Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0041700
Sequence Length
1708 nt
GC Content
0.4063
UUGGUAGGAGGACAGUUUGAUCUGGAAAUGAAUUUCAUUAUCCAAGAAGGUGAGAGUAUUAACUGCAUGGUGGACCUACUGGAAAAAUGUGACAUUACGUGCCAAGCAGAAGUCUGGAGCAUGUUUACAGCCAUUCUGAAGAAAAGCAUACGGAAUCUUCAAGUCUGCACUGAAGUAGGCCUUGUUGAAAAAGUGCUUGGGAAAAUUGAAAAAGUUGACAAUAUGAUAGCAGAUCUUUUGGUUGACAUGUUGGGAGUGCUGGCUAGCUAUAAUUUGACAGUUCGCGAGCUAAAGCUUUUCUUCAGUAAACUUCAAGGAGAUAAAGGACGAUGGCCUCCACAUGCUGGGAAGUUGCUGUCUGUGUUAAAGCAUAUGCCUCAGAAGUAUGGUCCUGAUGCCUUUUUUAACUUUCCAGGAAAGAGUGCUGCAGCUAUUGCAUUACCUCCUAUAGCCAAAUGGCCAUACCAGAAUGGUUUUACAUUUCAUACAUGGCUUAGAAUGGAUCCUGUAAAUAACAUCAAUGUAGAUAAGGAUAAACCAUAUUUGUAUUGUUUCAGAACCAGCAAAGGUCUUGGCUAUUCUGCUCAUUUUGUUGGAGGCUGUUUGAUUGUAACAUCAAUAAAGUCAAAAGGAAAAGGCUUUCAACACUGUGUGAAAUUUGAUUUCAAGCCACAAAAGUGGUAUAUGGUUACCAUAGUACACAUCUAUAACCGAUGGAAGAAUAGUGAACUUCGAUGUUAUGUGAAUGGUGAGCUGGCUUCCUAUGGAGAGAUAACAUGGUUUGUCAACACUAGCGAUACCUUUGACAAAUGUUUCCUGGGCUCAUCAGAAACAGCAGAUGCUAAUAGAGUAUUCUGUGGUCAGAUGACUGCAGUUUACCUUUUCAGUGAAGCUCUAAAUGCAGCUCAGAUAUUUGCUAUUUAUCAGUUGGGCCUGGGAUACAAGGGUACAUUUAAAUUCAAAGCAGAAAGCGACCUUUUCCUUGCUGAGCAUCACAAACUUUUAUUGUACGAUGGGAAACUCUCUAGUGCCAUUGCAUUCACGUACAAUCCACGGGCUACAGAUGCCCAGCUUUGUCUUGAAUCAUCUCCUAAGGACAACCCUUCAAUUUUUGUUCAUUCACCACAUGCACUCAUGCUCCAGGAUGUAAAGGCAGUUUUAACACAUUCCAUCCAAAGUGCAAUGCAUUCAAUUGGAGGAGUACAAGUACUAUUUCCACUUUUUGCACAGUUGGAUUACAGGCAAUAUUUGUCUGAUGAGAUUGAUUUGACUAUAUGUUCAACCUUGCUGGCCUUUAUCAUGGAAUUGUUGAAGAACUCAAUUGCUAUGCAGGAACAGAUGCUUGCCUGUAAGGGCUUCUUGGUAAUAGGAUAUAGCCUUGAAAAGUCUUCCAAAUCUCAUGUUAGCAGAGCAGUACUUGAACUUUGCCUUGCAUUUUCAAAAUAUCUGAGUAAUCUGCAGAAUGGGAUGCCCCUGCUCAAGCAAUUGUGUGAUCACGUUCUUCUUAAUCCUGCCAUAUGGAUUCAUACCCCAGCCAAGGUUCAACUGAUGCUCUAUACUUAUCUGUCCACGGAAUUCAUUGGUACAGUCAACAUAUAUAACACCAUUCGGAGAGUUGGAACAGUGCUUCUCAUCAUGCACACGCUGAAGUACUACUACUGGGCAGUGAAUCCUCAGGAUCGAAGUGGUAUCACCCCAAAAGGAUUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-452.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -488.58
Frequency: 0.0000
Diversity: 326.41
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((...((...((.((((((((((((((((...))))).))).(((((((((((((((((..(((((..((((.....((((...(((((.....((.((((..(((.....((((((((((......((..(((....)))..))........((..(((((((((......))))).))))..))...(((((.((((.....(((((((((((((((((((.((((.((....)).)))).)))))))((((((((((..((((.((.((((........)))).)).)))).....)))))..))))).(((((((..(((((((.(((((((((((.(((((((((((......((((((..((.(((((.......)))))))..))))))......))))))))))).).((.(((.((((.....)))).))))).....(((..((((((((.(((....(((((((........((((.((.((......)).))))))........(((((((((((.((.....)).)))))))))))....))))))).....)))..))))))))..))).....)).))))))))..((((((.............))))))(((((((((((((((......(((((...((((((((((.(((.(((..((((((......))))))......((((.......))))