Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0032100
Sequence Length
2967 nt
GC Content
0.4075
UCUUCCAAAUCUCAUGUUAGCAGAGCAGUACUUGAACUUUGCCUUGCAUUUUCAAAAUAUCUGAGUAAUCUGCAGAAUGGGAUGCCCCUGCUCAAGCAAUUGUGUGAUCACGUUCUUCUUAAUCCUGCCAUAUGGAUUCAUACCCCAGCCAAGGUUCAACUGAUGCUCUAUACUUAUCUGUCCACGGAAUUCAUUGGUACAGUCAACAUAUAUAACACCAUUCGGAGAGUUGGAACAGUGCUUCUCAUCAUGCACACGCUGAAGUACUACUACUGGGCAGUGAAUCCUCAGGAUCGAAGUGGUAUCACCCCAAAAGGAUUAGAUGGACCGCGACCUAAUCAAAAAGAAAUGCUUUCUCUACGAGCAUUCUUGUUGAUGUUCAUUAAGCAAUUAGUGAUGAAGGAUUCUGGAGUAAAGGAAGAUGAAUUACAGGCCAUUCUUAAUUACCUACUGACUAUGCAUGAGGAUGACAAUCUAAUGGAUGUCCUACAGCUGCUUGUUGCAUUAAUGUCAGAACACCCUAACUCUAUGAUUCCUGCUUUUGACCAAAGGAAUGGGUUACGUGUUAUCUACAAACUUCUGGCAUCGAAAAGUGAAGGAAUCAGGGUACAAGCUCUUAAGGCAAUGGGUUAUUUUUUAAAACAUCUGGCCCCAAAGAGGAAAGCAGAAGUCAUGCUUGGACAUGGAUUGUUUUCAUUGCUAGCUGAAAGGCUCAUGCUUCAGACAAAUUUAAUCACAAUGACCACAUAUAAUGUGCUGUUUGAGAUUCUUAUAGAACAGAUUGGUACUCAGGUGAUACAUAAACAGCAUCCAGAUCCUGAUUCUUCAGUGAAGAUACAAAACCCUCAGAUACUAAAAGUAAUUGCGACCCUACUUCGAAAUUCUCCCCAGUGCCCAGAGAGCAUGGAGGUUCGCAGAGCCUUUCUUUCUGACAUGAUUAAACUUUUUAAUAACAGUAGAGAAAACAGGAGGAGCUUGCUACAAUGCUCUGUGUGGCAAGAAUGGAUGCUUUCUCUCUGCUAUUUUAAUCCUAAGAAUUCAGAUGAGCAAAAGAUAACAGAAAUGGUAUACGCCAUAUUCAGAAUCCUGCUUUACCAUGCAGUCAAAUAUGAGUGGGGUGGCUGGCGUGUAUGGGUAGACACUUUAUCAAUCACUCAUUCAAAGGUCACUUUUGAAAUACACAAAGAAAACCUUGCCAAUAUAUUUAGGGAACAGCAAGGAAAAGUUGAUGAAGAAAUAGGGCUGUGUUCUUCAACUUCAGUUCAAGCAGCCUCUGGCAUUAGAAGGGAUAUUAAUGUUUCAGUAGGAUCCCAGCAACCAGAUACGAAGGAUUCUCCUGUCUGUCCUCAUUUCACCACAAAUGGUAAUGAAAAUUCAAGUAUAGAGAAGACAAGUUCACUAGAAUCUGCAUCUAAUAUUGAACUGCAAACUACUAAUACAUCUUAUGAAGAAAUGAAAGCUGAGCAAGAAAAUCAGGAGUUACCAGAUGAAGGCACUUUGGAAGAAACACUGACAAAUGAGACAAGGAAUGCAGAUGAUUUAGAAGUAUCUUCUGACAUAAUAGAAGCUGUGGCUAUUUCCUCUAAUUCUUUUAUAACAACUGGCAAAGAUUCAAUGACUGUCAGUGAAGUAACUGCUUCUAUAAGUUCUCCUUCAGAAGAGGAUGCCUCAGAGAUGCCAGAAUUCUUGGAUAAAUCUAUAGUAGAGGAAGAGGAAGAUGAUGAUUAUGUGGAACUGAAAGUAGAAGGCAGUCCUACUGAGGAAGCUAAUCUACCCACAGAGCUCCAAGAUAACAGUUUGUCUCCAGCUGCAUCUGAAGCCGGUGAAAAACUGGACAUGUUUGGUAAUGAUGACAAAUUAAUAUUUCAAGAAGGAAAACCUGUUACUGAAAAGCAAACUGAUACUGAAACUCAAGAUUCUAAAGAUUCUGGAAUUCAGACUAUGACAGCAUCAGGGUCUUCAGCUAUGUCACCAGAAACUACUGUUUCCCAAAUAGCUGUAGAAUCAGACCUUGGUCAGAUGCUGGAGGAAGGGAAGAAAGCAACUAACCUCACUAGAGAAACCAAAUUAAUUAAUGAUUGUCAUGGUAGUGUCUCUGAGGCUUCUUCUGAGCAAAAGAUUGCGAAGUUGGAUGUUUCCAAUGUUGCUACAGAUACUGAGAGGCUGGAGUUGAAGGCCAGUCCCAACGUGGAAGCACCUCAACCUCAUCGACAUGUGCUUGAGAUAUCAAGGCAACAUGAGCAGCCAGGGCAAGGAAUAGCACCAGAUGCAGUUAAUGGACAAAGGAGGGAUUCCAGAUCUACUGUGUUUCGUAUUCCUGAGUUCAACUGGUCUCAGAUGCAUCAACGUUUGCUCACUGAUCUAUUAUUUUCAAUAGAAACAGAUAUACAGAUGUGGAGAAGCCAUUCAACAAAGACAGUUAUGGACUUCGUGAAUAGCAGUGAUAAUGUCAUCUUUGUACACAACACAAUUCAUCUCAUCUCUCAAGUGAUGGACAAUAUGGUCAUGGCUUGUGGGGGUAUACUGCCAUUGCUUUCAGCUGCUACAUCGGCUACACAUGAACUGGAAAAUAUUGAACCUACUCAAGGCCUUUCAAUAGAAGCCUCUGUGACAUUUUUGCAGAGGCUAAUUAGCCUUGUGGAUGUGCUUAUAUUUGCAAGUUCUCUUGGCUUUACUGAAAUUGAAGCUGAAAAAAGUAUGUCAUCUGGAGGAAUUUUGCGGCAGUGUCUCCGACUAGUUUGUGCAGUCGCAGUAAGGAAUUGCUUGGAGUGUCAACAGCAUUCACAACUGAAAACUAGGGGAGAUAAAGCCUUGAAACCAAUGCAUAGCCUUAUUCCUUUAGGGAAAUCUGCAGCGAAGAGCCCAGUGGACAUUGUGACUGGCGGUAUAUCUCCAGUAAGAGAUCUUGACAGGCUUCUACAGGACAUGGAUAUUAAUCGGCUUAGGGCAGUUGUUUUCAGAGACAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-785.9 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -845.98
