Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NF1_0015000
Sequence Length
753 nt
GC Content
0.4276
AAGUUAUUUCUGGACAGUCUACGAAAAGCUCUUGCUGGCCAUGGAGGAAGUAGGCAGCUGACAGAAAGUGCUGCAAUUGCCUGUGUCAAACUGUGUAAAGCAAGUACUUACAUCAAUUGGGAAGAUAACUCUGUCAUUUUCCUACUUGUUCAGUCCAUGGUGGUUGAUCUUAAGAACCUGCUUUUUAAUCCAAGUAAGCCAUUCUCAAGAGGCAGUCAGCCUGCAGAUGUGGAUCUAAUGAUUGACUGCCUUGUUUCUUGCUUUCGUAUAAGCCCUCACAACAACCAACACUUUAAGAUCUGCCUGGCUCAGAAUUCACCUUCUACAUUUCACUAUGUGCUGGUAAAUUCACUCCAUCGAAUCAUCACCAAUUCCGCAUUGGAUUGGUGGCCUAAGAUUGAUGCUGUGUAUUGUCACUCGGUUGAACUUCGAAAUAUGUUUGGUGAAACACUUCAUAAAGCAGUGCAAGGUUGUGGAGCACACCCAGCAAUACGAAUGGCACCGAGUCUUACAUUUAAAGAAAAAGUAACAAGCCUUAAAUUUAAAGAAAAACCUACAGACCUGGAGACAAGAAGCUAUAAGUAUCUUCUCUUGUCCAUGGUGAAACUAAUUCAUGCAGAUCCAAAGCUCUUGCUUUGUAAUCCAAGAAAACAGGGGCCCGAAACCCAAGGCAGUACAGCAGAAUUAAUUACAGGGCUCGUCCAACUGGUCCCUCAGUCACACAUGCCAGAGAUUGCUCAGGAAGCAAUGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-193.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -211.21
Frequency: 0.0000
Diversity: 130.12
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((.(((((((.((((((......(((....))).(((((((((.(((((((.((.((((((((((((((((..(((((.((.....)).).)))).)).))))))).((.....))..........))))))).)).))))))).)....))))))))(((.(((((((((....(((((........)))))............(((((((((((.(...((((....))))...).))))))))))).......((((......))))..................))))))))).)))((((...(((((.(((..(.((((......)))))..))).)))))...............(((((((((......)))))))))((((..(((((((.(((((((((((((((((((.(...((((.....(((((.(((((....))))).))))).(((..(((.(((...))))))..)))...))))...))))))))......((((((....(((........)))...)))))).............(((((((.(..(((((.((....)).)))))..).)))).)))........(((.((..(((.((((((....))))))..))))).)))....(((........)))..))))))))).))).)))))))...))))..((...(((((....)))))...))..)))).)))))).)))))))..)))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(({.(((((((.((((((......(((....))).(((((((({.(((((((.({.((((((((((((((((..(((((.((.....)).).)))).)),})))))).,,,,...,,..........))))))).}}.))))))).}....))))))))(((.(((((((((,,...((((.,,.....,}},)})}..,,,....{((((((((((.{...((((....))))...).))))))))))|{{.....((((......))))......,.,.........,}))))))).)))((({...(((((.(((..,,((((......)))))..))).)))))...},,.........((((((((({.....))))))))){(((..(((((({.(((((((((((((((((({,(...((((.....(((({,((({,...,|||||.}}}|,.,{{..{{|||||,,,}})))).,)))...))))...)))))))).{{,,.((({{,....|,|,.......,}}...},},}},......,....,(({,((({(..(((,({(...,}).,)))))}},}))},.))),,......|||.{{..(({.((((((....))))))..})),,.,,.....(((........)))..))))))))},))).}))))))..,))}}..{{...(((({....,))))...,,..)))}})))))).)))))))..}})....
Back