Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0050100
Sequence Length
2640 nt
GC Content
0.4742
AUGUUUCAGAAAGAACAAGUGGAUCCUCUUCAGAUGAAAUUGCAGCAGGUGAAUGGACUUGGCCAGGGAUUAAUUCAGAGUGCAGGAAAAGACUGUGAUGUACAGGGUUUAGAACAUGACAUGGAAGAGAUCAAUGCUCGAUGGAAUACAUUGAAUAAAAAGGUCGCACAAAGAAUUGCACAGCUACAGGAAGCUUUGUUGCAUUGUGGGAAGUUUCAAGAUGCCUUGGAGCCAUUGCUCAGCUGGUUGGCAGAUACCGAGGAGCUCAUAGCCAAUCAGAAACCUCCAUCUGCUGAGUAUAAAGUGGUGAAAGCACAGAUCCAAGAACAGAAGUUGCUCCAGCGGCUCCUAGAUGAUCGAAAGGCCACAGUAGACAUGCUUCAAGCAGAAGGAGGCAGAAUAGCCCAGUCAGCAGAGCUGGCUGAUAGAGAGAAAAUCACUGGACAGCUGGAGAGUCUUGAAAGUAGAUGGACUGAACUACUCAGUAAGGCAGCAGCCAGGCAAAAACAGCUGGAAGACAUCCUGGUUCUGGCCAAACAGUUCCAUGAGACAGCUGAGCCUAUUUCUGACUUCUUAUCUGUCACAGAGAAAAAGCUUGCUAACUCAGAACCUGUUGGCACUCAGACUGCCAAAAUACAGCAGCAGAUCAUUCGGCACAAGGCUCUGGAAGAAGACAUAGAAAACCAUGCAACAGAUGUGCACCAGGCAGUCAAAAUUGGGCAGUCCCUCUCCUCCCUGACAUCUCCUGCAGAACAGGGUGUGCUGUCAGAAAAGAUAGACUCAUUGCAGGCCCGAUACAGUGAAAUUCAAGACCGCUGUUGUCGGAAGGCAGCCCUACUUGACCAAGCUCUGUCUAAUGCUAGGCUGUUUGGGGAGGAUGAGGUGGAGGUGCUCAACUGGCUGGCUGAGGUUGAGGACAAGCUCAGUUCAGUGUUCGUAAAGGAUUUCAAACAGGAUGUCCUGCACAGGCAGCAUGCUGACCACCUGGCUUUAAAUGAAGAAAUUGUUAAUAGAAAGAAGAAUGUAGAUCAAGCUAUUAAAAAUGGUCAGGCUCUUCUAAAACAAACCACAGGUGAGGAGGUGUUACUUAUCCAGGAAAAACUAGAUGGUAUAAAGACUCGUUACGCAGACAUCACAGUUACUAGCUCCAAGGCCCUCAGAACUUUAGAGCAAGCCCGGCAGCUGGCCACCAAGUUCCAGUCUACUUAUGAGGAACUGACCGGGUGGCUGAGGGAGGUGGAGGAGGAGCUGGCAACCAGUGGAGGACAGUCUCCCACAGGGGAACAGAUACCCCAGUUUCAGCAGAGACAGAAGGAAUUAAAGAAGGAGGUCAUGGAGCACAGGCUGGUGUUGGACACAGUGAAUGAGGUGAGCCGUGCUCUCUUAGAGCUGGUGCCCUGGAGAGCCAGAGAAGGGCUGGAUAAACUUGUGUCCGAUGCUAACGAGCAGUACAAACUAGUCAGUGACACUAUUGGACAAAGGGUGGAUGAAAUUGAUGCUGCUAUUCAGAGAUCACAACAGUAUGAGCAAGCUGCCGAUGCAGAACUAGCUUGGGUUGCUGAAACAAAACGGAAACUGAUGGCUCUGGGUCCAAUUCGCCUGGAACAGGACCAGACCACAGCUCAGCUUCAGGUACAGAAGGCUUUCUCCAUUGACAUUAUUCGACACAAAGAUUCAAUGGAUGAACUCUUCAGUCACCGUAGUGAAAUCUUUGGCACAUGUGGGGAGGAGCAAAAAACUGUAUUACAGGAAAAGACAGAGUCUCUAAUACAGCAAUAUGAAGCCAUUAGCCUACUCAAUUCAGAGCGUUAUGCCCGCCUAGAGCGGGCCCAGGUCUUAGUAAACCAGUUUUGGGAAACUUAUGAAGAGCUCAGCCCCUGGAUUGAGGAAACUCGGGCACUAAUAGCACAGUUACCCUCUCCAGCCAUUGAUCAUGAGCAGCUCAGGCAGCAACAAGAGGAAAUGAGGCAAUUAAGGGAAUCUAUUGCUGAACACAAACCUCAUAUUGACAAACUACUAAAGAUAGGCCCACAACUAAAGGAAUUAAACCCUGAGGAAGGGGAAAUGGUGGAAGAAAAAUACCAGAAAGCAGAAAACAUGUAUGCCCAAAUAAAGGAGGAGGUGCGCCAGCGAGCCCUGGCUCUGGAUGAAGCCGUGUCCCAGUCCACACAGAUUACAGAGUUUCAUGAUAAAAUUGAGCCUAUGUUGGAGACACUGGAGAAUCUUUCCUCUCGCCUGCGUAUGCCACCACUGAUCCCUGCUGAAGUAGACAAGAUCAGAGAGUGCAUCAGUGACAAUAAGAGUGCCACCGUGGAGCUAGAAAAACUGCAGCCAUCCUUUGAGGCCUUGAAGCGCCGUGGAGAGGAGCUUAUUGGACGAUCUCAGGGAGCAGACAAGGAUCUGGCUGCAAAAGAAAUCCAGGAUAAAUUGGAUCAAAUGGUAUUCUUCUGGGAGGACAUCAAAGCUCGGGCUGAAGAACGAGAAAUCAAAUUUCUUGAUGUCCUUGAAUUAGCAGAGAAGUUCUGGUAUGACAUGGCAGCUCUCCUGACCACCAUCAAAGACACCCAGGAUAUUGUCCAUGACUUGGAAAGCCCAGGCAUUGAUCCUUCCAUCAUCAAACAACAGGUUGAAGCUGCUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-798.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -849.24
