Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MACF1_0058600

Sequence Length

891 nt

GC Content

0.4680

GAAAAGACAGAGUCUCUAAUACAGCAAUAUGAAGCCAUUAGCCUACUCAAUUCAGAGCGUUAUGCCCGCCUAGAGCGGGCCCAGGUCUUAGUAAACCAGUUUUGGGAAACUUAUGAAGAGCUCAGCCCCUGGAUUGAGGAAACUCGGGCACUAAUAGCACAGUUACCCUCUCCAGCCAUUGAUCAUGAGCAGCUCAGGCAGCAACAAGAGGAAAUGAGGCAAUUAAGGGAAUCUAUUGCUGAACACAAACCUCAUAUUGACAAACUACUAAAGAUAGGCCCACAACUAAAGGAAUUAAACCCUGAGGAAGGGGAAAUGGUGGAAGAAAAAUACCAGAAAGCAGAAAACAUGUAUGCCCAAAUAAAGGAGGAGGUGCGCCAGCGAGCCCUGGCUCUGGAUGAAGCCGUGUCCCAGUCCACACAGAUUACAGAGUUUCAUGAUAAAAUUGAGCCUAUGUUGGAGACACUGGAGAAUCUUUCCUCUCGCCUGCGUAUGCCACCACUGAUCCCUGCUGAAGUAGACAAGAUCAGAGAGUGCAUCAGUGACAAUAAGAGUGCCACCGUGGAGCUAGAAAAACUGCAGCCAUCCUUUGAGGCCUUGAAGCGCCGUGGAGAGGAGCUUAUUGGACGAUCUCAGGGAGCAGACAAGGAUCUGGCUGCAAAAGAAAUCCAGGAUAAAUUGGAUCAAAUGGUAUUCUUCUGGGAGGACAUCAAAGCUCGGGCUGAAGAACGAGAAAUCAAAUUUCUUGAUGUCCUUGAAUUAGCAGAGAAGUUCUGGUAUGACAUGGCAGCUCUCCUGACCACCAUCAAAGACACCCAGGAUAUUGUCCAUGACUUGGAAAGCCCAGGCAUUGAUCCUUCCAUCAUCAAACAACAGGUUGAAGCUGCUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-243.7 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -259.6

Frequency: 0.0000

Diversity: 188.87

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((.(((((.((((((((((((((((((.((..((.((((....((((.(((.....((..(((..((((.((((((((..((.(((((((...(((....)))...)))....)))).))..)))).((((..((((.((((.(.((.......)).)))))..))))))))(((((.....))).)).)))))))).))))).....))).))))....)))).))..))))))))))........((((..............(((....))).(((....((..(((........))).))....)))...(((((.........)))))....(((...........)))..........))))(((.((........)))))(((((...(((((((..(((...((((......)))))))..))))))).........)))))..)))))))))).))).....))))))(((..((..((....(((..(((((((.(((.((((..(.....)..))))..)).).))))))).....((((((((((...((.(((((((....((((.....(((((.((((((...((((.((.......)).))))...))....))))))))))))).......))))))).))......((((((......))))))....)))))))))).((((((((..((((.(((.(((((......((((((((...)))))))).((((.((((.((((.((((..(((.((......)).)))..)))).))))......)))).)))).(((((.(((.....))).)))))..))))).))).)))))))))))).............)))....)).)).)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((((((.(((((((((,((((((((.((..((.{(((....((((.(((.....{{..(((..((((.((((((((..((.(((({((,..(((....}))...))),,,.)))).))..)))),((((..((((.((((.{.((.......)).)))))..))))))))|{(((.....))).}}.)))))))).)))}}.....))).))))....}))}.))..))))))))))........,,{{...,|}..............,|||{({(....,,..{((........}||,.|{,..|||,.,(((({.........|}|||,,..{{{.......,||.|,|({........},}},{|}||{{{{{...,,,))|||||}}}{|{{{||,,|{|,,,,{||,.....)}}}}}}..)))))})........,),)))}})))))))))).))).....))))))(((..((..((....(((..((((((({,((.((((..|.....,..)))).,,).).))))))).....((((((((((...{{.,,,,,,,....,((({(({{((((({{{{{(({,,({((.((....,,.}}.})))...)).,..}})))))),}).,..,}}},}})))))}))......((((((......))))))....)))))))))).((((((((..((((.(((.(((((......((((((((...)))))))),((((,({(,..((.(((({..,|}}||.}},..,,{|||{{.,,}.))).},,...))},.}}},.,||||}|}}..{{{{.....)))}.))))).))).)))))))))))).............)))....)).)).)))