Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MACF1_0036700

Sequence Length

384 nt

GC Content

0.5052

GAUUUGAAACAGCCCAUGGCUGAAAGGAAAGCUCAGCUGGAUGCUCUUGCUUUUGAUAUUCAGUUCUUUAUCUCAGAACAUGCCCAGGACUUGUCCCCUCAGCAGAAUCGACAGAUGCUGAGGCUUCUGAAUGAACUGCAGAGGUCCUUCCAGGACAUUUUGGAACAGACUGCCGCUCAGGUGGAUGCCUUGCAGGGCCAUCUUCAACAAAUGGAGCAGGAAGCCCUGGUGAAGACCCUGCAGAAACAACAAAAUACCUGUCACCAGCAACUGGAGGAUCUUUGCAGUUGGGUAGGACAGGCAGAAAGAGCACUGGCAGGCCACCAAGGCAGAACCACCCAGCAGGAUCUCUCUGCUUUGCAGAAGAACCAAAGUGACUUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-124.6 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -130.61

Frequency: 0.0001

Diversity: 76.23

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((....(((((...)))))....((((((..(((.....)))...))))))......((((((......((((((...((((((.(.(((((...((....))...))))).).))).)))))))))..))))))...)))))((((.(((.((((((((......(((((.....(((((.((((((((((((...((((((.((...((.((.....)))))).)))))))))))))).............(((((((((..((((((.((.....)).)))))))))..)))))).............))))..)))))..)))))......((....)).(((.(((((...)))))))).)))))))).)))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((....(((((...)))))....((((((..(((.....)))...))))))......((((((......((((((...((({{(,(.{{{{|.,,((,,,.}}...}}}}).),))),))})))))),.)))))).,.)))))((({,(((.((((((((......(((((.....(((((.(((({(((((((...((((((.(,...((.((.....))))}}.)))))))))))))}.............((((((,{{..((((((.((,...,)).))))))}}}..)))))).............))))..)))))..)))))..,,..{,....)).{{(.(((((...)))))})).)))))))).)))))))