Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_NF1_0014800

Sequence Length

297 nt

GC Content

0.4242

AAGUUAUUUCUGGACAGUCUACGAAAAGCUCUUGCUGGCCAUGGAGGAAGUAGGCAGCUGACAGAAAGUGCUGCAAUUGCCUGUGUCAAACUGUGUAAAGCAAGUACUUACAUCAAUUGGGAAGAUAACUCUGUCAUUUUCCUACUUGUUCAGUCCAUGGUGGUUGAUCUUAAGAACCUGCUUUUUAAUCCAAGUAAGCCAUUCUCAAGAGGCAGUCAGCCUGCAGAUGUGGAUCUAAUGAUUGACUGCCUUGUUUCUUGCUUUCGUAUAAGCCCUCACAACAACCAACACUUUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-74 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -81.06

Frequency: 0.0000

Diversity: 35.69

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(.(((.((((((((...)))).))))))))((((...(((((((((.(((((((.((.((((((((((((((((..(((((.((.....)).).)))).)).))))))).((.....))..........))))))).)).))))))).)....))))))))(((((.((((.((((...((((............))))..)))).))))(((((((((.(...((((....))))...).)))))))))((((.....((((......))))....))))))))).......))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

{{(((.((((((((...)))).))))))))((((.,{(((((((({.(((((((.({.((((((((((((((((..(((((.((.....)).).)))).)),})))))).,,,,...,,..........))))))).}}.))))))).}....))))))))(((((.{(((.((((...((((.,,......}}.))))..)))).)))|(((((((((.{...((((....))))...).)))))))))|(((.....((((......))))....))),)))))....,..))))