Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0035700
Sequence Length
2223 nt
GC Content
0.4022
UCUUCCAAAUCUCAUGUUAGCAGAGCAGUACUUGAACUUUGCCUUGCAUUUUCAAAAUAUCUGAGUAAUCUGCAGAAUGGGAUGCCCCUGCUCAAGCAAUUGUGUGAUCACGUUCUUCUUAAUCCUGCCAUAUGGAUUCAUACCCCAGCCAAGGUUCAACUGAUGCUCUAUACUUAUCUGUCCACGGAAUUCAUUGGUACAGUCAACAUAUAUAACACCAUUCGGAGAGUUGGAACAGUGCUUCUCAUCAUGCACACGCUGAAGUACUACUACUGGGCAGUGAAUCCUCAGGAUCGAAGUGGUAUCACCCCAAAAGGAUUAGAUGGACCGCGACCUAAUCAAAAAGAAAUGCUUUCUCUACGAGCAUUCUUGUUGAUGUUCAUUAAGCAAUUAGUGAUGAAGGAUUCUGGAGUAAAGGAAGAUGAAUUACAGGCCAUUCUUAAUUACCUACUGACUAUGCAUGAGGAUGACAAUCUAAUGGAUGUCCUACAGCUGCUUGUUGCAUUAAUGUCAGAACACCCUAACUCUAUGAUUCCUGCUUUUGACCAAAGGAAUGGGUUACGUGUUAUCUACAAACUUCUGGCAUCGAAAAGUGAAGGAAUCAGGGUACAAGCUCUUAAGGCAAUGGGUUAUUUUUUAAAACAUCUGGCCCCAAAGAGGAAAGCAGAAGUCAUGCUUGGACAUGGAUUGUUUUCAUUGCUAGCUGAAAGGCUCAUGCUUCAGACAAAUUUAAUCACAAUGACCACAUAUAAUGUGCUGUUUGAGAUUCUUAUAGAACAGAUUGGUACUCAGGUGAUACAUAAACAGCAUCCAGAUCCUGAUUCUUCAGUGAAGAUACAAAACCCUCAGAUACUAAAAGUAAUUGCGACCCUACUUCGAAAUUCUCCCCAGUGCCCAGAGAGCAUGGAGGUUCGCAGAGCCUUUCUUUCUGACAUGAUUAAACUUUUUAAUAACAGUAGAGAAAACAGGAGGAGCUUGCUACAAUGCUCUGUGUGGCAAGAAUGGAUGCUUUCUCUCUGCUAUUUUAAUCCUAAGAAUUCAGAUGAGCAAAAGAUAACAGAAAUGGUAUACGCCAUAUUCAGAAUCCUGCUUUACCAUGCAGUCAAAUAUGAGUGGGGUGGCUGGCGUGUAUGGGUAGACACUUUAUCAAUCACUCAUUCAAAGGUCACUUUUGAAAUACACAAAGAAAACCUUGCCAAUAUAUUUAGGGAACAGCAAGGAAAAGUUGAUGAAGAAAUAGGGCUGUGUUCUUCAACUUCAGUUCAAGCAGCCUCUGGCAUUAGAAGGGAUAUUAAUGUUUCAGUAGGAUCCCAGCAACCAGAUACGAAGGAUUCUCCUGUCUGUCCUCAUUUCACCACAAAUGGUAAUGAAAAUUCAAGUAUAGAGAAGACAAGUUCACUAGAAUCUGCAUCUAAUAUUGAACUGCAAACUACUAAUACAUCUUAUGAAGAAAUGAAAGCUGAGCAAGAAAAUCAGGAGUUACCAGAUGAAGGCACUUUGGAAGAAACACUGACAAAUGAGACAAGGAAUGCAGAUGAUUUAGAAGUAUCUUCUGACAUAAUAGAAGCUGUGGCUAUUUCCUCUAAUUCUUUUAUAACAACUGGCAAAGAUUCAAUGACUGUCAGUGAAGUAACUGCUUCUAUAAGUUCUCCUUCAGAAGAGGAUGCCUCAGAGAUGCCAGAAUUCUUGGAUAAAUCUAUAGUAGAGGAAGAGGAAGAUGAUGAUUAUGUGGAACUGAAAGUAGAAGGCAGUCCUACUGAGGAAGCUAAUCUACCCACAGAGCUCCAAGAUAACAGUUUGUCUCCAGCUGCAUCUGAAGCCGGUGAAAAACUGGACAUGUUUGGUAAUGAUGACAAAUUAAUAUUUCAAGAAGGAAAACCUGUUACUGAAAAGCAAACUGAUACUGAAACUCAAGAUUCUAAAGAUUCUGGAAUUCAGACUAUGACAGCAUCAGGGUCUUCAGCUAUGUCACCAGAAACUACUGUUUCCCAAAUAGCUGUAGAAUCAGACCUUGGUCAGAUGCUGGAGGAAGGGAAGAAAGCAACUAACCUCACUAGAGAAACCAAAUUAAUUAAUGAUUGUCAUGGUAGUGUCUCUGAGGCUUCUUCUGAGCAAAAGAUUGCGAAGUUGGAUGUUUCCAAUGUUGCUACAGAUACUGAGAGGCUGGAGUUGAAGGCCAGUCCCAACGUGGAAGCACCUCAACCUCAUCGACAUGUGCUUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-563.5 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -609.59
Frequency: 0.0000
Diversity: 555.18
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.......(((((((....(((((.(((...(((((...(((...)))..))))).....))).....)))))...)))))))......)((((((((..((((((((((((((......(((((........)))))((((((((((((..((((((.(((((.((..(((((..((.((((..(((.(((((((...((((..............((((((...))).)))...((((((((................))))))))...))))..))))))))))...)))).))...))))).........)).))))).))))))........(((((.(((((.(((((.......)))))))))).)))))..(((((((....)))))))...(((((((((((....(((((...((((........))))....)).)))...(((.((.(((..((((....)))).))).))))).......((((((((......(((((((((.(((((........(((((((((((((((((((((...(((((........)))))....))).)))..)).))))))..)))))))))))).((.((((((..((((.((((((((((((......((((((..((.....)).(((((.......)))))(((..((((((((((..........((((..(((....))))))).........(((((..(((..((..((..(((.((((..((...))..)))).))).))..))..))).)))))....)))))..)))))..)))((..(((((...)))))..))......))))))...))))))))...(((.......)))........)))).))))..)))))).))(((((((...)))))))...)))))))))(((((((.......(((.(((.(((((((.((.......