Frequency: 0.0000
Diversity: 782.28
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((..((((............))))....))))))..((((((.(.....(((((((((..(...((..(((.(((..........))).)))..)))..)))........(((.(((((((.(((((((((((((((.....))))))....((((((..(((.......(((((((((......)))((((((((((((((.....((((.(((.((((((((((....))))..(((((((((..((...(((...))))).)))))))))...(((((.((((((((((((...(((((.........((((.......((.((((((....)))))).))....)))).....))))).......))))))..)))))).))))).......(((((((((((...))))))))............((.((((((((.(((.(((((..((((........(((((.....)))))..(((....)))((((.....((((((.......((.(((..(((......)))..))).))..)))))).)))).)))).))))).))).))))).))).)).......(((((((.........)))))))....((((((............)))).))....))).))))))))).))))....)))).......))))))))))))))))((((.((((......((((((.((((((((((((((.......(((((((....((((...(((((......))))))))).))))))).(((((((((((...........))))).)))))).((((((((......(((........)))........)))))))))))))))).)))).))...)))))))))).)))).((((((((((..((((((.(((((...........(((((.((......)).)))))(((..((((((.((((((((.(((..((((((............(((((((...((..........))...)))))))...((((..(((((((((...((...((.(((((((.(((....((((.(((.((......)).)))))))......))).))))...(((......))).((((((((..(((.(((.........)))...))).)).))))))(((((.((((((..((.......)))))))).....)))))))).))...))...)))))))))....))))((((.(((...))).)))).((((........)))).(((((....)))))........)))))).))).))))....(((....)))(((((((((((((((........(.((((.((((((((.((.((....)).)))))))))......).)))).)....)).)))))))))))))....((((((........((((((..(((((((........))))).))..))))))))))))......................)))).))))))..))).))))))))))).....(((........)))...(((.(((.(((((.(((..(((.....)))..))))))))))))))))))))))))(((((.(((((.(((.((((((((.(((............))))))))))).))).))))).)).)))...)))..))))))((((.((((((((((..(((......))).....((((((.(((((.((((((((((((((((((.((..((.((((....((((.(((.....((..(((..((((.((((((((..((.(((((((...(((....)))...)))....)))).))..)))).((((..((((.((((.(.((.......)).)))))..))))))))(((((.....))).)).)))))))).))))).....))).))))....)))).))..))))))))))........((((..............(((....))).(((....((..(((........))).))....)))...(((((.........)))))....(((...........)))..........))))(((.((........)))))(((((...(((((((..(((...((((......)))))))..))))))).........)))))..)))))))))).))).....))))))))))).))))))).))))..(((((((.(((.((((..(.....)..))))..)).).))))))).....((((((((((...((.(((((((....((((.....(((((.((((((...((((.((.......)).))))...))....))))))))))))).......))))))).))......((((((......))))))....))))))))))(((((((((((((((..((((..(....)..))))............)))))))))).....((.((((.....)))).))...((((((((...(((((..................)))))