Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0040100
Sequence Length
1422 nt
GC Content
0.4001
GCUAUUGCAUUACCUCCUAUAGCCAAAUGGCCAUACCAGAAUGGUUUUACAUUUCAUACAUGGCUUAGAAUGGAUCCUGUAAAUAACAUCAAUGUAGAUAAGGAUAAACCAUAUUUGUAUUGUUUCAGAACCAGCAAAGGUCUUGGCUAUUCUGCUCAUUUUGUUGGAGGCUGUUUGAUUGUAACAUCAAUAAAGUCAAAAGGAAAAGGCUUUCAACACUGUGUGAAAUUUGAUUUCAAGCCACAAAAGUGGUAUAUGGUUACCAUAGUACACAUCUAUAACCGAUGGAAGAAUAGUGAACUUCGAUGUUAUGUGAAUGGUGAGCUGGCUUCCUAUGGAGAGAUAACAUGGUUUGUCAACACUAGCGAUACCUUUGACAAAUGUUUCCUGGGCUCAUCAGAAACAGCAGAUGCUAAUAGAGUAUUCUGUGGUCAGAUGACUGCAGUUUACCUUUUCAGUGAAGCUCUAAAUGCAGCUCAGAUAUUUGCUAUUUAUCAGUUGGGCCUGGGAUACAAGGGUACAUUUAAAUUCAAAGCAGAAAGCGACCUUUUCCUUGCUGAGCAUCACAAACUUUUAUUGUACGAUGGGAAACUCUCUAGUGCCAUUGCAUUCACGUACAAUCCACGGGCUACAGAUGCCCAGCUUUGUCUUGAAUCAUCUCCUAAGGACAACCCUUCAAUUUUUGUUCAUUCACCACAUGCACUCAUGCUCCAGGAUGUAAAGGCAGUUUUAACACAUUCCAUCCAAAGUGCAAUGCAUUCAAUUGGAGGAGUACAAGUACUAUUUCCACUUUUUGCACAGUUGGAUUACAGGCAAUAUUUGUCUGAUGAGAUUGAUUUGACUAUAUGUUCAACCUUGCUGGCCUUUAUCAUGGAAUUGUUGAAGAACUCAAUUGCUAUGCAGGAACAGAUGCUUGCCUGUAAGGGCUUCUUGGUAAUAGGAUAUAGCCUUGAAAAGUCUUCCAAAUCUCAUGUUAGCAGAGCAGUACUUGAACUUUGCCUUGCAUUUUCAAAAUAUCUGAGUAAUCUGCAGAAUGGGAUGCCCCUGCUCAAGCAAUUGUGUGAUCACGUUCUUCUUAAUCCUGCCAUAUGGAUUCAUACCCCAGCCAAGGUUCAACUGAUGCUCUAUACUUAUCUGUCCACGGAAUUCAUUGGUACAGUCAACAUAUAUAACACCAUUCGGAGAGUUGGAACAGUGCUUCUCAUCAUGCACACGCUGAAGUACUACUACUGGGCAGUGAAUCCUCAGGAUCGAAGUGGUAUCACCCCAAAAGGAUUAGAUGGACCGCGACCUAAUCAAAAAGAAAUGCUUUCUCUACGAGCAUUCUUGUUGAUGUUCAUUAAGCAAUUAGUGAUGAAGGAUUCUGGAGUAAAGGAAGAUGAAUUACAGGCCAUUCUUAAUUACCUACUGACUAUGCAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-367 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -398.8
Frequency: 0.0000
Diversity: 361.01
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((......)))(((.(((((.((...((((((....(((((......))))).....)))))).(((((((..(((((((....((((((((((((((.((.....)).)))))))))).(((((((((((((((.(((...(((......)))(((..(((((((((((.(((((((.............))))))).......)))))))))))..)))((((((...)))))).(((((....))))).(((((...))))).....((((.......))))(((.((((((.((..(((((.(((((.(((((((((((((.((((((..((((.((...(((((((((((((...((....))...)))))))))((.(((((((((((....(((.((((((((((...((.(((..((((((((....))))))))..))))).........(((((.....).)))).)).)))))))).)))......))))))))))).)).((((...((((((...((((((....(((((........))))).................((((((((..((((...)))).(((((....)))))..))))))))....((((.......)))).))))))..))))))....))))..((((((...........))))))........))))...))...)))))))).....)).))))))..)).))))))((((((.((((((..........((((((((((....)))).))))))....))))))..))))))..(((((((...))))))))))).))))).)).))))).).))).))))))))))((((((((((..(((((((...((((.((((((((..(((((.((((........)))).(((((((((((....)))))...))))))..............(((((((....(((((.(((...(((((...(((...)))..))))).....))).....)))))...)))))))...)))))...)))))))).(((((.((...((((...((((((......((((((((..(((((((((..(((...((.((...((((.....(((((((..(....)..))).))))......))))...)).))....)))..))))...((((((((................))))))))....)))))..)))))))).)))))).))))..))))))).((....))..(((.(.(....).).)))(((((.(((((.(((((.......)))))))))).)))))))))....))))))).)))))))))).))))))))........))))..))))))))))))))...........)).)))))...)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({(({.......,,,,.,||||}(..,,((((((....(((((......))))),....)))))|.(((((((..(((((((....{{,(((((((((((.((.....)).)))))))))}|,((((({,(((((((((((...,((,.,,,,|||{{{..(((((((((((.{((((((.............)))))},.......)))))))))))..||}((((((...}))))).(((((....)))))...,({{{{,}|||{....{,{||,|}}|,}}||(({{,{{{{{.{{,,{{{{{.{{{{{,{(({({{{{((((.({{{(,.{({{{.{{...|||{{{((((({{...,{,...}},,.))))))}}|((.(((((((((((.{.{(((.((((((((({.,.((.(((..((((((((....))))))))..))))).,,.,,|(,{((({.....).)))))},.)))))))).})}.}}.}.))))))))))).))|{{{{|........,,,|,,|||}|||||}||,}}}},,,}}||||.{{{{{..,..,,...((((((((.{((({...,,}}.{((((....))))},,))))))))....||{{....,,,))}),))}}}}|||}}},|,,{{{{{{.|||||||,}}},.......}|},,........}}}}....}.||||||||||,....}|.}|||}},.,}.}}}}}|{(((((.(((({{.,.,......((((({((({....}))).})))))....})))))..)))))}..(((((({...})))))),))),))))}.}|{||,,,..,)))}))}})))}))((((((((((..((((((({(,((((.((((((((..(((((.((((........)))).(((((((((((....}))))...)))))}||....,.,,....(((((((..,.(((((.(((,,.(((({...(((...)))..})))).....))).....))))),,.)))))))...)))))...)))))))).({({(.,(|,,({((...((((((......((((((((..(((((...,,,((({{((,,,{,,,((({..,..(((((((..(....)..))).))))......,}}}......|,...}),}))))))},,((((((((.............,..))))))))....)))))..)))))))).)))))).))}},|||}}))).{{....)).,|||,{||,,..,.,.},,(((((.((({{{(((((.......)))))))))).))))))))).}}.))))))).)))))))))),)))))))),,.,,,..)))),.))))))))))))))............}.}}}}},}}}})
Back