(({..,|}|}}|||}{{,((((({{((({....}))).,|||....|||,{(((((({..,.,,,(((({.,{||,|.|,,.))),...,))))}},....||.}}..,,}.{{,,..,,,}},}}}}..,|||{,........}}))|}}},.||,|.{({{{{,{{({{({{((..,{{{|{{{,..,{{{,,,{{{{((,{(((.((,.{{{..{,|,|{||||.,,...}}|}||,|||.,|||..||,|||.}}|||||.......{((({{,.............}))))))|{{{{....})))),,..}}|,,,||||||,,{((({,.{||||{{{||||{|||,.{{|{{||,....{{|,,,,|}}}|,.,,}}}},,{{,....||,|}|{||,|||,..|||||,{||,,|||(,,,,||||,|||..}}}}}...}}}.,,||||{{}|,,{{{{({,{{,{(.{{{.,.,,,,.,}|{||{,,.,,))))}.,..{{{|||{,.{,,,..,,.}},,...{((({...(((....))).,,..))}},,,},.,}||...(((({..{{.{((.((....)).)))}),.}}}}}{{,,{{{((({((((((((((,(((((((.......(((((....)))))....))))))).,.....)))))))|||.,|||||||{,({{(((..((,...,..}}..||||.,,,|||,.{{{{...{{{{,...))))),,,)))).,}})))))))))},}|||||||{(({,,{{{|(({{.{(((((....})))}|{}|||{,{{{,,{|||{{,{((({({(((({,{{{||{(((....{{|||,{|.},||||},}|.,,..(((((((((((....)))))})},)))).,..,(((((((.{(({{{.{{,..,{{|||{{{...((({,..{{({{{{..,}||{,{{{||||||}||,|||}}}||{{|}||..}})}}}}}||,}||,.,.,{{{{||,...(((.((((((......))))))..))).....}}))))}|}|(((((({{,,{((...,,..||||}}}.)))}{{{,{{,|.,{{({{,,,}}},},,)))).)}}........,,,,...{(({{{(((((.(((,,(....,},}))).)))))((((((((((((((((((((((((((((.,....((((.,......,,,,|,.....(((((((({{...,,|||,..}))}}}}..(((((((((((.....)))))))))))....{(((..|.((({.{((........))}.)))).}..)))}...))))....,.)))))))}.....(((((..((((.(...(((((({((,,(((((((..(((((((...((((.(((((.....))))),((((((((.....)))))).)})))).))))))).)))))))..||}{((....))},||{...(((((......)))))....,))),)))))}..)))))..))))).)))).))))))))))))))))...}))))}.})))..}))))))}},}}}}.}}|,{.,,.,,,|{({,.{|{|,||{({(((({{{|,..,,|||||||||..,|,.}||,.,|||||,(((((...{{{{...}}}}...(((((((.((..(((...))))).)))))))((((((((....)))))))).)))))...((((((...........)))))).{{||,,,||||,.||,.,)}}))))}}}},}})}.},.||,((.{{||{,.|{{{..{{,,.,,...,})})||}.||))))|.))|,||||||}||||,||||,|||,|}||||{,.{(((({,(..((..((((((((({...}))))).))))..))..,}}}}},...(((((((((((((.....((((........))))))))).)))))))).,,,,,{,{||||,||},,|||..,,{|((|{{.},..........,.,,}})))..,||||||{|.{||.|{({{.....,,,))))),}))})},......}}}|{(((.....))}}}{{{{|..(({{(((......))))))..,))))).}})))))))),,}}))))}})}},.,}},)))}))))}))))}}}}))}|||{{,,|||||(,,,...},,,}},}}}}})))},}}||{||||||||,,{{(((((,.{{......)})})))))}}},}})))}.},.........|||||........)))))))}))})))))))))}}))),|||{|.,||||..||.,.,,,.|}}},,}.}}})).,,}}