Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRP6_0003800

Sequence Length

474 nt

GC Content

0.4684

GACAGCACCCUUGUGCUCAGGAUAAUGGUGGCUGUUCACAUAUUUGUCUUGUAAAGGGGGAUGGUACUACAAGGUGUUCUUGCCCCAUGCACCUGGUUCUACUUCAAGAUGAGCUAUCAUGUGGAGAACCUCCAACAUGUUCUCCUCAGCAGUUUACUUGUUUCACGGGGGAAAUUGACUGUAUCCCUGUGGCUUGGCGGUGCGAUGGGUUUACUGAAUGUGAAGACCACAGUGAUGAACUCAAUUGUCCUGUAUGCUCAGAGUCCCAGUUCCAGUGUGCCAGUGGGCAGUGUAUUGAUGGUGCCCUCCGAUGCAAUGGAGAUGCAAACUGCCAGGACAAAUCAGAUGAGAAGAACUGUGAAGUGCUUUGUUUAAUUGAUCAGUUCCGCUGUGCCAAUGGUCAGUGCAUUGGAAAGCACAAGAAGUGUGAUCAUAAUGUGGAUUGCAGUGACAAGUCAGAUGAACUGGAUUGUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-139.7 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -149.83

Frequency: 0.0000

Diversity: 163.49

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((..((((.((((((((((((((((..(((........)))..)))))))).....((((..((.((........)).))..))))..((((((((..((((((((((.((((((....((.(((((((.........))))))).))..))))))))))...(((((((..............)))))))((...((((.((((((((((((.....((((.....))))....))))))).))))).))))..))...))))...))..)))).))))....(((((.(((....))).)))))(((((((((.(((....(((....((..((((..(((((.(((((((.(((....))).))))..))).)))))..)))).))..)))......))).))))))))).))))))))..))))..))(((((.(((.((....(((....)))....))))).)))).)

Thermodynamic Ensemble Prediction

(({,(((({{((((,(,{{{{||||.}||{,,,,,},|||},,|||}||||....{{{({{.(((((({,..,|||,.|||{||||..((((((((..((((((((((.((((({....((.(((((((.........))))))).)),.})))))))))...{(((((({.,,{,,....|,||}|||||((,,.((((.((((((({{{{{,,...{{|{,,,.,)))),.}}))})})))}))}),))))..))...))))...))..)))).))))..,.|||||},{|.}}.,))}))))}|||{,((({.{{{...||||..|,{|,,((((..(((((.(({((((.(((....))).))))..})}.)))))..)})),||{|,|{,...,|}}},}|||||}||.,||||},,..))))..)),||||.|,|.|}}}}.}{{|,,.||||..,,,))).,))))}