Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MBOAT2_0003300

Sequence Length

808 nt

GC Content

0.4109

GUCAACUUUGUAGUGUGCCAACUCUUUGCCUUGCUAGCAGCCAUUUGGUUUCGAACUUAUCUACAUUCAAGCAAAACUAGCUCUUUUAUAAGACAUGUAGUUGCUACCCUUUUGGGCCUUUAUCUUGCACUUUUUUGCUUUGGAUGGUAUGCCUUACACUUUCUUGUACAAAGUGGAAUUUCCUACUGUAUCAUGAUCAUCAUAGGAGUGGAGAACAUGCACAAUUACUGCUUUGUGUUUGCUCUGGGAUACCUCACAGUGUGCCAAGUUACUCGAGUCUAUAUCUUUGACUAUGGACAAUAUUCUGCUGAUUUUUCAGGCCCAAUGAUGAUCAUUACUCAGAAGAUCACUAGUUUGGCUUGCGAAAUUCAUGAUGGGAUGUUUCGGAAGGAUGAAGAACUGACUUCCUCACAGAGGGAUUUAGCUGUAAGGCGCAUGCCAAGCUUACUGGAGUAUUUGAGUUACAACUGUAACUUCAUGGGGAUCCUGGCAGGCCCACUUUGCUCUUACAAAGACUACAUUACUUUCAUUGAAGGCAGAUCAUACCAUAUCACACAAUCUGGUGAAAAUGGAAAAGAAGAGACACAGUAUGAAAGAACAGAGCCAUCUCCAAAUACUGCGGUUGUUCAGAAGCUCUUAGUUUGUGGGCUGUCCUUGUUAUUUCACUUGACCAUCUGUACAACAUUACCUGUGGAGUACAACAUUGAUGAGCAUUUUCAAGCUACAGCUUCGUGGCCAACAAAGAUUAUCUAUCUGUAUAUCUCUCUUUUGGCUGCCAGACCCAAAUACUAUUUUGCAUGGACGCUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-208.3 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -222.61

Frequency: 0.0000

Diversity: 124.33

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(.......).((((((.(((..((((((((((.(.((((.(((((.(((((((..............(((((.(((((((.((((((((((((..(((((..((((((.(((.((((...................)))).))).)))).)).)))))...)))))))...(((((......)))))(((..(((((((((((.((.((((((..((.((((((........)))))).))))))((.((((......)))).))...........(((((((........))))))).........((((....)))))))).))))))))))))))...)))))...))))))).))))))))))))...)))))..))))..).)))).)))))).((((.((((((...)))))).))))......(((....)))..((.......((((((((((((((....)))))))....(((...(((((((.((...(((((.(((.(((.((...........)).))))))))))).....((((.((((........))))..))))((((((.(((((.((((((...(((.........)))....)))))).)((((.(((((((((..(((((((...((((((..(((((((((((........................))))))))..)))..))).))).....))))))).)))))).))).))))..((((.....)))).....))))))))))))))))))).)))))))))).....)).))))))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

(.......}.((((((.(({..((((((((((.(.((((.((((({(((((((..............(((((.{((((((.((((((((((((..(((((..{{,,(({....|||{..,{((((.(({......}))...)))))),,.)),)))))...))))))}...(((((......)))))({{..(((((((((((.((.((,(((,.((.((((((........)))))).))}))|((.((((......)))).)),..........(((((((.....,,.))))))).........((((....))))}))).)))))))))))})}..,)))))...))))))}.))))))))))}}}}.)))))..))))..).)))).)))))).((((.((((((...)))))).))))..,,..(((....)))..{{,,....,{(({{{{(((((((....))))))),...(((.,.(((((({,((...(((((.(((.(((.((...........)).))))))))))).....((((.((((.{....,}))))..))))((((({{(((((.((((((...,({...,,....)))....)))))).)((((.(((((((((..(((((((...((((((..(((((((((((..,.......,,............)))))))}.,)))..))).))).....))))))).)))))).))).))))..((((.....)))).....))))))))))))))))))),)))}}}}}}}.....},.})))))))).