Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MGA_0001100

Sequence Length

1131 nt

GC Content

0.4226

GAUGGGAAGGCCAUUGUGACUAUGUGGUGAUUACAGUUGUCUUACUACUGAGUUUCCUACUGAAAUCAUGGAGGAGAAACAGCAGAUUAUAUUGGCUAAUCAAGAUGGUGGAACAGUGGCAGGAGCAGCACCUACCUUCUUUGUCAUCUUAAAGCAGCCAGGAAAUGGCAAAACUGAUCAAGGAAUUUUGGUUACUAAUCAGGAUGCCUGUGCUUUGGCUAGUAGUGUGUCAUCACCAGUAAAAUCUAAAGGGAAGAUUUGCCUUCCAGCUGAUUGUACUGUGGGUGGAAUCACUGUUACCCUCGAUAACAAUAGUAUGUGGAAUGAGUUCUAUCAUCGAAGCACAGAGAUGAUUCUGACCAAGCAAGGAAGACGCAUGUUUCCUUACUGUCGUUAUUGGAUAACAGGUUUAGAUUCAAAUUUGAAGUAUAUUCUUGUCAUGGAUAUAUCUCCUGUGGAUAACCAUCGUUAUAAGUGGAAUGGUCGUUGGUGGGAACCUAGUGGGAAGGCUGAACCUCAUGUUUUGGGGAGGGUUUUCAUUCAUCCAGAAUCUCCUUCCACAGGUCAUUAUUGGAUGCAUCAACCAGUAUCUUUCUAUAAACUCAAACUUACCAACAAUACACUGGACCAAGAAGGGCAUAUCAUCUUGCACUCUAUGCAUCGUUACCUGCCGAGGCUUCAUUUGGUGCCUGCAGAAAAGGCUGUGGAGGUGAUACAAUUAAAUGGCCCUGGUGUCCACACUUUUACCUUCCCACAGACUGAAUUCUUUGCAGUAACAGCUUAUCAGAACAUUCAGAUUACUCAGCUGAAAAUAGAUUACAAUCCAUUUGCCAAAGGCUUUCGGGAUGAUGGGCUGAAUAAUAAGCCCCAGAGAGAUGGAAAACAAAAGAACAGCUCUGACCAAGAAGGGAAUAAUAUUUCCAGUUCUUCUGGUCAUCGGGUCCGUCUUACAGAAGGUCAGGGGUCAGAGAUACAACCAGGUGAUUUGGAUCCUUUGUCAAGGGGUCAUGAAACAUCAGGCAAGGGUUUGGAGAAGACUUCCCUUAAUAUAAAACGAGACUUUCUUGGUUUCAUGGAUACUGAUUCAGCACUUAGUGAAGUUCCUCAAUUGAAGCAAGAGAUUUCUGAAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-300.4 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -325.65

Frequency: 0.0000

Diversity: 392.78

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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