Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRP6_0005000

Sequence Length

336 nt

GC Content

0.4405

GUGCUAACCGGAUAGUAUUAGAAGACUCCAAUAUCUUGCAGCCUGUGGGACUUACUGUGUUUGAAAACUGGCUCUAUUGGAUUGAUAAACAGCAGCAAAUGAUUGAAAAAAUUGACAUGACAGGUCGAGAGGGUAGAACCAAAGUCCAAGCUCGAAUUGCCCAGCUUAGUGACAUUCAUGCAGUAAAGGAGCUGAACCUUCAAGAAUACAGACAGCACCCUUGUGCUCAGGAUAAUGGUGGCUGUUCACAUAUUUGUCUUGUAAAGGGGGAUGGUACUACAAGGUGUUCUUGCCCCAUGCACCUGGUUCUACUUCAAGAUGAGCUAUCAUGUGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-76.1 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -85.24

Frequency: 0.0000

Diversity: 90.37

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((..((((((.........(((.((((((.(((((((.(((....(((.((..(((((((((((...(((((((((((.((.((....(((((.....)).)))......(((((.......)))))..((......))...(((((((((.(......).))))).).)))..)))).))))...)))))))....))))..)))))))..))..)))....)))))))))).))).)).).)))(((....)))..((((...((((..((.((........)).))..)))).)))).)))))).)))(((.(.((((....)))).).)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((..((((((,,,(({(..{((.{(,(((.(((((((.(((,...(((.((..(((((((((((...,(((((({(((.{{,({....{{,{{.....}}.}}}......(((((.,,....)))}}..(({,,...}}...(({{{{(({.{...,,,),})))).}.)))..)))),))))...}))))),....)))),,}))))))..))..)))..}.)))))))))).))).}}.}.})).,}},,,,))}}|{|{..{(((,,.((,((,....,}})}.)}}.)))).)))}.}))))).)))(((.{.((((....)))).).)))