Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRP6_0006700

Sequence Length

1118 nt

GC Content

0.4767

AUUUAUGUAUUGGACUGAAUGGGGUGGAAAACCUAAGAUAGACAGAGCUGCAAUGGAUGGAAGUGAACGUACUACCUUAGUUCCAAAUGUGGGGCGGGCAAACGGCCUAACUAUUGAUUAUGCUAAAAGGAGGCUUUAUUGGACAGACCUGGACACCAACUUAAUAGAAUCUUCAAAUAUGCUUGGGCUCAACCGUGAAGUUAUAGCAGAUGACUUGCCUCAUCCUUUUGGCUUAACUCAGUACCAAGAUUAUAUCUACUGGACGGACUGGAGCCGACGCAGCAUUGAGCGUGCCAACAAAACCAGUGGCCAAAACCGCACCAUCAUUCAGGGCCAUUUGGAUUAUGUGAUGGACAUCCUCGUCUUUCACUCAUCUCGACAGUCAGGGUGGAAUGAAUGUGCUUCCAGCAAUGGGCACUGCUCCCACCUCUGCUUGGCUGUGCCAGUUGGGGGUUUUGUUUGUGGAUGCCCUGCCCACUACUCUCUUAAUGCUGACAACAGGACUUGUAGUGCUCCUACGACUUUCCUGCUCUUCAGUCAAAAGAGUGCCAUCAACCGCAUGGUGAUUGAUGAACAACAGAGCCCCGACAUCAUCCUUCCCAUCCACAGCCUUCGGAAUGUCCGGGCCAUUGACUAUGACCCACUGGACAAGCAACUCUAUUGGAUUGACUCACGACAAAACAUGAUCCGAAAGGCACAAGAAGAUGGCAGCCAGGGCUUUACUGUGGUUGUGAGCUCAGUUCCGAGUCAGAACCUGGAAAUACAACCCUAUGACCUCAGCAUUGAUAUUUACAGCCGCUACAUCUACUGGACUUGUGAGGCUACCAAUGUCAUUAAUGUGACAAGAUUAGAUGGGAGAUCAGUUGGAGUGGUGCUGAAAGGCGAGCAGGACAGACCUCGAGCCGUUGUGGUAAACCCAGAGAAAGGGUAUAUGUAUUUUACCAAUCUUCAGGAAAGGUCUCCUAAAAUUGAACGGGCUGCUUUGGAUGGGACAGAACGGGAGGUCCUCUUUUUCAGUGGCUUAAGUAAACCAAUUGCUUUAGCCCUUGAUAGCAGGCUGGGCAAGCUCUUUUGGGCUGAUUCAGAUCUCCGGCGAAUUGAAAGCAGUGAUCUCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-327.7 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -350.62

Frequency: 0.0000

Diversity: 328.72

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((.....))))((((...((((.....))))...((((((((((((.........((.((((....)))).))...((((((....))))))((((.....))))...(((((((((.(((((((((((((.....((..((....))..)).................(((....((((..((((((....)).))))..))))..)))...)))...)))))))))).))).))))))(((((((...))))..))).(.((((((((((((.((((....(((((((((.......(((((((((....................))))).)))).....((((.((((......)))).))))((((.((.((.......)).))))))...((((...))))...))))).))))......))))))))))...)))))).).))))))))))))...(((((.(((..((((.(((((...(((((...(((((.((((((.....))))))...)))))....)))))...))))).).((((((.(((...))).))))))......((((..((..(....((..(((((((((((((((...(..((((((((.(((.....))).)))...)))))..).((((....(((((((((((((((...((((((.((....(((.((......))...)))..))..))).))).)))))))).))))))).))))(((...)))(((((((((((((...(((.((((...........((((.(((((.((((((((.(((.(....(((....((((((....))))))....)))..).))).)))).)))))))))))))...(((..(.(((.....))))..))))))).)))............)))))...))))))))..((((.((.((((......)))))).))))...))))))...)))))))))..))...)..))..))))...((((.((((.((((((.....)))))).)))).)))))))..))).)))))(((((....))))).....(((((.(..((.........)).).))))).))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

,{,,,.,,..{({{((((,{{((((,,...,}||,...||{,{,,.(((,{..,,,.{({,{{{{...,},}},,}}}}||||||...,||||||(({{...},})))...(((((((((.(((((((((((((..,.,((,.,{....||,.,,}}|.......,|,....,|.....,{{{,|({,{{,.,,.,}|{|||{{,,,,.})))}},))),..}))))))))).))).)))))}(({((({...))))..))).{.({((({{({{{(.((((....{{(((((((.......{{{(((({{.......,.....,.,,...}}))),}})).,...((((.((((......)))).)))){{{||{,,{,,,,|,||||||,,.,,..,((({.,,}}},.,,))))).)))),,,,,.))))))))))...))))}|,((({(((((({.((((..{{...}})))),{({((,((...(((((..,(((((.((((((.....))))))...))))).,..))))).,.,))))}).((((((.(((...))).))))))...})))))))))),,,....||,.(((((((((,,(((((((({.((((((((.(((.....))).)))...)))))..|,,.{(...,||{|||,|{{{,{,{....,.,|,}}|},,,)}|.........,|({{{{{.,||{{||,{,||{||||||||.|||||.|.||||{|.,..,|{({{{{{{{{{{{{.,,|{{,|{|{,,,,,..,||,||{||{((((.(({{{{{{.{{{,||,,,|{{....((((((....))))))....}}}.||,|||,|}}}|||||}}}}}}}}}.,.(((..(.(((.....))))..))),}}}.)}}..,,{{......}))))...)}}}}}}}.}||,,,||}||{{..,,,,)))),..,}}}...,)))))},.)))))))))..},..(((((((((((({{{((((.((((.((((((.....)))))).)))).}))}..|{,|{(((((,.(((((....)))))..})))).}}}}}.)}....,})))).)).)))))))),}