((((.........))))((((....(((((((.((((((((((((...(((((((........(((((((((...((....))...)))))))))(((((.(((.....))))))))(((....)))......(((..((((((((....))))))))..))))))))))..)))))........)))))))..)))))))....))))..)))))).)))))).))))..)))))..............))))))...)))))))))((((.(((((.....((...((((((((..((((...)))).(((((....)))))..))))))))....))......))))).)))).))))))).....))))))).(((.....)))))))))))..))))....)).)).)))))))))))))))..)))...)))))).....)))))))))))))..))))).((((......((((((((((....)))).)))))).....)))).(((((((((((((((((...))))))).......))))))))))....(((.(((((((((((((........)).......(((((((..(((((((..(((((.((((........)))).(((((((((((....)))))...))))))..............(((((((....(((((.(((...(((((...(((...)))..))))).....))).....)))))...)))))))...)))))...)))))))(((....))))))))))..(((((........)))))......)))).))))))).)))))))))))).))))).)))......(((.(((((((...((((..............((((((...))).)))...((((((((................))))))))...))))..))))))))))...)))))))).))...))...)))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((...((...((.((((((((((((((((...))))).))),(((((((((((((((((..(((((..((((.....((((,..{((((..,..((.((((..(({....{((((((((((......,...(((((.,,,....,.,.}}}},|(..(((((((((......)))))},)))..)}...(((((.((((,,,,.{(((((((((({(((((((.((((.((....)).)))).)))))))((((((((((..((((.{{.{({{.......})))),}}.}))).....}))))..})))).(((((((..((((((({((((((((({{.(((((((((((......((((((..{({((({{....,..))))),}..))))))......))))))))))).}..({(((.((((,...,)))).))}})}....(((..((((((((.(((....(((((((,{{.,,,{{,{{.{{.,....,|}}|,|||}}}........{{{{||{{{{{,||,,...)),)})))))))))....})))))).....)))..))))))))..))).....}),})))))))}}{(((((.............)))))}(((((((((((((((....{(((,(({({({{{|,,,},.(((((....)))))...,{,,{{||||,,,.{.{{{{{,{,,{,,|||((((..,,,,..,||||.},}},,|||}||.||||.||||{|||||,,||},..|||.,}}},},||||||...,}}},..||||,|}|}}}..{((.(((((((((((.{.{(((.((((((((({.,.((.(((..((((((((....))))))))..))))).,,.,,|(,{((({.....).)))))},.)))))))).})}.}}.}.))))))))))).))),|}}},,..,,,,}))),..}}}))))),..})))))))))((((.(((((.....((...((((((((.,((({...,,}}.{((((....))))},,))))))))....)),.....))))).)))).,)))))).....))))))).(((.....)))))))))))}.,)))})..)),}}.)))))))))))))))}.}}}...)))))).....)))))))))))))..))))).((((......((((({((((....)))).}))))).....)))).(((((((((((((((({...})))))).......))))))))))....(((.(((((((((((((........}}....,..(((((((.{(((((((..(((((.((((........)))).(((((((((((....}))))...)))))}||....,,,,....(((((((..,.(((((.(((,,.(((({...(((...)))..})))).....))).....))))),,.)))))))...)))))...)))))))|,|....}}})))))))..{((((........))))}......)))),,)))))).)))))))))))).))))).)))......((,,(((((((.,.((((..............(({,{{...,,)})))...((((((((.............,..))))))))...)))),.))))))))))...}))))))).))...))...)))).........
Back