..))).)))))..........)))))))))))))))))))))..))).....))))))..).))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((((..,,((............}}))}...))))))..((((((,(,..({((((,(({(,.(,..,.,,(((,(((.{,,......})),)}}..,.},.}|||,.,..,||{{,{((((((.(((((((({((((((.....)))))).......{(({{(((.......{((((((((......)))|((((((((({(((.....((((,(((.((((((,,(({..{||||.{((({((((({{...,.(((..,{|,..,))},,}|||...(((((.((((((((((((...(((((.....,...((((.......{(.((((((....)))))).}}....)))).....)))))..},...,)))}}}.}))))).))))),......,},((((((((...))))))))...,.{,.....||.{(({{{{(||{{{{{(({,,{{,{||,,.,,.(((((.....)))))..(((.,..}||{(({.....{{{{{(...,.,.{{|((|,,{{({{{,,,|||{{|,,{||{.,|||,|{||,}.||||{|||,,.,,..,,))).}))}))....}))}|||,,|}}}}}}.,})))))).,,}.|,||||}}.....,}})})}||{.,..,.))).)))))))))|))).....)))),......}))))))))}}))))}{{{(.((({,....,((((((.((((((((((((((,......(((((({....((((..,(((((......))))))))).))))))).(((((((((((...........)))))},))))).{(((((((,{{,..(((........)))....}.,})))))))))))))))).)))).)),..)))))))})),)))|(((((,(((,,..|||,||}|||{|.{{{{{{,,,..((((,((......}},}}}|((((..((((((.((((((((.(((..((((({.........{{.(({{(((...((,,......,,||...}}}}}},..,}||||,,|{||||||...,,...,,...,((((.(((....((({{(((.((......)).)))))))......))).))))...{,{....,,|||.((.,(((((...((((({{........,|...{({{{|{||}|||{{,||,{(({{(,,{{,.,....}.))}}))).)}})))}})))})))...)))})}}))))))),...,,.(((({((....}))})))).((((........)))).(((((....)))))........}))))).))).)))),...{{{....)}|(((((((((((((((...,....(.((((.{(((((({,((.((....)).)))))))))......}.)))).}.,..))}})))))))))))),...(((((({,,,....,((({{..((((,((.....,,.))))}.)),.})))})))))))....................,,)))).))))))..))))),})},|||||{{{{|{{,........,,|...(((.(((.((({(((((..(((.....)))..))))))))))))}},)}}}||}},{{{{{.(((((.{((,((((((((.{{{.,,.......,.))})))))))).))).))))).)).}}}..,)))}.|||,,(((({.{{{((((((((,{,......((({,,,|.|{{,..,{{({{.{|||{||||||||{{{{{.{{.,((.{(((....((((,(((,,.,.{{..,((,,(({{.{{||||||..((.(((({((,..(((....}))...))),,,.)))).))..))))|||||,,|||{.{{{{.{,||.......)).,})))..))))))))}|||,.,,,.}),,)),)))))))).}|},|.....}}}.))})}}..,}},.)),,)))}))))}),,,,,...{{{{...,,,........,......|||,({(....{{..{((........}||..||..,))|...(((({.........}}}}|,...(((.......,,|.|}|{{........},}).,}}|||||,{.,,}}})))})})))}||,,,||}.|||}}.||||}...,.},,,,||..}}}}},}........,},)}}},)))))))))).))),,,..,,})))))))).))))))).})))}.({((((((,((.((({..|,,....,,)))).,,).).))))))).....{(((((((((...{{.,{{{{{,....,((({((({((((({{{{{(({{{({((,((...,,,.}}.})))...)).,,.}})))))),,}.,..}})},},))))))))......((((((......))))))....}))))))))}{(((((((({(((((.{(({(,,(,...}..}|||,,,,....,,}})))))})))}|,...{(.(((({...})))).)}...||{|||{{,,,|{|||.,,....,,,..,....,}))}},,}})|}}}}}..,|||..,,}))})))}))))))))))))},.||,..,..,,)})),},.))))))..
Back