Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MACF1_0042000

Sequence Length

851 nt

GC Content

0.4830

AUUCCAUACUCAGCCACUUCCAAAGCCUCUCCUAUAGCCUGGCUGAGCGAUCUUCUCUGCUGCAGAAAGCAAUUGCCCAAUCUCAGAGUGUCCAGGAAAGCCUGGAGAGCCUGUUGCAGUCUAUUGGGGAAGUUGAACAAAACCUGGAAGGGAAGCAGGUGUCAUCACUCUCAUCAGGAGUCAUCCAGGAAGCCUUAGCCACAAAUAUGAAAUUGAAGCAGGACAUUGCUCGGCAAAAGAGCAGCUUGGAGGCCACCCGUGAGAUGGUGACCCGAUUCAUGGAGACAGCAGACAGUACUACAGCAGCAGUGCUGCAGGGCAAACUGGCAGAGGUGAGCCAGCGGUUCGAACAGCUCUGUCUACAGCAGCAAGAAAAGGAGAGCUCCCUAAAGAAGCUUCUACCCCAGGCAGAGAUGUUUGAACACCUCUCUGGUAAGCUGCAGCAGUUCAUGGAAAACAAAAGUCGGAUGCUGGCCUCUGGAAAUCAGCCAGAUCAAGAUAUUACACAUUUCUUCCAACAGAUCCAGGAGCUCAAUUUGGAAAUGGAAGACCAACAGGAGAACCUAGAUACUCUUGAGCACCUGGUCACUGAACUGAGCUCUUGUGGCUUUGCGCUGGACUUGUGCCAGCAUCAGGACAGGGUACAGAAUCUAAGAAAAGACUUCACAGAGCUACAGAAGACAGUUAAAGAGAGAGAGAAAGAUGCAUCAUCUUGCCAGGAACAGUUGGAUGAAUUCCGGAAGCUGGUCAGGACCUUCCAGAAAUGGUUGAAAGAAACUGAAGGGAGUAUUCCACCUACGGAAACUUCUAUGAGUGCUAAAGAGUUAGAAAAGCAGAUUGAACACCUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-252 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -268.25

Frequency: 0.0000

Diversity: 261.05

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.....((((((((.......................)))))))).)))((((.(((((((((.......((((((.....(((..(.((((((....)))))).)..)))((((.((((((((((.............(((((.........))))).((((((.((((((..(..(((.((((((..(((((.(((.(((........))).(((((....))))).)))..))).))..)))))))))..)..))))))))))))))))))......)))).)))).(((((((........)))))))..)))))).(((((........)))))..(((((((((.((((((((..((.(((......(((.......)))......))).)).....)))))))).)))))))))(((.....)))...)))))))))....((.....))...(((....((((((.(((((((.(((.((((..((((((..(.((..((((((.(..(((..(((((.((((((.........((....((....))....)).........)))))).)))))...)))(((((..((.((((((((((((.(((..((.(((....))).))..))).)....((((((......))).))).))))))))))).)).))))).......).))))))..)).)..))))))..........)))).))).))))))).))))))...)))(..(((....)))..)......(((.(.((((((.((((......)))))))))).).)))(((.............))).............))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((.....(((((((({{.....,,....,.,....,..}))))))).}})(((((((((({{.....}}..{({(((,,,,,(((.,(.((((((....)))))).},.}||,{{{,{{,{||||||,|.,{,.......{{(((,,,,,,,,.},||,(((((((.((((((..(,.(((.((((((..(((((.(((.{{,........,}|.(((((....))))),)))..))).))..)))))))))..),.))))))))))))))),.}}}.,|.,,,}.||,,.({(({((.{..,.,.}}))))),.},)),..(((((...,,,..)))}}..(((((((((.((((((((..,{.{{{......,(({{,,,{|},,...,..))).)).,,..)))))))).))))))))),|{|||||}}}..|||}}}}}|||||,{({,,.......(((.{{{.(((((.{{(({,,.{||,|||}}}|,,|||........,,{{{{|{|...{,,(((((.{((({,.,|||,..|||..,.||,..{||....))}.,.,.,}})))))).}})))}}.{|}||(((.,{({{(((((((((({.(((,.((,(({,,.,)},.}}..)}},)},.,|{,{({......))}.})).))))))))))).,}.)))))...,,,,}})}},}|||}),.,)))))})}}}}}....,|||||,}}.,)))))},)}))))}.,,,}|}}|||}...,}}}}.......(((.(.((((((.((((......)))))))))).).))).{{,....,},,}...,}}||,........,.))))