Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRP6_0011400

Sequence Length

898 nt

GC Content

0.4577

GCAGGCAGUGGUUAAAGGUUCCCUUCCACAUCCUUUUGCCUUGACGUUAUUUGAGGACAUAUUGUACUGGACUGACUGGAGCACACACUCCAUUUUGGCUUGCAACAAGUAUACUGGUGAGGGUCUGCGUGAAAUCCAUUCUGACAUCUUCUCUCCCAUGGAUAUACAUGCCUUCAGCCAACAGAGGCAGCCAAAUGCCACAAAUCCAUGUGGAAUUGACAAUGGGGGUUGUUCCCAUUUGUGUUUGAUGUCUCCAGUCAAGCCUUUUUAUCAGUGUGCUUGCCCCACUGGGGUCAAACUCCUGGAGAAUGGAAAAACCUGCAAAGAUGGUGCCACAGAAUUAUUGCUUUUAGCUCGAAGGACAGACUUGAGACGCAUUUCUUUGGAUACACCAGAUUUUACAGACAUUGUUCUGCAGUUAGAAGACAUCCGUCAUGCCAUUGCCAUAGAUUACGAUCCUGUGGAAGGCUACAUCUACUGGACUGAUGAUGAAGUGAGGGCCAUACGCCGUUCAUUUAUAGAUGGAUCUGGCAGUCAGUUUGUGGUCACUGCUCAAAUUGCCCAUCCUGAUGGUAUUGCUGUGGACUGGGUUGCACGAAAUCUUUAUUGGACAGACACUGGCACUGAUCGAAUAGAAGUGACAAGGCUCAAUGGGACCAUGAGGAAGAUCUUGAUUUCAGAGGACUUAGAGGAACCCCGGGCUAUUGUGUUAGAUCCCAUGGUUGGGUACAUGUAUUGGACUGACUGGGGAGAAAUUCCGAAAAUUGAGCGAGCAGCUCUGGAUGGUUCUGACCGUGUAGUAUUGGUUAACACUUCUCUUGGUUGGCCAAAUGGUUUAGCCUUGGAUUAUGAUGAAGGCAAAAUAUACUGGGGAGAUGCCAAAACAGACAAGAUUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-254.5 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -273.15

Frequency: 0.0000

Diversity: 238.31

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((.((((...((((...))))))))..((((..(((.....((((.((.((.(((...))).)).)).))))(((((......))))).....(((((...))))).....))))))))))))).(..((((...((((........((((((..(..(((...((((((((.......(((((((((((((.(((((......))))).))).((((..((((....))))..))))((((((...(((((((((((((...........).)))))....)))))))))))))(((........))).....(((.((((.((((((((.((((....(((((((((.((........)).)))))).))).)))).)))...)))))..)))).)))........((((((((((((..((((((((((((((((((((.(((((.((.(((.(((((.(....).))))).))).((((.(((((.(((..((((....(((((........)))))...))))..))).))))).))))...........((((((((..(((((...)))))))).)))))....)).)))))....))).)))....))))).))))............(((((((((...(((.((.((((.....((((........))))))))..))..))).))))).))))(((((.(((((((........))))....))))))))(.((((....)))).).....((((.....)))).))))).)))))))..)))))..(((((((((.(.......)))))))))).)))))..))))).........))))))))..)))..)..))))))........))))...)))).).

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((..((((...((((...))))))))..))}..,))(((({.((((.((.((.,((...}),.)).)).))))(((((......))))),((((((,{{,..|,,}}.....,},{{{{(({.{.(((.....))}.}.)}}.,)}}}((((((..(,,(((...((((((((.......((((({(((({{,.(((((......))))).,}}.((((,,((({....)))),.))))......{.((((((((((..((....{{,..(((((((({..(((.(((((((.((((((........))}.....{((,({{{.((((((((,(((,..,,((((((((({({..,{,,,,|,,}}||||.}}}.,}}|,|||...}}))),,})},.}))...,}}}))},}}}|}}}}|{,,,((((((..(((.{{.((((((,,.....|,})))))|,)))..{{{{,,,.,,,.,|||}|||(({(((,(((.....))).|}}})}}...)))))}}.}}))}|)}}.)))))})}))}}|,,,.....((((((((..{{(({...})))}))).)))))}}}}.}...,,{{{{{{.{{(((.....,.,,})).)).}}}})),}},(((((((((...(((.((.({((.....((({,....,,}),,,)))}..))..))).))))).))))))).)))))))))).,)))))))))})..))..)))))))))).}...,,........((((.....))))((.(((((....))))).))...(((((((((.(.......)))))))))).))))}..))))).........))))))))..)))}.),.)))))).))))}},,,,,...,.)))))