(((((((((........)))))))))......)).)))))))))).))))))))))...........)))))))).............(((((....))))).)))))))))))(((((((((((........)))).))))))))))))).).)))))........((((((((((......((((((((...))))))))..............((((((..................))))))....)))))))))).....((((((.((.((((((((((((((....(((..((((.........(((((.(((.((...)).))).)))))((((((..........((...((((((((.((..(((((((((((....))))..(((....))).((((((((......((((((.((((.......))))....)))))).....)).)).)))).((....)).)))))))..)).))..........))))))...))...((((((.((((((((((...((((((((........(((((((..(((.((..(((..(((.((((((......)))))).)))..)))..)).))).)))))))........((.....))..........)))))))).........)))))).))))...))))))..((((((.(((((((((((((((...(((((.......((((...)))).....)))))..)).......(((((........(((((.(((..((((....)))).)))..)))))))))).....(((((....((((((.((.((.(((........))).)).)).))))))......)))))..((.(((((((((((((.(((((...(((....))).....)))))............(((((..((.(((.((....)).))).)).))))).......((((((((((((((.(((((((.......(((((....)))))....))))))).......))))))).....))))))).((..(((..((.......))..)))..))...............))))))..))))))).)).))))))))))))).))))))..((((....))))...((((((....)))))))))))).))))..)))...)))))))))))))))))))))).))))))).............))))..)))..))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.......(((((((..,.(((((.(((,,.(((({...(((...)))..})))).....))).....))))),,.)))))))......)((((((((..(((((({{{(((({......,((((........)))}|((((((((((((,.((((((.(((((.((..,{(((..{(.((((..((,{(((((((.,.((((..............(({,{{...,,)})))...((((((((.............,..))))))))...)))),.))))))))))...)))).)),},|}}}}.........}).))))).))))))........(((((.(((({{(((((.......)))))))))).)))))..(((((((....)))))))...(((((((((((({,.{{{{{,,,{,,,.......,}}})}}..}}.}||,||{,,.,,{(,({{((((..,,||||..}),}))))}}.}}}}{(({{{{{},|...(((((((({.((((,.......,(((((((((((((((((({((...(((((........)))))....))).)))..))}))))))..)))))))))))).{{.((((((..((((.((((.,,,,,,,......{(((({.,{,.....)).(((((.......)))))(((..(((({{(({,,,,,,{...,((((..{((....))))))).........{{{{{..||{.,{{,.....|{{|(((({{(,,..||..,}}}.}))...,,)).,},}.))))).,..}))))}})))))..))){(..(((((...)))))..}}......})}}}}..,,,,}}}|{{,.(({.......))).,},,...)))).))))..)))))).}}(((((((...)))))))...})))))))){(((((,......||{{.{((.(((((((.((.......(((((((((........)))))))))......)).)))))))))).}}}|||}}}}....,,,,.,,}},)))}}.............(((((....))))).))))))))))){{{{{{(((({,,......}})).))))))))))))).).)))))||,.....((((((((({......((((((((...))))))))..............((((((...,..............))))))....)))))))))).....((((((.(,{((((((((((((((,...(((..((((.........(((((.{{{.({...}}.}}}.)))))(((((({{{{{,.,.{((,..,|||||}}}},..((((({{((({....}))),,|||...,|||,(((({(({..{.,,,((((,.,,||,,.,,..)))}...,))))}},....||.}}.,}}}.{{,,...,,}},}}}}...{||{,...,,...}})),}},,.|},}.{(((((.(((((({{((...{{{{{{{{..,,,,..{((((((..(((.((..(((..{{{.((((({......}))))).}}}..)))..)).))).))))))}.......,(({{{,.............)))))))}.,,,....,)))))).})))...)))))}..((((((.((((((((((((((({,,{(,(({{,...,(((..,{{|||,,...,{{,,,,{,,,..{({(.((((.(((...(((((.(((..((((....)))).)))..)))))...)))...)))),.)}}}|{{{||,|||{{,{{|,,,{||,..|(((((.....))))).,..{{{{{,{..{,,,..,,,}},,...{((({...(((....))).,,..)))),.,},,,}},...{{{{,..|{.|||,||,,,.)),)))}),.}}}}}{{{{{{{({{{((((((((((,(((((((.......(((((....)))))....))))))).......))))))))}},,},}})|}|{{,.{((..,{.......))..)))}.)}...,..,,|,...,,.....,)})))))})))).}}))))))))))).))))))..((({....})))...((((((....)))))))))))).))))..)))...)))))))))))))))))))))).,}}}))}...}}}.......}}}},,)))..))))))))
Back