Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRP6_0013100

Sequence Length

592 nt

GC Content

0.4139

CGGCCCCUUUGUUGCUUUAUGCAAACAGACGGGACUUGCGAUUGGUUGAUGCUACAAAUGGCAAAGAGAAUGCUACGAUUGUAGUUGGAGGCUUGGAGGAUGCAGCUGCGGUGGACUUUGUGUUUAGUCAUGGCUUGAUAUACUGGAGUGAUGUCAGCGAAGAAGCCAUUAAACGAACAGAAUUUAACAAAACUGAGAGUGUGCAGAAUGUUGUUGUUUCUGGAUUAUUGUCCCCCGAUGGGCUGGCAUGUGAUUGGCUUGGAGAAAAAUUGUACUGGACAGAUUCUGAAACUAAUCGGAUUGAAGUUUCUAAUUUAGAUGGAUCUUUACGAAAAGUUUUAUUUUGGCAAGAGUUGGAUCAACCCAGAGCUAUUGCCUUAGAUCCUUCAAGUGGGUUCAUGUACUGGACAGACUGGGGAGAAGUGCCAAAGAUAGAACGUGCUGGAAUGGAUGGUUCAAGUCGCUUCAUUAUAAUAAACAGUGAAAUUUACUGGCCAAAUGGACUGACUUUGGAUUAUGAAGAACAAAAGCUUUAUUGGGCAGAUGCAAAACUUAAUUUCAUCCACAAAUCAAAUCUGGAUGGAACAAAUCG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-150.1 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -163.85

Frequency: 0.0000

Diversity: 183.64

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((.((((((((.....)).)))))).))).).))(((((((((...(((((((.(((((.......)))))...)))))))....))))..(((..((((.((((..((((((((...((((((((((((((......((((.......)))).....)))))))........(((((..((((((..(((........)))....)))))).)))))......(((((....(((((((.((((.(((((((.((..((((...((((.....)))).))))..))))))))).))(((((..(((((...(((((((.((((....)))).))))))).(((((.((((((......)))..))).))))))))))..))))).)).))))))).....))))))))))))..))))).))).........(((.(......).)))((((((((((.((((((........((((((...))))))....)))))).)))).)))))).((((((........))))))...)))).))))...)))..(((((((((...........)))))))))..)))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((.((((((((.....))}}})))).))).)}})((((({(((...(((((((.(((((.......)))))...))))))),,.,||||..(((..((((,(({((({(((({{(,((((({,.,(((((((,{,,,.(,,,.,,.}}})))}.....}))))))}}}}}...((({,..{,,{{,..|||....,.,.|||.{{{||,|||{||,||{....{{,|||{|,|.,,,,||{{||{{{((((,({(({{((.....{(((.....}}}}.}}}|(({{||..|||...|{|||}}||||....,||{|||.||||.}}},}))}))))}},.(((((.((((((......))}..})}.}))))....,,,|}|}}|||.}||||}}}}.,|||.}}..|,}}}}).}}.,.))).}})))))))}),))},},.,,|{(((((((((((.((((((........((((((...))))))....)))))).))))))})))))}},|{|..,,,.,}})))}},,.)))).))))...))}..{((((((((...........))))))))),.)))))