Frequency: 0.0000
Diversity: 706.63
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((...(((((((((((((((..(((.((((.....((((..(((((((......((((((....)).))))..(((....)))(((....)))...(((....)))...((((..((((((..(((..((((((((..(((((((((..(((...((.((...((((.....(((((((..(....)..))).))))......))))...)).))....)))..))))...((((((((................))))))))....)))))..))))))))..(((.((...((((((((...((....))....)))..)))))))))).(((((.(((((.(((((.......)))))))))).)))))...((((((....))))))))).))))))..)))).....)))))))......)))).....)))).))))).))).))).)))))))(((....)))...))))((((((((((((((((((((.(((((((((.....(((((........(((((((((((((((((((((...(((((........)))))....))).)))..)).))))))..)))))))))))).....(((((..(((.(((..(((.....)))..)))...)))...)))))..(((((.......))))).((.(((((((((..(((((((((.((((..(((....)))))))..........((((.....((((((...((((.(((((((((((..........(((.((((.(((((((.(((((..(((((.((...(((((.((..(((((...))))).......(((((............(((((((.(((((((((......((((...........))))((((((((((((...)))))).....(((((.((..(((....((..((((.(((.(((((((.((.......(((((((((........)))))))))......)).)))))))))).))))..))...)))..))))))).(((((...(((....((((((((....))))).)))...))).)))))..))))))..........)))))))))(((((.(((((((((((.((...........))))))))(((((((...)))))))...............((((((..................))))))....((((((((.......((((((.((.((((((((((((((....(((..((((.........(((((.(((.((...)).))).)))))((((((..........((...((((((((.((..(((((((((((....))))..(((....))).((((((((......((((((.((((.......))))....)))))).....)).)).)))).((....)).)))))))..)).))..........))))))...))...((((((.((((((((((...((((((((........(((((((..(((.((..(((..(((.((((((......)))))).)))..)))..)).))).)))))))........((.....))..........)))))))).........)))))).))))...))))))..((((((.(((((((((((((((...(((((.......((((...)))).....)))))..)).......(((((........(((((.(((..((((....)))).)))..)))))))))).....(((((....((((((.((.((.(((........))).)).)).))))))......)))))..((.(((((((((((((.(((((...(((....))).....)))))............(((((..((.(((.((....)).))).)).))))).......((((((((((((((.(((((((.......(((((....)))))....))))))).......))))))).....))))))).((..(((..((.......))..)))..))...............))))))..))))))).)).))))))))))))).))))))..((((....))))...((((((....)))))))))))).))))..)))...))))))))))))))))))))))....(((....))).......)))))))).(((.(((((....)))))))))))))..))))).((((........)).))....)))))))..........)))))....)))))))..))))))).)))))))))))))))))))))))))((.(((........))))).....((((((......)))))))))))))))....)))))).((((((((..(((.......))))))).)))))))).)))))))))...(((((....)).)))....))))))))).))(((((((((((.(((..((...))..))).)))))((((((((((((((((((((((((((((......((((...................((((((((((.....)))...)))))))..(((((((((((.....)))))))))))....((((..(.((((.(((........))).)))).)..))))...))))......)))))))).....(((((..((((.(...((((((.(((((((((((..(((((((...((((.(((((.....))))).((((((((.....)))))).)))))).))))))).)))))))..((.(((....))).))....(((((......)))))....)))).))))))..)))))..))))).)))).))))))))))))))))...))))))((((..((....)).)))).....)))))))))))))...))))))))))....)).))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
...{{{{...(((((((((((((((..(((.((((.....((((.,(((((((......((({((....||.|||}..(((....))){((....}}}..,(((....}}}|,,((((..{(((((,.,....((((((((..(((((...,,,((({{((,,,{,,,(({{..,..(((((((..(....)..))).))))......,}}}......|,...}),}))))))},,((((((((.............,..))))))))....)))))..)))))))).,|||,|,|..((((({{{|,.({....))....)}}},))))),,},,.(((((.(((({{(((((.......)))))))))).)))))..(((((((....))))))).,.})))))}})))}.....)))))))......)))).....)))).))))).))).))).))))))){{{....}}}...}))}(((((((((((((((({{{(,(((((((((.....,{(({.,,,{..{(((((((((((((((((((((...(((((........)))))....))).)))..))}))))))..)))))))))))).....(((((..(((.(((..(((.....)))..)))...)))...)))))..{((((,..,,,.||}}},((.(((((((((..(((((((((,((((..(((....))))))).,........{(({...,.{((({{....{(({({((((((({{,{,...|||.(((.((((.(((((((.(((((..(((((,{{...(((((,((..(((((...))))).......(((((.....,,.....(((((((,(((((((((.,....,,({(....((((((.(((((((,,,(((,,,,.|||{{((((((((({...,.(((((,...})))))..}}},}})))}...}))}}).))))}),,}.})))))).)).)))).....))},,{(({{((((((..{(((({....,}))),,.)))).))).,,},}......((((((((....))))).)))......((((........))))........)))))))))(((((.{((({{({(((,({...,}}}}}..}}}},},{(((((((...)))))))}...,,,........((((((...,..............))))))....((((((((.{.....((((((.(,{((((((((((((((,...(((..((((.........(((((.{{{.({...}}.}}}.)))))(((((({{{{{,.,.{((,..,|||||}}}},..((((({{((({....}))),,|||...,|||,{((({(({..{.,,,((((,.,,||,,.,,..)))}...,))))}|,....||.}}.,}}}.{{,,...,,}},}}}}...{||{,...,,...}})),}},,.|},}.{(((((.(((((({{((...{{{{{{{{..,,,,..{((((((..(((.((..(((..{{{.((((({......}))))).}}}..)))..)).))).))))))}.......,(({{{,.............)))))))}.,,,.....)))))).})))...)))))}..((((((.((((((((((((((({,,{(,(({{,...,(((..,{{|||,,...,||,,,,{,,,..{{{(.((((.(((...(((((.(((..((((....)))).)))..)))))...)))...)))),.)}}}|{{{||||||{{,{{{,,,{||{..|(((((.....))))).,..{{({{,{..{,,,..,,,}},,...{((({...(((....))).,,..)))),.,},,,}},...{{{{{..|{.|||,||,,,.)),)))}),.}}}}}{{{{{{{({{{((((((((((,(((((((.......(((((....)))))....))))))).......))))))))}},,},}})|}|{{,.{((..,{.......))..)))}.)}...,..,,|,...,,.....,)})))))})))).}}))))))))))).))))))..((({....})))...((((((....)))))))))))).))))..)))...))))))))))))))))))))))....(((....))).......)))))))){{((((((((....)))))))}})))}.,))))).((((........)).))...,)))))))..,,......)))))..,.},)))))..))))))).)))))))))))))))))))})))}}|},|||,,.,,,,,||}...|||.((((((......)))))),,))).,,,.,,,))))}).((((((((..{((.......)}})))).))))}}}}.)))))))))...{{{{{....)).})}....})))))))).}}{(((({(((((.(((,,(,...,},}))).)))))((((((((((((((((((((((((((((.,....((((.,......,,,,|,.....(((((((({{...,,|||,..}))}}}}..(((((((((((.....)))))))))))....{(((..|.((({.{((........))}.)))).}..)))}...))))....,.)))))))).....(((((..((((.(...(((((({((,,(((((((..(((((((...((((.(((((.....))))),((((((((.....)))))).)})))).))))))).)))))))..||}{((....))},||{...(((((......)))))....,))),)))))}..)))))..))))).)))).))))))))))))))))...)))))}{{||..|}}}}})).}})).....)))))))))}}))...))))))))))....)).))))..
Back